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白樺BpbZIP1基因的克隆及其功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-03 11:52
  bZIP轉(zhuǎn)錄因子(basic-region leucine zipper)一種堿性亮氨酸拉鏈轉(zhuǎn)錄因子,bZIP家族屬于最大的轉(zhuǎn)錄家族之一,其具有多種生物學(xué)功能,包括調(diào)控非生物脅迫反應(yīng)。為鑒定白樺(Betula platyphylla Suk)抗非生物脅迫的bZIP基因,本研究利用生物信息學(xué)分析、表達(dá)模式分析及轉(zhuǎn)基因功能分析等方法分析BpbZIP1的耐鹽性,獲得如下結(jié)果:進(jìn)行抗性相關(guān)基因系統(tǒng)進(jìn)化分析,結(jié)果顯示BpbZIP1與擬南芥抗性相關(guān)基因蛋白聚為一組。利用實(shí)時(shí)定量熒光法分析BpbZIP1基因和抗性相關(guān)的SOD、POD基因鹽、旱脅迫梯度時(shí)間下的表達(dá)量,結(jié)果顯示BpbZIP1基因與SOD、POD基因表達(dá)模式相似,受NaC1處理的誘導(dǎo),在甘露醇處理下,表達(dá)變化不明顯。利用基因槍介導(dǎo)的瞬時(shí)轉(zhuǎn)化法將BpbZIP1-PBI121-GFP融合表達(dá)載體轉(zhuǎn)化洋蔥表皮細(xì)胞進(jìn)行亞細(xì)胞定位,結(jié)果表明BpbZIP1基因定位在細(xì)胞核上。將BpbZIP1基因過(guò)表達(dá)載體轉(zhuǎn)入擬南芥中,鹽、旱脅迫處理轉(zhuǎn)基因材料后進(jìn)行組織化學(xué)染色(NBT、DAB、Evans Blue)。轉(zhuǎn)基因株系在NaCl脅迫條件下,清除活性氧的能力較... 

【文章來(lái)源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

白樺BpbZIP1基因的克隆及其功能分析


圖2-1野生型白樺RNA檢測(cè)電泳圖??

電泳圖,基因,電泳圖,白樺


v.2.0網(wǎng)站??(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0)對(duì)?基因跨膜域進(jìn)行預(yù)測(cè)。??2.3結(jié)果分析??2.3.1白樺柳基因的鑒定與克隆??閱讀大量抗性相關(guān)bZIP家族文獻(xiàn)后得到擬南芥中抗性相關(guān)基因,在白樺數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)??行同源比對(duì),得到相似度極高的白樺5P020M3.2基因。通過(guò)NCBI網(wǎng)站中blastX程序?qū)??該基因序列進(jìn)行比對(duì)分析,確定了該基因含有完整的開(kāi)放讀碼框(0RF),功能注釋為??6Z/尸基因。利用RT-PCR對(duì)其進(jìn)行克。▓D2-2),測(cè)序成功,命名為辦6Z/P7。?? ̄lSs??28s??圖2-1野生型白樺RNA檢測(cè)電泳圖??2000bp??1259bp??lOOObp??500bp??250bp??200b?p??圖2-2?PCR擴(kuò)增5沖Z/Pi基因檢測(cè)電泳圖??(maker:?DNA?Marker?DL2000?)??-12-??

基因,擬南芥,白樺,保守區(qū)


?2白樺母基因克隆與生物信息學(xué)分析???2.3.2白樺聊27P7基因的生物信息學(xué)分析??1.白樺辦6ZJPi基因序列分析??在NCBI網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫(kù)中,其保守區(qū)進(jìn)行預(yù)測(cè)(圖2-3)并繪制出白樺辦6Z/W基因??的開(kāi)放閱讀框,利用軟件BioEdit翻譯出蛋白序列。并對(duì)其保守區(qū)進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示其??含有bZIP蛋白保守區(qū)(圖2-3).??辦6Z/W基因閱讀框?yàn)椋,起始在ATG,終止在TGA,總共編碼485個(gè)氨基酸殘基,??其氨基酸序列如下:??MNLKNFGTDPPGDGNGRPPGNFPLIRQSSIYSLTFDELQNTMGGSIGKDFGSMNMDEL??LKMWSAEDAQSIMAKPSWTTGPEGTVPPGGYLQRQGSLTLPRTLSQKTVDEVWRDIS??QDGAGNGSSSLPQRQHTLGEMTLEEFLFRAGVVREDTQLDAKPAGGSASTGGFLGNT??GLGIGFQQTGGGTGLMGNRIAESNNQFSIQSSNLPLNVNGVRSDQTQLSRPQQPQIFPK??PVTMAYGTHQMPQLGSPGMRGGIVGIGDQGLSSGLIQSAALQGGGMGMVGLGAGAG??AGGVSVGTGSPANQLSSDGLGKSNGDMSSVSPVPYAFNGGLRGRRSGGPVEKVVERR??QRRMIKNRESAARSRARKQAYTMELEAEVAKLKEDNEELQKKQEEIMEMQKNQVLEI??MNLQRGVKKQCLRKTLSGPW*??1?55*?C6#?rt<??H72??coll??Wifi?binding??Specific?hits

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]鹽脅迫對(duì)歐洲赤松光合作用的影響及耐鹽性評(píng)價(jià)[D]. 方連玉.東北林業(yè)大學(xué) 2011



本文編號(hào):3061217

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