基于觸角轉(zhuǎn)錄組的飛蝗P450基因鑒定及CYP6FD5和CYP6MU1功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-02-05 18:47
昆蟲的嗅覺感受主要通過覆蓋于觸角表面的大量嗅覺感器來完成。氣味分子通過感器表面的孔進(jìn)入感覺淋巴液,在感器內(nèi)與氣味結(jié)合蛋白和氣味受體相互作用后,將信號(hào)傳遞到中樞神經(jīng)系統(tǒng),使昆蟲做出相應(yīng)的行為反應(yīng)。氣味分子與受體相互作用后,須在短時(shí)間內(nèi)變?yōu)槭Щ顮顟B(tài),使信號(hào)終止,恢復(fù)感器的敏感性,才能保障受體神經(jīng)對(duì)隨后的氣味刺激做出及時(shí)和準(zhǔn)確的反應(yīng)。目前認(rèn)為,氣味分子的失活主要由氣味降解酶來完成。細(xì)胞色素P450(Cytochrome P450s,簡(jiǎn)稱為CYPs或P450s)是一類重要的氣味降解酶,在昆蟲的嗅覺行為中發(fā)揮重要作用。飛蝗作為世界上重要的農(nóng)業(yè)害蟲,對(duì)農(nóng)作物尤其對(duì)小麥,玉米及高粱等禾本科作物為害極大,給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。在復(fù)雜的自然環(huán)境中,飛蝗能夠不斷地接受外界信息,氣味降解酶發(fā)揮著不可或缺的作用。本文通過轉(zhuǎn)錄組、RT-qPCR等方法系統(tǒng)地研究了飛蝗觸角P450的特性,并采用RNA干擾方法結(jié)合觸角電位和行為測(cè)定,研究了觸角P450在飛蝗嗅覺行為中的生理功能。研究結(jié)果如下:一、飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組的構(gòu)建及分析本文構(gòu)建了飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,共獲得11.07 Gb堿基序列,15,3792個(gè)轉(zhuǎn)錄本。...
【文章來源】:山西大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 昆蟲的嗅覺感器及嗅覺感受機(jī)制
1.2 昆蟲觸角細(xì)胞色素P450研究進(jìn)展
1.2.1 細(xì)胞色素P450
1.2.2 昆蟲觸角P450研究進(jìn)展
1.3 飛蝗嗅覺感受機(jī)制研究進(jìn)展
1.3.1 飛蝗概述
1.3.2 飛蝗嗅覺感受機(jī)制研究進(jìn)展
1.4 RNAi技術(shù)
1.5 觸角電位技術(shù)
1.6 行為實(shí)驗(yàn)技術(shù)
1.7 研究目的和意義
第二章 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組構(gòu)建及分析
2.1 材料與方法
2.1.1 供試蟲源
2.1.2 主要儀器設(shè)備
2.1.3 主要試劑
2.1.4 轉(zhuǎn)錄組樣品制備
2.1.5 RNA提取
2.1.6 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來源
2.1.7 序列的拼接和組裝
2.1.8 與各數(shù)據(jù)庫的功能注釋
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組測(cè)序產(chǎn)量與數(shù)據(jù)組裝統(tǒng)計(jì)
2.2.2 轉(zhuǎn)錄組單基因功能注釋
2.3 討論
第三章 飛蝗觸角細(xì)胞色素P450基因的搜索及篩選
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 供試蟲源
3.1.2 主要儀器設(shè)備
3.1.3 主要試劑
3.2 研究方法
3.2.1 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組中細(xì)胞色素P450基因的搜索
3.2.2 細(xì)胞色素P450基因全長(zhǎng)驗(yàn)證、命名和理化特性分析
3.2.3 聚類樹構(gòu)建
3.2.4 飛蝗不同組織部位樣品制備
3.2.5 總RNA提取及cDNA合成
3.2.6 RT-PCR和RT-qPCR所用引物設(shè)計(jì)
3.2.7 RT-PCR檢測(cè)P450基因在不同組織部位的表達(dá)
3.2.8 RT-qPCR檢測(cè)P450基因在不同組織部位的表達(dá)
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 飛蝗觸角細(xì)胞色素P450搜索結(jié)果分析
3.3.2 聚類樹分析
3.3.3 基于RT-PCR的P450組織部位表達(dá)特性分析
3.3.4 基于RT-qPCR的細(xì)胞色素P450組織部位表達(dá)特性分析
3.4 討論
第四章 飛蝗觸角CYP6FD5和CYP6MU1基因的表達(dá)特性分析
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 供試蟲源
4.1.2 主要儀器設(shè)備
4.1.3 主要試劑
4.2 研究方法
4.2.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1全長(zhǎng)cDNA序列驗(yàn)證
4.2.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因序列分析
4.2.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1的聚類分析
4.2.4 飛蝗不同組織部位樣品制備
4.2.5 飛蝗觸角不同發(fā)育階段樣品制備
4.2.6 總RNA提取及cDNA合成
4.2.7 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因RT-qRCR引物設(shè)計(jì)
4.2.8 RT-qRCR檢測(cè)及數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因cDNA序列分析
4.3.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1的聚類分析
4.3.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因在不同組織部位的表達(dá)特性分析
4.3.4 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因在觸角不同發(fā)育階段的表達(dá)特性分析
4.4 討論
第五章 CYP6FD5和CYP6MU1基因在飛蝗嗅覺行為中的功能研究
5.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.1 供試蟲源
5.1.2 主要儀器
5.1.3 主要試劑
5.2 研究方法
5.2.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因dsRNA引物設(shè)計(jì)及體外合成
5.2.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默效率檢測(cè)
