β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因的克隆表達(dá)及其合成氨基寡糖技術(shù)研究
發(fā)布時間:2021-03-02 19:24
以幾丁寡糖為代表的氨基寡糖具有豐富的生物活性,被應(yīng)用于食品、醫(yī)藥和農(nóng)業(yè)等多個領(lǐng)域。幾丁寡糖的傳統(tǒng)制造工藝主要借助于化學(xué)法、物理法和酶法降解幾丁質(zhì),但傳統(tǒng)制備方法存在以下瓶頸問題:(1)幾丁質(zhì)制備中脫鹽、脫蛋白環(huán)節(jié)需要引入大量強酸、強堿,后處理的環(huán)保壓力巨大;(2)水解法制備所得幾丁寡糖產(chǎn)物聚合度不可控、目前規(guī);a(chǎn)只能得到幾丁二糖。針對上述問題,本研究旨在發(fā)掘具有逆水解/轉(zhuǎn)糖苷潛力的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶,以N-乙酰氨基葡萄糖為原料酶法逆向合成氨基寡糖,從而實現(xiàn)氨基寡糖的酶法綠色生物制造。首先,從基因組數(shù)據(jù)庫中篩選得到了 3個細(xì)菌(Bacillus amyloliquefaciens、Enterococcus faecalis和Lactobacillus casei)來源的潛在β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因BaNagase、EfNagase和LcNagase。通過序列進化分析確定BaNagase歸屬于糖苷水解酶3家族,EfNagase和LcNagase均屬于糖苷水解酶20家族。從微生物基因組DNA中克隆得到目的基因,并通過大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)成功異源重組表達(dá)、純化得到以上3種重組酶,...
【文章來源】:華東理工大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.3幾丁質(zhì)在真菌和昆蟲中的合成途徑??Fig?1.3?The?chitin?synthesis?pathway?in?fungi?and?insects??(2)糖苷水解酶??
葡萄糖胺?e°A??圖1.3幾丁質(zhì)在真菌和昆蟲中的合成途徑??Fig?1.3?The?chitin?synthesis?pathway?in?fungi?and?insects??(2)糖苷水解酶??糖苷水解酶(glycoside?hydrolases,GH)是一類催化水解糖鏈中特定糖苷鍵的糖苷??酶。CAZy數(shù)據(jù)庫(http://www.cazy.org)根據(jù)蛋白質(zhì)序列進化關(guān)系將其分為100多個家??族。糖作水解酶根據(jù)催化機制的差別又可將其分為反轉(zhuǎn)型糖苷水解酶(inverting?enzymes)??和保留型糖苷水解酶(retaining?enzymes),具體作用方式如圖1.4所示。從保留型糖苷??7jC解酶的反應(yīng)機制中我們知道除了水解活性,其還具有轉(zhuǎn)糖甘(transglycosylation,?TG)??潛力:在保留型糖苷水解酶的反應(yīng)中將形成糖基-酶中間體,若被另一糖分子攻擊,則??發(fā)生轉(zhuǎn)糖苷反應(yīng)。轉(zhuǎn)糖苷催化機制也可用于合成特定的低聚糖,目前已被應(yīng)用于不少低??聚糖的生產(chǎn)中,例如,低聚果糖以蔗糖作為底物,利用(3-D-呋喃果糖苷酶可大量得到;??低聚半乳糖也可以乳糖為底物,用P-半乳糖苷酶催化合成;類似地,在右旋糖酐、低聚??異麥芽糖和環(huán)糊精等的酶法合成都得到了應(yīng)用[43 ̄44]。類似的還有報道利用幾丁質(zhì)酶的轉(zhuǎn)??糖苷活性來合成幾丁寡糖。其中沙雷氏菌、米曲霉和煙曲霉等來源的GH18家族幾丁質(zhì)??酶的轉(zhuǎn)糖苷活性的研究報道較多
