背景:甲狀腺癌（Thyroid carcinoma,TC）是內(nèi)分泌系統(tǒng)發(fā)病率最高的惡性腫瘤,發(fā)病率有逐年上升趨勢(shì),無(wú)論在全球還是中國(guó)范圍內(nèi),TC均成為發(fā)病率增長(zhǎng)最快的惡性腫瘤之一,其中甲狀腺乳頭狀癌（Papillary thyroid carcinoma,PTC）是最常見組織學(xué)類型。目前用于檢測(cè)和判斷預(yù)后的PTC相關(guān)基因標(biāo)記物有BRAF V600E基因、RAS基因突變和TERT啟動(dòng)子突變,蛋白標(biāo)志物有半乳糖凝集素-3（Galectin-3）、細(xì)胞角蛋白-19（CK19）、間皮瘤相關(guān)抗體-1（HBME-1）等。近年來(lái),蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展為深入研究PTC的分子標(biāo)志物,為探討PTC發(fā)病機(jī)制、明確診斷、發(fā)現(xiàn)治療新靶點(diǎn)提供更多可能。目的:1、篩查甲狀腺乳頭狀癌（PTC）和甲狀腺良性結(jié)節(jié)（BTN）差異表達(dá)蛋白;2、驗(yàn)證差異蛋白基因?qū)TC細(xì)胞增殖的影響,尋找與甲狀腺癌細(xì)胞增殖有關(guān)的新靶點(diǎn);3、檢測(cè)目標(biāo)蛋白在在PTC組織中的表達(dá)情況,并分析其與臨床病理參數(shù)之間的關(guān)系。方法:1、選取經(jīng)皮甲狀腺細(xì)針穿刺液標(biāo)本36例,BTN 18例為A（1-3）組,PTC18例為B（1-3）組,應(yīng)用非標(biāo)記定量（Label-f... 

【文章來(lái)源】：天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

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MaxQuant軟件進(jìn)行非標(biāo)記定量的原理

圖 1.4 質(zhì)譜分析 Basepeak 圖譜Figure 1.4 Mass Spectrometric Analysis of Basepeak Atlas表 1-5 質(zhì)譜分析結(jié)果（數(shù)據(jù)庫(kù)：uniprot HomoSapiens 20161205. fasta）Table 1-5 Mass Spectrometric Analysis Results (Database: UniProt HomoSapiens 20161205. fasta)良性甲狀腺結(jié)節(jié)BTN甲狀腺乳頭狀癌PTC編號(hào) 1 2 3 4 5 6樣本名稱A1組A2組A3組B1組B2組B3 組Protein group 308 247 241 800 547 641Protein group(Unique Peptide≥2)220 172 188 576 434 504

表 1-6 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì)Table 1-6 Statistics of Protein Identification ResultsDatabase Peptides Protein groupsHomoSapiens 10169 14391.2.4.2 肽段離子的得分分布本實(shí)驗(yàn)使用Andromeda[51]對(duì)質(zhì)譜圖譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，以Peptide FDR≤0.0和Protein FDR≤0.01作為L(zhǎng)abel free數(shù)據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn)，獲得MS圖譜的得分。根據(jù)鑒定到的肽段得分和肽段數(shù)量繪制肽段離子得分分布示意圖，橫坐標(biāo)為鑒定到的肽段得分；主縱坐標(biāo)Number of peptides表示鑒定到的對(duì)應(yīng)離子得分的肽段數(shù)量大部分位于50-120之間，對(duì)應(yīng)圖中的柱狀圖；次縱坐標(biāo)表示不高于對(duì)應(yīng)得分肽段所占的累積比例，分布較均勻，對(duì)應(yīng)圖中的紅色曲線，見下圖1-5，大約70%的肽段得分在60分以上，實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)質(zhì)量較好。


本文編號(hào)：3013878