5.2.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的觸角電位檢測(cè)
5.2.4 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的行為反應(yīng)檢測(cè)
5.3 結(jié)果與分析
5.3.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因的沉默效率
5.3.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的觸角電位反應(yīng)
5.3.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的行為反應(yīng)
5.4 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)況及聯(lián)系方式
本文編號(hào):3019403
【文章來源】:山西大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 昆蟲的嗅覺感器及嗅覺感受機(jī)制
1.2 昆蟲觸角細(xì)胞色素P450研究進(jìn)展
1.2.1 細(xì)胞色素P450
1.2.2 昆蟲觸角P450研究進(jìn)展
1.3 飛蝗嗅覺感受機(jī)制研究進(jìn)展
1.3.1 飛蝗概述
1.3.2 飛蝗嗅覺感受機(jī)制研究進(jìn)展
1.4 RNAi技術(shù)
1.5 觸角電位技術(shù)
1.6 行為實(shí)驗(yàn)技術(shù)
1.7 研究目的和意義
第二章 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組構(gòu)建及分析
2.1 材料與方法
2.1.1 供試蟲源
2.1.2 主要儀器設(shè)備
2.1.3 主要試劑
2.1.4 轉(zhuǎn)錄組樣品制備
2.1.5 RNA提取
2.1.6 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來源
2.1.7 序列的拼接和組裝
2.1.8 與各數(shù)據(jù)庫的功能注釋
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組測(cè)序產(chǎn)量與數(shù)據(jù)組裝統(tǒng)計(jì)
2.2.2 轉(zhuǎn)錄組單基因功能注釋
2.3 討論
第三章 飛蝗觸角細(xì)胞色素P450基因的搜索及篩選
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 供試蟲源
3.1.2 主要儀器設(shè)備
3.1.3 主要試劑
3.2 研究方法
3.2.1 飛蝗觸角轉(zhuǎn)錄組中細(xì)胞色素P450基因的搜索
3.2.2 細(xì)胞色素P450基因全長(zhǎng)驗(yàn)證、命名和理化特性分析
3.2.3 聚類樹構(gòu)建
3.2.4 飛蝗不同組織部位樣品制備
3.2.5 總RNA提取及cDNA合成
3.2.6 RT-PCR和RT-qPCR所用引物設(shè)計(jì)
3.2.7 RT-PCR檢測(cè)P450基因在不同組織部位的表達(dá)
3.2.8 RT-qPCR檢測(cè)P450基因在不同組織部位的表達(dá)
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 飛蝗觸角細(xì)胞色素P450搜索結(jié)果分析
3.3.2 聚類樹分析
3.3.3 基于RT-PCR的P450組織部位表達(dá)特性分析
3.3.4 基于RT-qPCR的細(xì)胞色素P450組織部位表達(dá)特性分析
3.4 討論
第四章 飛蝗觸角CYP6FD5和CYP6MU1基因的表達(dá)特性分析
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 供試蟲源
4.1.2 主要儀器設(shè)備
4.1.3 主要試劑
4.2 研究方法
4.2.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1全長(zhǎng)cDNA序列驗(yàn)證
4.2.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因序列分析
4.2.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1的聚類分析
4.2.4 飛蝗不同組織部位樣品制備
4.2.5 飛蝗觸角不同發(fā)育階段樣品制備
4.2.6 總RNA提取及cDNA合成
4.2.7 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因RT-qRCR引物設(shè)計(jì)
4.2.8 RT-qRCR檢測(cè)及數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因cDNA序列分析
4.3.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1的聚類分析
4.3.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因在不同組織部位的表達(dá)特性分析
4.3.4 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因在觸角不同發(fā)育階段的表達(dá)特性分析
4.4 討論
第五章 CYP6FD5和CYP6MU1基因在飛蝗嗅覺行為中的功能研究
5.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.1 供試蟲源
5.1.2 主要儀器
5.1.3 主要試劑
5.2 研究方法
5.2.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因dsRNA引物設(shè)計(jì)及體外合成
5.2.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默效率檢測(cè)
5.2.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的觸角電位檢測(cè)
5.2.4 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的行為反應(yīng)檢測(cè)
5.3 結(jié)果與分析
5.3.1 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因的沉默效率
5.3.2 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的觸角電位反應(yīng)
5.3.3 飛蝗CYP6FD5和CYP6MU1基因沉默后對(duì)氣味物質(zhì)的行為反應(yīng)
5.4 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)況及聯(lián)系方式
本文編號(hào):3019403
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