被利用于寡糖合成的反應(yīng)中。糖苷合成酶一般利用氟代糖、硝基苯基糖苷作為糖基供體,??4-甲基傘形酮或硝基苯基修飾的糖苷做為受體。根據(jù)作用機制不同,糖苷合成酶也可分??為反轉(zhuǎn)型和保留型兩類(圖1.5)。而且由于糖苷合成酶喪失水解活性,合成的寡糖產(chǎn)物??不會被再次水解,則可使產(chǎn)率得到提升。??產(chǎn)O?〇?L??.UH?()丄0?0M?(\?1,0?°??一?a?et?V.1I?l〇H?■??k?(yH?f?Y?f??Jnz?l?l?Et1s2?Enx??(b)?Enz??°^°?{〇H?HfA〇??(丨X^〇R??F?V〇f?I??Enz?Enz??圖1.5以a-氟代糖為糖基供體的反轉(zhuǎn)型糖苷合成酶(a)和保留型糖苷合成酶(b)的作用機制…I??Fig?1.5?F^eaction?mechanism?of?inverting?glycoside?synthase?(a)?and?retaining?glycoside?synthase?(b)??with?a-glycosyl?fluoride?as?glycosyl?donor??糖苷合成酶存在合成產(chǎn)率高、時間短、有嚴(yán)格的立體選擇性等優(yōu)點,是合成寡糖的??有效途徑之一。但其在合成幾丁寡糖的應(yīng)用上還面臨較多的困難:①P-N-乙酰氨基葡萄??糖苷酶類型的糖苷合成酶有待開發(fā)。目前只有一例來自凍土毛霉的GH85家族內(nèi)切型??GlcNAcase的突變體N175Q己見研究和報道[55],實現(xiàn)了水解活性的降低和轉(zhuǎn)糖苷效率??的提升。②選擇合適的非親核氨基酸類型。根據(jù)己有的研究發(fā)現(xiàn),用不同種類的非親核??氨基酸來取代親核體的突變體
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]糖基轉(zhuǎn)移酶合成相關(guān)糖苷類化合物研究進展[J]. 趙千婧,程瑤,王佳,孫新曉,申曉林,袁其朋. 北京化工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(05)
[2]里氏木霉幾丁質(zhì)酶表達(dá)及其水解產(chǎn)物組成與結(jié)構(gòu)分析[J]. 焦思明,程功,張毓宸,馮翠,任立世,李建軍,杜昱光. 中國生物工程雜志. 2018(10)
[3]Solitalea canadensis源β-N-乙酰氨基己糖苷酶的基因克隆、異源表達(dá)和酶學(xué)特性[J]. 王夢,危雙,王婷,Josef Voglmeir,劉麗. 微生物學(xué)報. 2017(08)
[4]β-N-乙酰氨基己糖苷酶及其合成寡糖的研究進展[J]. 陳曉迪,王鳳山,肖敏. 微生物學(xué)報. 2017(08)
[5]β-葡萄糖苷酶合成龍膽二糖及產(chǎn)物分離[J]. 張林,王磊,吳廣興,勇強,余世袁. 林業(yè)工程學(xué)報. 2017(02)
[6]糖苷合成酶及應(yīng)用的研究進展[J]. 孟嵐,吳旭日,陳依軍. 廣西科學(xué). 2017(01)
[7]右旋糖苷蔗糖酶的研究進展[J]. 韓瑨,吳正鈞,徐曉芬,吳江. 食品研究與開發(fā). 2016(02)
[8]維氏氣單胞菌B565β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的表達(dá)、純化及酶學(xué)性質(zhì)[J]. 劉陽,楊雅麟,張宇婷,冉超,周志剛. 中國生物工程雜志. 2015(02)
[9]低聚半乳糖酶法合成條件的研究[J]. 陳真真,張濤,江波,繆銘,沐萬孟. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2012(10)
[10]糖鏈的化學(xué)合成[J]. 王玥,葉新山. 生命科學(xué). 2011(06)
碩士論文
[1]幾丁寡糖聯(lián)合順鉑對肺癌A549細(xì)胞及其移植瘤的影響[D]. 劉星.遼寧中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[2]幾種海洋寡糖免疫調(diào)控作用初探[D]. 劉美思.遼寧師范大學(xué) 2016
[3]家蠶幾丁質(zhì)酶與幾丁質(zhì)合成酶的基因表達(dá)與功能研究[D]. 孔令斐.蘇州大學(xué) 2010
本文編號:3059812
【文章來源】:華東理工大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.3幾丁質(zhì)在真菌和昆蟲中的合成途徑??Fig?1.3?The?chitin?synthesis?pathway?in?fungi?and?insects??(2)糖苷水解酶??
