為研究肉桂酰輔酶A還原酶基因（CCR）在西南樺木質(zhì)素合成中的作用機(jī)制,采用RT-PCR技術(shù)從西南樺中克隆得到1個(gè)具完整開(kāi)放閱讀框的肉桂酰CoA還原酶基因（BaCCR）,該基因全長(zhǎng)975 bp,編碼324個(gè)氨基酸。序列比對(duì)分析顯示西南樺CCR蛋白序列與胡桃、歐洲栓皮櫟、梅、甜櫻桃的蛋白序列相似性均在80%以上。BaCCR擁有CCR蛋白的NADP結(jié)合域和底物結(jié)合域KNWYCYGK。進(jìn)化分析表明,BaCCR與梅、甜櫻桃、亞洲棉、葡萄聚為一個(gè)枝系。轉(zhuǎn)錄模式分析表明,BaCCR基因在根和小枝中高量表達(dá)。 

【文章來(lái)源】：西部林業(yè)科學(xué). 2020,49(05)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

CCR蛋白序列比對(duì)

圖1 CCR蛋白序列比對(duì)由圖2可知,進(jìn)化樹(shù)分為3個(gè)支系,西南樺與亞洲棉(Gossypium arboreum,XP_017617353.1)、葡萄(Vitis vinifera,XP_010648113.1)、梅、甜櫻桃聚為1個(gè)支系,其中與梅、甜櫻桃的親緣關(guān)系較近。

該蛋白由324個(gè)氨基酸殘基組成,其分子式為C1602H2561N423O464S14,分子質(zhì)量為35 620.35,理論等電點(diǎn)為7.04。BaCCR蛋白無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域,為親水性蛋白。對(duì)BaCCR氨基酸序列的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),有α-螺旋、β-折疊、無(wú)規(guī)則卷曲和延伸鏈4種二級(jí)結(jié)構(gòu),以α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲為主(圖4)。圖4 BaCCR蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于Maxent模型的貴州省天然黃杉林的潛在分布預(yù)測(cè)研究[J]. 李望軍,馮圖,周瑞伍,何斌,崔濤,鄧芳芳,彭明春.  西部林業(yè)科學(xué). 2019(03)
[2]基于Maxent模型的假臭草潛在分布區(qū)預(yù)測(cè)[J]. 郭燕青,史夢(mèng)竹,李建宇,傅建煒,吳梅香.  熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2019(03)
[3]猴耳環(huán)中抗炎活性成分3,3’-新木質(zhì)素的含量測(cè)定及指紋圖譜研究[J]. 陳少茹,張誠(chéng)光,李智勇,詹利之.  江西中醫(yī)藥. 2019(02)
[4]人參潛在地理分布以及氣候變化對(duì)其影響預(yù)測(cè)[J]. 趙澤芳,衛(wèi)海燕,郭彥龍,顧蔚.  應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2016(11)
[5]物種分布模型理論研究進(jìn)展[J]. 李國(guó)慶,劉長(zhǎng)成,劉玉國(guó),楊軍,張新時(shí),郭柯.  生態(tài)學(xué)報(bào). 2013(16)
[6]木質(zhì)素的結(jié)構(gòu)研究與應(yīng)用[J]. 路瑤,魏賢勇,宗志敏,陸永超,趙煒,曹景沛.  化學(xué)進(jìn)展. 2013(05)
[7]8種植物CHI基因的生物信息學(xué)分析[J]. 原曉龍,周軍,辛培堯,董嬌,孟富宣,付海輝.  西南林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(02)
[8]五味子中木質(zhì)素類活性成分的高效液相色譜分析[J]. 白晶,于治國(guó).  化學(xué)工程師. 2009(05)
[9]植物肉桂酰輔酶A還原酶基因的結(jié)構(gòu)功能及應(yīng)用潛力[J]. 李魏,譚曉風(fēng),陳鴻鵬.  經(jīng)濟(jì)林研究. 2009(01)
[10]我國(guó)西南樺研究的回顧與展望[J]. 曾杰,郭文福,趙志剛,翁啟杰,尹光天,鄭海水.  林業(yè)科學(xué)研究. 2006(03)

碩士論文
[1]基于MaxEnt的物種空間分布預(yù)測(cè)不確定性分析[D]. 尚忠慧.陜西師范大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3024925