CRISPR/Cas9系統(tǒng)在斑馬魚(yú)基因編輯研究中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-02-16 03:49
隨著斑馬魚(yú)(Danio rerio)基因組測(cè)序工作的完成,研究人員發(fā)現(xiàn)斑馬魚(yú)與人類(Homo sapiens)基因同源性較高,針對(duì)這一特點(diǎn),研究人員構(gòu)建了多種人類疾病的斑馬魚(yú)模型,用于探究疾病發(fā)生機(jī)制;蚓庉嫾夹g(shù)的應(yīng)用促進(jìn)了斑馬魚(yú)基因功能研究的發(fā)展,先進(jìn)的基因編輯技術(shù)CRISPR/Cas9系統(tǒng),因其簡(jiǎn)單高效正廣泛被應(yīng)用。本研究利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)敲除斑馬魚(yú)lncRNA基因啟動(dòng)子區(qū)以及將dCas9基因敲入斑馬魚(yú)基因組。本文主要的研究?jī)?nèi)容如下:1、為了研究Nondret002679在斑馬魚(yú)胚胎各時(shí)期以及成年后各組織中的表達(dá)規(guī)律,首先收集0 hpf(合子期)、3 hpf(囊胚期)、6 hpf(原腸期)、12hpf(體節(jié)期/5-體節(jié))、24hpf(咽囊期)及48hpf(孵化期)的斑馬魚(yú)胚胎提取總RNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,采用熒光定量PCR (RT-qPCR)方法檢測(cè)Nondmt002679的表達(dá)規(guī)律。同時(shí)收集成年斑馬魚(yú)的心臟、肝臟、睪丸、卵巢、肌肉、尾鰭7組織樣,同樣采用RT-qPCR方法檢測(cè)Nondret002679的表達(dá)規(guī)律。結(jié)果顯示,24 h時(shí)Nondret002679表達(dá)量...
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
引言
文獻(xiàn)綜述
1 斑馬魚(yú)研究進(jìn)展
1.1 模式生物斑馬魚(yú)簡(jiǎn)介
1.2 斑馬魚(yú)研究歷史
1.3 斑馬魚(yú)在人類疾病研究中的應(yīng)用
2 CRISPR/Cas9系統(tǒng)研究進(jìn)展
2.1 CRISPR/Cas9系統(tǒng)簡(jiǎn)介
2.1.1 CRISPR/Cas系統(tǒng)研究歷史
2.1.2 CRISPR/Cas9系統(tǒng)簡(jiǎn)介
2.2 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的基因敲除
2.3 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的基因敲入
2.4 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的基因調(diào)控
2.5 CRISPR/Cas9系統(tǒng)與其它基因編輯技術(shù)的比較
3 本研究的立題依據(jù)及研究意義
3.1 初步探究Nondret002679表達(dá)規(guī)律及其啟動(dòng)子區(qū)敲除
3.2 dCas9斑馬魚(yú)模型的構(gòu)建
4 研究展望
第一章 探究Nondret002679在斑馬魚(yú)胚胎各階段及各組織的表達(dá)規(guī)律
前言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 試驗(yàn)動(dòng)物
1.4 斑馬魚(yú)胚胎的各階段以及各組織中Nondret002679表達(dá)量的差異分析
1.4.0 各階段斑馬魚(yú)胚胎的收集
1.4.1 成年斑馬魚(yú)的解剖
1.4.2 采用TRIzoL試劑提取胚胎中的總RNA
1.4.3 RNA濃度的檢測(cè)
1.4.4 逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA
1.4.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測(cè)
1.4.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 Nondret002679在斑馬魚(yú)胚胎各階段表達(dá)量的差異分析
2.2 Nondret002679在斑馬魚(yú)的各組織中表達(dá)量的差異分析
3 討論
第二章 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的Nondret002679啟動(dòng)子區(qū)敲除
前言
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 試驗(yàn)試劑
1.3 Nondret002679靶位點(diǎn)的選擇
1.4 gRNA體外轉(zhuǎn)錄模板的合成及轉(zhuǎn)錄
1.4.1 gRNA體外轉(zhuǎn)錄模板的合成
1.4.2 gRNA的體外轉(zhuǎn)錄
1.5 Cas9 mRNA體外轉(zhuǎn)錄
1.6 顯微注射及敲除鑒定
1.6.1 顯微注射
1.6.2 斑馬魚(yú)DNA的提取
1.6.3 Nondret002679啟動(dòng)子區(qū)敲除鑒定
1.7 啟動(dòng)子區(qū)缺失的斑馬魚(yú)的純合鑒定