葡萄糖胺?e°A??圖1.3幾丁質(zhì)在真菌和昆蟲中的合成途徑??Fig?1.3?The?chitin?synthesis?pathway?in?fungi?and?insects??(2)糖苷水解酶??糖苷水解酶(glycoside?hydrolases,GH)是一類催化水解糖鏈中特定糖苷鍵的糖苷??酶。CAZy數(shù)據(jù)庫(http://www.cazy.org)根據(jù)蛋白質(zhì)序列進化關(guān)系將其分為100多個家??族。糖作水解酶根據(jù)催化機制的差別又可將其分為反轉(zhuǎn)型糖苷水解酶(inverting?enzymes)??和保留型糖苷水解酶(retaining?enzymes),具體作用方式如圖1.4所示。從保留型糖苷??7jC解酶的反應(yīng)機制中我們知道除了水解活性,其還具有轉(zhuǎn)糖甘(transglycosylation,?TG)??潛力:在保留型糖苷水解酶的反應(yīng)中將形成糖基-酶中間體,若被另一糖分子攻擊,則??發(fā)生轉(zhuǎn)糖苷反應(yīng)。轉(zhuǎn)糖苷催化機制也可用于合成特定的低聚糖,目前已被應(yīng)用于不少低??聚糖的生產(chǎn)中,例如,低聚果糖以蔗糖作為底物,利用(3-D-呋喃果糖苷酶可大量得到;??低聚半乳糖也可以乳糖為底物,用P-半乳糖苷酶催化合成;類似地,在右旋糖酐、低聚??異麥芽糖和環(huán)糊精等的酶法合成都得到了應(yīng)用[43 ̄44]。類似的還有報道利用幾丁質(zhì)酶的轉(zhuǎn)??糖苷活性來合成幾丁寡糖。其中沙雷氏菌、米曲霉和煙曲霉等來源的GH18家族幾丁質(zhì)??酶的轉(zhuǎn)糖苷活性的研究報道較多
被利用于寡糖合成的反應(yīng)中。糖苷合成酶一般利用氟代糖、硝基苯基糖苷作為糖基供體,??4-甲基傘形酮或硝基苯基修飾的糖苷做為受體。根據(jù)作用機制不同,糖苷合成酶也可分??為反轉(zhuǎn)型和保留型兩類(圖1.5)。而且由于糖苷合成酶喪失水解活性,合成的寡糖產(chǎn)物??不會被再次水解,則可使產(chǎn)率得到提升。??產(chǎn)O?〇?L??.UH?()丄0?0M?(\?1,0?°??一?a?et?V.1I?l〇H?■??k?(yH?f?Y?f??Jnz?l?l?Et1s2?Enx??(b)?Enz??°^°?{〇H?HfA〇??(丨X^〇R??F?V〇f?I??Enz?Enz??圖1.5以a-氟代糖為糖基供體的反轉(zhuǎn)型糖苷合成酶(a)和保留型糖苷合成酶(b)的作用機制…I??Fig?1.5?F^eaction?mechanism?of?inverting?glycoside?synthase?(a)?and?retaining?glycoside?synthase?(b)??with?a-glycosyl?fluoride?as?glycosyl?donor??糖苷合成酶存在合成產(chǎn)率高、時間短、有嚴(yán)格的立體選擇性等優(yōu)點,是合成寡糖的??有效途徑之一。但其在合成幾丁寡糖的應(yīng)用上還面臨較多的困難:①P-N-乙酰氨基葡萄??糖苷酶類型的糖苷合成酶有待開發(fā)。目前只有一例來自凍土毛霉的GH85家族內(nèi)切型??GlcNAcase的突變體N175Q己見研究和報道[55],實現(xiàn)了水解活性的降低和轉(zhuǎn)糖苷效率??的提升。②選擇合適的非親核氨基酸類型。根據(jù)己有的研究發(fā)現(xiàn),用不同種類的非親核??氨基酸來取代親核體的突變體
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]糖基轉(zhuǎn)移酶合成相關(guān)糖苷類化合物研究進展[J]. 趙千婧,程瑤,王佳,孫新曉,申曉林,袁其朋. 北京化工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(05)
[2]里氏木霉幾丁質(zhì)酶表達(dá)及其水解產(chǎn)物組成與結(jié)構(gòu)分析[J]. 焦思明,程功,張毓宸,馮翠,任立世,李建軍,杜昱光. 中國生物工程雜志. 2018(10)
[3]Solitalea canadensis源β-N-乙酰氨基己糖苷酶的基因克隆、異源表達(dá)和酶學(xué)特性[J]. 王夢,危雙,王婷,Josef Voglmeir,劉麗. 微生物學(xué)報. 2017(08)
[4]β-N-乙酰氨基己糖苷酶及其合成寡糖的研究進展[J]. 陳曉迪,王鳳山,肖敏. 微生物學(xué)報. 2017(08)
[5]β-葡萄糖苷酶合成龍膽二糖及產(chǎn)物分離[J]. 張林,王磊,吳廣興,勇強,余世袁. 林業(yè)工程學(xué)報. 2017(02)
[6]糖苷合成酶及應(yīng)用的研究進展[J]. 孟嵐,吳旭日,陳依軍. 廣西科學(xué). 2017(01)
[7]右旋糖苷蔗糖酶的研究進展[J]. 韓瑨,吳正鈞,徐曉芬,吳江. 食品研究與開發(fā). 2016(02)
[8]維氏氣單胞菌B565β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的表達(dá)、純化及酶學(xué)性質(zhì)[J]. 劉陽,楊雅麟,張宇婷,冉超,周志剛. 中國生物工程雜志. 2015(02)
[9]低聚半乳糖酶法合成條件的研究[J]. 陳真真,張濤,江波,繆銘,沐萬孟. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2012(10)
[10]糖鏈的化學(xué)合成[J]. 王玥,葉新山. 生命科學(xué). 2011(06)
碩士論文
[1]幾丁寡糖聯(lián)合順鉑對肺癌A549細(xì)胞及其移植瘤的影響[D]. 劉星.遼寧中醫(yī)藥大學(xué) 2017
[2]幾種海洋寡糖免疫調(diào)控作用初探[D]. 劉美思.遼寧師范大學(xué) 2016
[3]家蠶幾丁質(zhì)酶與幾丁質(zhì)合成酶的基因表達(dá)與功能研究[D]. 孔令斐.蘇州大學(xué) 2010
本文編號:3059812
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