虹鱒是典型的冷水性魚類,對較高水溫的耐受能力差,隨著全球氣候變暖,夏季高溫對虹鱒養(yǎng)殖的威脅越來越嚴(yán)重,鑒定虹鱒應(yīng)答高溫刺激的相關(guān)基因,在基因表達的不同層次上理解熱應(yīng)激的響應(yīng)策略和調(diào)控機理,可以為虹鱒耐高溫遺傳選育和改良、發(fā)掘虹鱒抗高溫的各種措施提供理論基礎(chǔ)。microRNA（miRNA）是一類對基因進行轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的單鏈小分子RNA。目前,熱應(yīng)激下虹鱒miRNA的研究還未見文獻報道,因此,本研究選取全同胞家系的虹鱒作為試驗材料,取對照組（18℃）和熱處理組（24℃）各3尾雌魚的肝臟和頭腎,用llumina HiSeq 2500測序平臺和生物信息學(xué)方法,對虹鱒肝臟和頭腎組織miRNAs進行系統(tǒng)性分析,鑒定熱應(yīng)激下差異表達的miRNAs,并揭示新的虹鱒特異miRNAs;接著分別從肝臟和頭腎RNA-seq和small RNA-seq結(jié)果中篩選出穩(wěn)定表達的mRNAs（肝臟5個,頭腎5個）和miRNAs（肝臟4個,頭腎5個）,通過geNorm,NormFinder,BestKeeper和ComparativeΔCt四種方法同時評估這些基因和四個常用參考基因和一個小的非編碼RNA（U6）的表達穩(wěn)定性... 

【文章來源】：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省

【文章頁數(shù)】：146 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

miRNA的合成與作用機理Fig.1-1GeneratingandactionmechanismofmiRNA

smallRNA文庫制備Fig.2-1ThePreparationofLibraryforsmallRNAs

smallRNA序列生物信息學(xué)分析


本文編號：3058198