1.8 啟動(dòng)子區(qū)敲除的雜合斑馬魚(yú)Nondret002679的表達(dá)分析
2 結(jié)果
2.1 早期斑馬魚(yú)敲除鑒定結(jié)果
2.2 2月齡斑馬魚(yú)敲除鑒定結(jié)果
2.3 啟動(dòng)子區(qū)缺失的純合斑馬魚(yú)的獲得
2.4 啟動(dòng)子區(qū)敲除的雜合斑馬魚(yú)Nondret002679的表達(dá)分析結(jié)果
3 討論
第三章 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的dCas9定點(diǎn)敲入斑馬魚(yú)基因組模型的構(gòu)建
前言
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 儀器設(shè)備
1.3 dCas9 donor載體構(gòu)建引物的設(shè)計(jì)與合成
1.4 dCas9 donor載體的構(gòu)建
1.5 靶位點(diǎn)的選擇
1.6 顯微注射及敲入鑒定
1.7 雜合斑馬魚(yú)的dCas9的表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 dCas9敲入斑馬魚(yú)基因組的鑒定結(jié)果
2.2 純合dCas9斑馬魚(yú)鑒定結(jié)果
2.3 雜合斑馬魚(yú)的dCas9表達(dá)分析結(jié)果
3 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CRISPR/Cas技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 常振儀,嚴(yán)維,劉東風(fēng),陳竹鋒,謝剛,盧嘉威,吳建新,唐曉艷. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(09)
[2]Development of Novel Visual-Plus Quantitative Analysis Systems for Studying DNA Double-Strand Break Repairs in Zebrafish[J]. Jingang Liu(a,1),Lu Gong(a,1),Changqing Chang(b,1,2),Cong Liuc,Jinrong Peng(b,),Jun Chen(a,) a College of Life Sciences,Zhejiang University,866 Yu Hang Tang Road,Hangzhou 310058,China b College of Animal Sciences,Zhejiang University,866 Yu Hang Tang Road,Hangzhou 310058,China c Developmental and Stem Cell Institute,West China Second University Hospital,Sichuan University,Chengdu 610041,China 2 Present address:College of Natural Resources and Environment,South China Agricultural University,Guangzhou 510650,China.. 遺傳學(xué)報(bào). 2012(09)
[3]斑馬魚(yú)與人類疾病模型的研究[J]. 徐振華,趙慕鈞,李載平. 生命的化學(xué). 2002(04)
本文編號(hào):3036101
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
引言
文獻(xiàn)綜述
1 斑馬魚(yú)研究進(jìn)展
1.1 模式生物斑馬魚(yú)簡(jiǎn)介
1.2 斑馬魚(yú)研究歷史
1.3 斑馬魚(yú)在人類疾病研究中的應(yīng)用
2 CRISPR/Cas9系統(tǒng)研究進(jìn)展
2.1 CRISPR/Cas9系統(tǒng)簡(jiǎn)介
2.1.1 CRISPR/Cas系統(tǒng)研究歷史
2.1.2 CRISPR/Cas9系統(tǒng)簡(jiǎn)介
2.2 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的基因敲除
2.3 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的基因敲入
2.4 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的基因調(diào)控
2.5 CRISPR/Cas9系統(tǒng)與其它基因編輯技術(shù)的比較
3 本研究的立題依據(jù)及研究意義
3.1 初步探究Nondret002679表達(dá)規(guī)律及其啟動(dòng)子區(qū)敲除
3.2 dCas9斑馬魚(yú)模型的構(gòu)建
4 研究展望
第一章 探究Nondret002679在斑馬魚(yú)胚胎各階段及各組織的表達(dá)規(guī)律
前言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 試驗(yàn)動(dòng)物
1.4 斑馬魚(yú)胚胎的各階段以及各組織中Nondret002679表達(dá)量的差異分析
1.4.0 各階段斑馬魚(yú)胚胎的收集
1.4.1 成年斑馬魚(yú)的解剖
