發(fā)布時(shí)間：2021-02-19 20:18

　　選擇全基因組序列已經(jīng)公布的22種真菌為研究對(duì)象,利用antiSMASH數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)不同營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型真菌的次生代謝產(chǎn)物合成基因簇進(jìn)行注釋,以期發(fā)現(xiàn)不同營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型植物病原真菌在侵染植物過(guò)程中次生代謝產(chǎn)物所發(fā)揮的作用及合成基因簇的差異性。結(jié)果表明:半活體營(yíng)養(yǎng)型真菌和死體營(yíng)養(yǎng)型真菌中次生代謝產(chǎn)物合成基因簇的種類(lèi)和數(shù)量都高于活體營(yíng)養(yǎng)型真菌;進(jìn)一步對(duì)非核糖體肽合成酶（NRPS）、聚酮合酶（PKS）、萜烯（terpene）三大類(lèi)次生代謝產(chǎn)物合成基因簇進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)半活體營(yíng)養(yǎng)型和死體營(yíng)養(yǎng)型病原菌中NRPS基因簇、PKS基因簇和萜烯基因簇的數(shù)量也都高于活體營(yíng)養(yǎng)型病原菌。 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,39(06)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

不同營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型真菌次生代謝產(chǎn)物合成基因簇的種類(lèi)(A)和數(shù)量(B)對(duì)比分析

圖1 不同營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型真菌次生代謝產(chǎn)物合成基因簇的種類(lèi)(A)和數(shù)量(B)對(duì)比分析此外,半活體營(yíng)養(yǎng)型病原菌中存在9種獨(dú)特的復(fù)合型基因簇,分別是NRPS-like+terpene、NRPS+NRPS-like、NRPS+fungal-RiPP、NRPS+betalactone、NRPS-like+betalactone、betalactone+NRPS-like、indole+terpene、具有POP或UstH肽酶類(lèi)型和修飾的真菌RiPP(fungal-RiPP)+terpene和NRPS+T1PKS+fungal-RiPP;死體營(yíng)養(yǎng)型病原菌中存在6種獨(dú)特的復(fù)合型基因簇,分別是NRPS+terpene、NRPS-like+NRPS、indole+NRPS+T1PKS、T3PKS+T1PKS、terpene+T1PKS+NRPS和T1PKS+NRPS-like+other;腐生真菌存在2種獨(dú)特的復(fù)合型基因簇,分別是T1PKS+NRPS+indole和NRPS+NRPS-like+indole(圖2D)。

對(duì)17個(gè)植物病原真菌的次生代謝產(chǎn)物萜烯合成基因簇開(kāi)展分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)半活體營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型真菌中萜烯基因簇?cái)?shù)量3～12個(gè),死體營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型真菌中萜烯基因簇?cái)?shù)量2～13個(gè),活體營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型真菌中PKS基因簇?cái)?shù)量2～4個(gè)(圖5)。上述結(jié)果表明,半活體和死體營(yíng)養(yǎng)型病原菌中萜烯基因簇?cái)?shù)量均高于活體營(yíng)養(yǎng)型病原菌。圖4 不同營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型植物病原菌中所含有PKS的數(shù)量對(duì)比分析

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3041632