上海市偽狂犬病病毒相關毒力基因分子變異分析
發(fā)布時間:2021-03-01 19:53
為了解偽狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)4種主要毒力基因(gB、gC、gD和gE)的分子特征和變異情況,采用PCR技術,對2010—2015年分離到的28株PRV進行基因擴增和測序。結果顯示:2010—2015年分離毒株的gB、gC、gD和gE基因均存在多位點突變,且位于抗原表位區(qū);與2010年分離毒株的gD基因相比,2012年后分離毒株存在6個連續(xù)氨基酸插入。基于gB、gC、gD和gE基因的進化樹顯示:上海市2010年分離的4個毒株與2012年以后分離的毒株雖屬于同一大的分支,但與經典毒株親緣關系近,處于同一小的分支中;2012年分離毒株與2011年后國內變異株親緣關系近,處于另一分支中。這些毒力基因抗原表位區(qū)域氨基酸的突變可能導致其毒力及抗原性發(fā)生改變;2012年以后分離毒株均為變異株,并已成為上海市的主要流行毒株。本研究為PRV分子致病機制及分子流行病學研究提供了依據(jù)。
【文章來源】:中國動物檢疫. 2020,37(07)
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
PRV gB基因擴增產物
測序結果顯示,上海市2010—2015年分離毒株gB基因序列全長為2.8 kb,編碼914個氨基酸殘基組成的多肽。它們之間的核苷酸同源性和氨基酸同源性分別為99.6%~100%和98.7%~100%,與GeneBank上國內外其他18株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分別為98.2%~100%和96.0%~100%(圖2)。與國內Ea毒株的氨基酸序列相比,存在6個位點的氨基酸一致性替換,即T82A、G393D、R451K、H560K、P735L、T737A。應用Mega 5.0軟件中的Clustal W方法,將測出的10株PRV gB基因核苷酸序列與GenBank上已登錄的國內外其他18株PRV相應序列進行遺傳距離分析,利用NeighborJoining方法繪制了系統(tǒng)發(fā)育進化關系(圖3)。基于gB基因進化樹,PRV毒株可劃分為2個基因型Group1和Group2。上海市2010年分離毒株與2012年以后分離毒株處于不同的進化分支,均與國內Ea株親緣關系較近,屬于同一大進化分支(Group2),而與以歐美洲毒株為代表的Group1親緣關系較遠。圖3 PRV gB基因進化樹分析結果
PRV gB基因進化樹分析結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]偽狂犬病病毒湖北株糖蛋白gD基因的克隆及序列測定[J]. 王家富,張楚瑜,丁建華,周榮,溫淑娟,黃鎮(zhèn)華. 病毒學報. 2000(01)
本文編號:3057951
【文章來源】:中國動物檢疫. 2020,37(07)
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
PRV gB基因擴增產物
測序結果顯示,上海市2010—2015年分離毒株gB基因序列全長為2.8 kb,編碼914個氨基酸殘基組成的多肽。它們之間的核苷酸同源性和氨基酸同源性分別為99.6%~100%和98.7%~100%,與GeneBank上國內外其他18株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分別為98.2%~100%和96.0%~100%(圖2)。與國內Ea毒株的氨基酸序列相比,存在6個位點的氨基酸一致性替換,即T82A、G393D、R451K、H560K、P735L、T737A。應用Mega 5.0軟件中的Clustal W方法,將測出的10株PRV gB基因核苷酸序列與GenBank上已登錄的國內外其他18株PRV相應序列進行遺傳距離分析,利用NeighborJoining方法繪制了系統(tǒng)發(fā)育進化關系(圖3)。基于gB基因進化樹,PRV毒株可劃分為2個基因型Group1和Group2。上海市2010年分離毒株與2012年以后分離毒株處于不同的進化分支,均與國內Ea株親緣關系較近,屬于同一大進化分支(Group2),而與以歐美洲毒株為代表的Group1親緣關系較遠。圖3 PRV gB基因進化樹分析結果
PRV gB基因進化樹分析結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]偽狂犬病病毒湖北株糖蛋白gD基因的克隆及序列測定[J]. 王家富,張楚瑜,丁建華,周榮,溫淑娟,黃鎮(zhèn)華. 病毒學報. 2000(01)
本文編號:3057951
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