1.4.2 采用TRIzoL試劑提取胚胎中的總RNA
1.4.3 RNA濃度的檢測(cè)
1.4.4 逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA
1.4.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測(cè)
1.4.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 Nondret002679在斑馬魚(yú)胚胎各階段表達(dá)量的差異分析
2.2 Nondret002679在斑馬魚(yú)的各組織中表達(dá)量的差異分析
3 討論
第二章 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的Nondret002679啟動(dòng)子區(qū)敲除
前言
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 試驗(yàn)試劑
1.3 Nondret002679靶位點(diǎn)的選擇
1.4 gRNA體外轉(zhuǎn)錄模板的合成及轉(zhuǎn)錄
1.4.1 gRNA體外轉(zhuǎn)錄模板的合成
1.4.2 gRNA的體外轉(zhuǎn)錄
1.5 Cas9 mRNA體外轉(zhuǎn)錄
1.6 顯微注射及敲除鑒定
1.6.1 顯微注射
1.6.2 斑馬魚(yú)DNA的提取
1.6.3 Nondret002679啟動(dòng)子區(qū)敲除鑒定
1.7 啟動(dòng)子區(qū)缺失的斑馬魚(yú)的純合鑒定
1.8 啟動(dòng)子區(qū)敲除的雜合斑馬魚(yú)Nondret002679的表達(dá)分析
2 結(jié)果
2.1 早期斑馬魚(yú)敲除鑒定結(jié)果
2.2 2月齡斑馬魚(yú)敲除鑒定結(jié)果
2.3 啟動(dòng)子區(qū)缺失的純合斑馬魚(yú)的獲得
2.4 啟動(dòng)子區(qū)敲除的雜合斑馬魚(yú)Nondret002679的表達(dá)分析結(jié)果
3 討論
第三章 CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)的dCas9定點(diǎn)敲入斑馬魚(yú)基因組模型的構(gòu)建
前言
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 儀器設(shè)備
1.3 dCas9 donor載體構(gòu)建引物的設(shè)計(jì)與合成
1.4 dCas9 donor載體的構(gòu)建
1.5 靶位點(diǎn)的選擇
1.6 顯微注射及敲入鑒定
1.7 雜合斑馬魚(yú)的dCas9的表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 dCas9敲入斑馬魚(yú)基因組的鑒定結(jié)果
2.2 純合dCas9斑馬魚(yú)鑒定結(jié)果
2.3 雜合斑馬魚(yú)的dCas9表達(dá)分析結(jié)果
3 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CRISPR/Cas技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 常振儀,嚴(yán)維,劉東風(fēng),陳竹鋒,謝剛,盧嘉威,吳建新,唐曉艷. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(09)
[2]Development of Novel Visual-Plus Quantitative Analysis Systems for Studying DNA Double-Strand Break Repairs in Zebrafish[J]. Jingang Liu(a,1),Lu Gong(a,1),Changqing Chang(b,1,2),Cong Liuc,Jinrong Peng(b,),Jun Chen(a,) a College of Life Sciences,Zhejiang University,866 Yu Hang Tang Road,Hangzhou 310058,China b College of Animal Sciences,Zhejiang University,866 Yu Hang Tang Road,Hangzhou 310058,China c Developmental and Stem Cell Institute,West China Second University Hospital,Sichuan University,Chengdu 610041,China 2 Present address:College of Natural Resources and Environment,South China Agricultural University,Guangzhou 510650,China.. 遺傳學(xué)報(bào). 2012(09)
[3]斑馬魚(yú)與人類疾病模型的研究[J]. 徐振華,趙慕鈞,李載平. 生命的化學(xué). 2002(04)
本文編號(hào):3036101
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3036101.html
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