1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶（ITPK）是一種保守的多功能酶,調(diào)控磷酸肌醇的代謝過程,廣泛存在于動(dòng)植物和線蟲中。本研究從兩個(gè)野生種花生基因組（Arachis duranensis和Arachis ipaensis）中獲得Ad ITPK家族基因7個(gè),Ai ITPK家族基因7個(gè),利用生物信息學(xué)手段,系統(tǒng)地分析花生ITPK家族基因生物學(xué)特征。結(jié)果表明,Ad ITPKs和AiITPKs基因的染色體定位相似,在03號(hào)和05號(hào)染色體上都分別有2個(gè)ITPK家族成員,Ad ITPKs在A01、A08和A10號(hào)染色體上各1個(gè),Ai ITPKs在B01、B07和B10號(hào)染色體上各1個(gè);花生各ITPK基因含外顯子數(shù)量在1～10個(gè)不等,可編碼220～483個(gè)氨基酸;進(jìn)化關(guān)系分析顯示花生ITPK家族基因可分為3個(gè)亞家族;基于保守結(jié)構(gòu)域分析顯示,此家族蛋白含有4～6個(gè)保守結(jié)構(gòu)基序。兩基因組同源基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)相似性較大,而Ad ITPK5和Ai ITPK5、Ad ITPK6和AiITPK6兩對(duì)同源基因例外;大部分基因的三級(jí)結(jié)構(gòu)皆相似,但Ad ITPK1、Ad ITPK6、Ai ITPK1和Ai ITPK6與其... 

【文章來源】：中國油料作物學(xué)報(bào). 2020,42(03)北大核心

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【部分圖文】：

大豆、水稻、擬南芥、玉米和野生花生ITPK基因系統(tǒng)發(fā)育樹

野生花生ITPK家族基因染色體定位

從花生數(shù)據(jù)庫Peanutbase中下載花生ITPK家族基因表達(dá)數(shù)據(jù)，得到花生AdITPK2、AdITPK5、AiITPK2、AiITPK5在生長過程中不同部位、不同時(shí)期的表達(dá)量，如圖5所示。AdITPK2和AiIPKT2在所測定的各個(gè)組織、不同發(fā)育時(shí)期均有表達(dá)，其中AdIT-PK2在根瘤中（萌發(fā)25d后）表達(dá)量最高，其次是在萌發(fā)10d后的根系中，在其余部位表達(dá)量相對(duì)較小。AiITPK2在種子（種子白色或一端粉色時(shí)期和莢果呈魚雷形時(shí)期）、種皮（莢果呈魚雷形時(shí)期）、生殖莖尖（始花期）和萌發(fā)10d后根系等部位都有較高的表達(dá)量。AdITPK5在雄蕊中無表達(dá)，在雌蕊中表達(dá)極低，而在種子（胚軸呈白色時(shí)期）、莖尖（主莖始花期）和主莖（始花期）中表達(dá)量較高，AiITPK5在花被和種皮中無表達(dá)，在種子（白色或一端粉色）、生殖莖尖（始花期）等部位有較高的表達(dá)。圖4 A.ipansis ITPK家族基因結(jié)構(gòu)及蛋白保守基序示意圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]毛果楊I(lǐng)TPK家族基因的鑒定及特性分析[J]. 李新林,金華,鄒吉祥,金純伊,朱桐,程文瓊,王鑄,樊家昊.  分子植物育種. 2019(20)
[2]花生膜聯(lián)蛋白基因家族成員的結(jié)構(gòu)和表達(dá)分析[J]. 王慧敏,李新國,萬書波,張智猛,丁紅,李國衛(wèi),高文偉,彭振英.  作物學(xué)報(bào). 2019(03)
[3]花生14-3-3基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 姜煥煥,王通,禹山林,陳明娜,王冕,陳娜,潘麗娟,祁佩時(shí),遲曉元.  中國油料作物學(xué)報(bào). 2018(04)
[4]植物膜聯(lián)蛋白基因研究進(jìn)展[J]. 王立科,張邊江,唐寧,楊平,周峰,陳全戰(zhàn).  分子植物育種. 2016(08)
[5]玉米1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶ITPK家族基因的鑒定和分析[J]. 張中保,李向龍,吳忠義,魏建華.  科技導(dǎo)報(bào). 2015(16)
[6]一個(gè)編碼1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶類似物的擬南芥基因的克隆及其在脅迫條件下的表達(dá)分析（英文）[J]. 陳其軍,鈕旭光,柴茂峰,陳珈,劉強(qiáng),王學(xué)臣.  Acta Botanica Sinica. 2003(02)

博士論文
[1]擬南芥1，3，4-三磷酸肌醇5/6-激酶在光形態(tài)建成中的功能研究[D]. 秦治翔.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號(hào)：3041649