不同密度水凝膠支架中三維軟骨細(xì)胞基因表達(dá)差異的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-04 14:31
目的探究軟骨細(xì)胞-海藻酸鈉凝膠構(gòu)建體中軟骨細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組水平的變化。方法將軟骨細(xì)胞分別封裝在0.8%和4%海藻酸鈉溶液制成的水凝膠中,制成細(xì)胞-凝膠構(gòu)建體并培養(yǎng)一段時(shí)間。對(duì)兩種凝膠材料的交聯(lián)密度、溶脹率、模量等物理性能進(jìn)行表征,然后通過(guò)RNA測(cè)序技術(shù)從這兩種培養(yǎng)條件中檢測(cè)到軟骨細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的差異并進(jìn)行比對(duì)和分析。最后,通過(guò)q PCR和免疫組織化學(xué)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果我們發(fā)現(xiàn),與4%構(gòu)建體相比,0.8%構(gòu)建體具有較低的交聯(lián)密度、較高的溶脹率以及較高的營(yíng)養(yǎng)交換滲透性。通過(guò)RNA測(cè)序從這兩種培養(yǎng)條件中檢測(cè)到軟骨細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的差異,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因(DEGs)反映在細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)分泌、細(xì)胞周期、細(xì)胞增殖、軟骨發(fā)育等方面。值得注意的是,與軟骨ECM和細(xì)胞增殖相關(guān)的DEGs的表達(dá)在0.8%構(gòu)建體中上調(diào),而參與細(xì)胞周期和基質(zhì)降解的DEGs的表達(dá)在4%構(gòu)建體中上調(diào);在0.8%構(gòu)建體中,軟骨細(xì)胞肥大標(biāo)志物的基因表達(dá)上調(diào),而4%構(gòu)建體似乎有利于軟骨細(xì)胞表型的長(zhǎng)期維持。此外,軟骨細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組水平也受到構(gòu)建體培養(yǎng)時(shí)間長(zhǎng)短的顯著影響。這些結(jié)果也通過(guò)了q PCR和免疫組織化學(xué)驗(yàn)證。結(jié)論在軟骨組織工程中,不同密...
【文章來(lái)源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:50 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1兩種凝膠構(gòu)建體(0.8%,4%)的結(jié)構(gòu)示意圖
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文10第三章結(jié)果3.1水凝膠的物理性質(zhì)對(duì)兩種水凝膠的物理性質(zhì)(包括溶脹能力、交聯(lián)密度、凝膠內(nèi)部大分子的擴(kuò)散能力、凝膠內(nèi)部大分子的釋放能力、彈性模量以及封裝的細(xì)胞在凝膠內(nèi)部的分布)進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果如圖3.1所示。相對(duì)于0.8%凝膠,4%凝膠的溶脹率從285.8±18.39降至123.2±7.317(圖3.1A),同時(shí),交聯(lián)密度從0.3478±0.03515增至1.421±0.1794mol/m3(圖3.1B)。0.8%凝膠和4%凝膠的有效擴(kuò)散系數(shù)(De)分別為9.062±0.125×10-7cm2/s和4.328±0.3608×10-7cm2/s(圖3.1C)。圖3.1D顯示了兩種凝膠中BSA累計(jì)釋放率隨時(shí)間變化的曲線。當(dāng)累積釋放低于60%時(shí),繪制的BSA釋放值與時(shí)間平方根的關(guān)系圖如圖3.1E所示。良好的線性相關(guān)性(R2>0.97)表明BSA的釋放受菲克擴(kuò)散控制。0.8%凝膠和4%凝膠的壓縮模量分別為2.355kPa和23.450kPa(圖3.1F)。如圖3.1G所示,包裹的軟骨細(xì)胞均勻分布于0.8%和4%的凝膠中。圖3.1兩種水凝膠(0.8%,4%)的物理性質(zhì)
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文12黏著斑激酶相關(guān)途徑,等等。圖3.2凝膠構(gòu)建體調(diào)控下第7天的基因表達(dá)注:(A)兩種構(gòu)建體中表示的差異表達(dá)數(shù)。(B)在第7天兩種構(gòu)建體DEGs的火山圖。(C)在第7天兩種構(gòu)建體DEGs的熱圖。(D)第7天0.8%構(gòu)建體的上調(diào)基因的GO富集分析。(E)第7天0.8%構(gòu)建體的上調(diào)基因的KEGG通路分析。
本文編號(hào):3063384
【文章來(lái)源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:50 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1兩種凝膠構(gòu)建體(0.8%,4%)的結(jié)構(gòu)示意圖
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文10第三章結(jié)果3.1水凝膠的物理性質(zhì)對(duì)兩種水凝膠的物理性質(zhì)(包括溶脹能力、交聯(lián)密度、凝膠內(nèi)部大分子的擴(kuò)散能力、凝膠內(nèi)部大分子的釋放能力、彈性模量以及封裝的細(xì)胞在凝膠內(nèi)部的分布)進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果如圖3.1所示。相對(duì)于0.8%凝膠,4%凝膠的溶脹率從285.8±18.39降至123.2±7.317(圖3.1A),同時(shí),交聯(lián)密度從0.3478±0.03515增至1.421±0.1794mol/m3(圖3.1B)。0.8%凝膠和4%凝膠的有效擴(kuò)散系數(shù)(De)分別為9.062±0.125×10-7cm2/s和4.328±0.3608×10-7cm2/s(圖3.1C)。圖3.1D顯示了兩種凝膠中BSA累計(jì)釋放率隨時(shí)間變化的曲線。當(dāng)累積釋放低于60%時(shí),繪制的BSA釋放值與時(shí)間平方根的關(guān)系圖如圖3.1E所示。良好的線性相關(guān)性(R2>0.97)表明BSA的釋放受菲克擴(kuò)散控制。0.8%凝膠和4%凝膠的壓縮模量分別為2.355kPa和23.450kPa(圖3.1F)。如圖3.1G所示,包裹的軟骨細(xì)胞均勻分布于0.8%和4%的凝膠中。圖3.1兩種水凝膠(0.8%,4%)的物理性質(zhì)
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文12黏著斑激酶相關(guān)途徑,等等。圖3.2凝膠構(gòu)建體調(diào)控下第7天的基因表達(dá)注:(A)兩種構(gòu)建體中表示的差異表達(dá)數(shù)。(B)在第7天兩種構(gòu)建體DEGs的火山圖。(C)在第7天兩種構(gòu)建體DEGs的熱圖。(D)第7天0.8%構(gòu)建體的上調(diào)基因的GO富集分析。(E)第7天0.8%構(gòu)建體的上調(diào)基因的KEGG通路分析。
本文編號(hào):3063384
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