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白樺BpbZIP1基因的克隆及其功能分析

發(fā)布時間:2021-03-03 11:52
  bZIP轉錄因子(basic-region leucine zipper)一種堿性亮氨酸拉鏈轉錄因子,bZIP家族屬于最大的轉錄家族之一,其具有多種生物學功能,包括調(diào)控非生物脅迫反應。為鑒定白樺(Betula platyphylla Suk)抗非生物脅迫的bZIP基因,本研究利用生物信息學分析、表達模式分析及轉基因功能分析等方法分析BpbZIP1的耐鹽性,獲得如下結果:進行抗性相關基因系統(tǒng)進化分析,結果顯示BpbZIP1與擬南芥抗性相關基因蛋白聚為一組。利用實時定量熒光法分析BpbZIP1基因和抗性相關的SOD、POD基因鹽、旱脅迫梯度時間下的表達量,結果顯示BpbZIP1基因與SOD、POD基因表達模式相似,受NaC1處理的誘導,在甘露醇處理下,表達變化不明顯。利用基因槍介導的瞬時轉化法將BpbZIP1-PBI121-GFP融合表達載體轉化洋蔥表皮細胞進行亞細胞定位,結果表明BpbZIP1基因定位在細胞核上。將BpbZIP1基因過表達載體轉入擬南芥中,鹽、旱脅迫處理轉基因材料后進行組織化學染色(NBT、DAB、Evans Blue)。轉基因株系在NaCl脅迫條件下,清除活性氧的能力較... 

【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:68 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

白樺BpbZIP1基因的克隆及其功能分析


圖2-1野生型白樺RNA檢測電泳圖??

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v.2.0網(wǎng)站??(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0)對?基因跨膜域進行預測。??2.3結果分析??2.3.1白樺柳基因的鑒定與克隆??閱讀大量抗性相關bZIP家族文獻后得到擬南芥中抗性相關基因,在白樺數(shù)據(jù)庫中進??行同源比對,得到相似度極高的白樺5P020M3.2基因。通過NCBI網(wǎng)站中blastX程序對??該基因序列進行比對分析,確定了該基因含有完整的開放讀碼框(0RF),功能注釋為??6Z/尸基因。利用RT-PCR對其進行克隆(圖2-2),測序成功,命名為辦6Z/P7。?? ̄lSs??28s??圖2-1野生型白樺RNA檢測電泳圖??2000bp??1259bp??lOOObp??500bp??250bp??200b?p??圖2-2?PCR擴增5沖Z/Pi基因檢測電泳圖??(maker:?DNA?Marker?DL2000?)??-12-??

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?2白樺母基因克隆與生物信息學分析???2.3.2白樺聊27P7基因的生物信息學分析??1.白樺辦6ZJPi基因序列分析??在NCBI網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫中,其保守區(qū)進行預測(圖2-3)并繪制出白樺辦6Z/W基因??的開放閱讀框,利用軟件BioEdit翻譯出蛋白序列。并對其保守區(qū)進行預測,結果顯示其??含有bZIP蛋白保守區(qū)(圖2-3).??辦6Z/W基因閱讀框為+1,起始在ATG,終止在TGA,總共編碼485個氨基酸殘基,??其氨基酸序列如下:??MNLKNFGTDPPGDGNGRPPGNFPLIRQSSIYSLTFDELQNTMGGSIGKDFGSMNMDEL??LKMWSAEDAQSIMAKPSWTTGPEGTVPPGGYLQRQGSLTLPRTLSQKTVDEVWRDIS??QDGAGNGSSSLPQRQHTLGEMTLEEFLFRAGVVREDTQLDAKPAGGSASTGGFLGNT??GLGIGFQQTGGGTGLMGNRIAESNNQFSIQSSNLPLNVNGVRSDQTQLSRPQQPQIFPK??PVTMAYGTHQMPQLGSPGMRGGIVGIGDQGLSSGLIQSAALQGGGMGMVGLGAGAG??AGGVSVGTGSPANQLSSDGLGKSNGDMSSVSPVPYAFNGGLRGRRSGGPVEKVVERR??QRRMIKNRESAARSRARKQAYTMELEAEVAKLKEDNEELQKKQEEIMEMQKNQVLEI??MNLQRGVKKQCLRKTLSGPW*??1?55*?C6#?rt<??H72??coll??Wifi?binding??Specific?hits

【參考文獻】:
期刊論文
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[2]HbCoi1基因啟動子酵母單雜pHIS載體的構建及互作蛋白篩選[J]. 洪灝,劉小婷,肖華,黃惜,袁紅梅.  熱帶生物學報. 2015(03)
[3]干旱脅迫抑制作物光合作用機理研究進展[J]. 汪本福,黃金鵬,楊曉龍,程建平,趙鋒,陳少愚.  湖北農(nóng)業(yè)科學. 2014(23)
[4]我國干旱區(qū)植物抗旱機理研究進展[J]. 李磊,賈志清,朱雅娟,綦艷林.  中國沙漠. 2010(05)
[5]鹽脅迫對水稻幼苗的影響研究——鹽脅迫對水稻幼苗期根系的影響[J]. 姜秀娟,張素紅,苗立新,佟彤,劉忠卓,隋亞云.  北方水稻. 2010(01)
[6]植物抗旱機理及相關基因研究進展[J]. 徐云剛,詹亞光.  生物技術通報. 2009(02)
[7]干旱脅迫對柑橘葉片保護酶系統(tǒng)的影響[J]. 鄧勝興,曾明,熊偉,羅光杰,張廣越,劉平.  西南大學學報(自然科學版). 2009(02)
[8]水分脅迫處理對青花菜幼苗葉片生理生化特性的影響[J]. 馬虹霞,郁繼華,頡建明,張國斌,聶書明.  甘肅農(nóng)業(yè)大學學報. 2009(01)
[9]擬南芥bZIP基因家族系統(tǒng)發(fā)育樹比較分析[J]. 蔣瑤,胡尚連,孫霞,黃勝雄.  華北農(nóng)學報. 2008(01)
[10]干旱脅迫下光合作用的氣孔與非氣孔限制[J]. 姚慶群,謝貴水.  熱帶農(nóng)業(yè)科學. 2005(04)

博士論文
[1]鹽脅迫對歐洲赤松光合作用的影響及耐鹽性評價[D]. 方連玉.東北林業(yè)大學 2011



本文編號:3061217

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