仿刺參是我國重要的水產(chǎn)養(yǎng)殖對象,當海水溫度升高到一定范圍時會進入夏眠。夏眠過程延長養(yǎng)殖周期,增加養(yǎng)殖風險,是仿刺參研究領(lǐng)域的熱點。FoxO（Forkhead box O）作為轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,在調(diào)節(jié)體內(nèi)活性氧（ROS）的水平及細胞增殖分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、應(yīng)激調(diào)控、免疫調(diào)節(jié)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑等方面起重要作用,Nrf1（NF-E2-related factor1）作為轉(zhuǎn)錄因子,在遭到氧化應(yīng)激時被Keap1（kelch-like ECH-associated protein-1）激活,結(jié)合抗氧化反應(yīng)元素ARE,它調(diào)節(jié)一系列抗氧化基因并參與氧化應(yīng)激。過氧化物氧還蛋白（Prx）是生物體抗氧化系統(tǒng)的重要組成部分。因此FoxO、Keap1、Nrf1、及Prxs重要防御調(diào)控基因?qū)τ诳寡趸烙到y(tǒng)有重要作用。本研究將選定的抗氧化防御調(diào)控基因與多個物種的氨基酸序列進行比較,進行多重序列比對和同源性分析以確定其序列的可靠性。為了研究夏眠對仿刺參各組織抗氧化功能及FoxO、Keap1、Nrf1、Prxs基因表達的影響,將仿刺參以15士0.5℃暫養(yǎng)7 d后,以1℃/d升溫直至達到目的溫度,之后保持25±0.5℃范圍10 d... 

【文章來源】：大連海洋大學遼寧省

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

仿刺參FoxO氨基酸序列與其他物種的FoxO氨基酸序列的多序列比對根據(jù)一致性不同用不同程度的暗色背景顯示

圖 2-2 仿刺參Keap1氨基酸序列與其他物種的Keap1氨基酸序列的多序列比對根據(jù)一致性不同用不同程度的暗色背景顯示。用來進行比對的序列包括：紫色球海膽Strongylocentrotus purpuratus 的XP_003724241.1，棘冠海星Acanthaster planci的XP_022109754.1，斑馬魚Danio rerio的 NP_878284.2，人Homo sapiens的NP_987096.1。Fig.2-2 Multiple sequence alignment analysis of Keap1 partial sequences from A. japonicus andother species. Different degrees of dark background are displayed according to the consistency.（3）篩選獲得的仿刺參 Nrf1 基因片段長為 939bp，推導(dǎo)的氨基酸序列長為313aa，將其氨基酸序列 NCBI 數(shù)據(jù)庫中篩選出的紫色球海膽（S.purpurat-us；XP_011683764.1）、棘冠海星（A. planci; XP_022081665.1）、斑馬魚（D. rerio;AAH44537.1）、人（H.sapiens; AAH16925.1）氨基酸序列進行比對，發(fā)現(xiàn) Nrf1和大多數(shù)動物有著較高的序列相似性，相似性為 24%-56% ，其中與棘皮動物的氨基酸相似性為 56% ，非棘皮動物的氨基酸相似性為 24%，與多個物種的氨

圖 2-3 仿刺參Nrf1氨基酸序列與其他物種的Nrf1氨基酸序列的多序列比對根據(jù)一致性不同用不同程度的暗色背景顯示。用來進行比對的序列包括：紫色球海膽Strongylocentrotus purpuratus 的XP_011683764.1，棘冠海星Acanthaster planci的XP_022081665.1，斑馬魚Danio rerio 的AAH44537.1，人Homo sapiens 的AAH16925.1。Fig.2-3 Multiple sequence alignment analysis of Nrf1 partial sequences from A. japonicus andother species. Different degrees of dark background are displayed according to the consistency.（4）篩選獲得的仿刺參 PRDX2 基因片段長為 342bp，推導(dǎo)的氨基酸序列長為 114aa，將其氨基酸序列 NCBI 數(shù)據(jù)庫中篩選出的紫色球海膽（S.purpur-atus;AHJ80827.1 ） 、 日 本 沼 蝦 （ M.nipponensei; ALD62538.1 ） 、 阿 根 廷 蟻（L.humile；XP_012221533.1）、大蜜蜂（A.dorsata;XP_006621026.1）氨基酸序列進行比對，發(fā)現(xiàn) PRDX2 和大多數(shù)軟體動物有著較高的序列相似性，相似性為 66%-83% ，其中棘皮動物氨基酸相似性為 83% ，非棘皮動物的氨基酸相

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本文編號：3008104