大白菜早抽薹突變基因ebm4的定位及克隆
發(fā)布時間:2021-01-23 11:16
大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)屬于十字花科蕓薹屬,是中國傳統(tǒng)的蔬菜,其栽培面積和產(chǎn)量在中國居各類蔬菜之首。抽薹是大白菜由營養(yǎng)生長向生殖生長轉(zhuǎn)變的關(guān)鍵發(fā)育事件。先期抽薹會導(dǎo)致春季白菜或高山白菜嚴(yán)重減產(chǎn)甚至絕收。大白菜進(jìn)化出復(fù)雜而精細(xì)的調(diào)控機(jī)制嚴(yán)格控制抽薹時間,但是該調(diào)控機(jī)制尚不明了。因此,創(chuàng)制早、晚抽薹突變體,挖掘調(diào)控大白菜抽薹的重要節(jié)點(diǎn)基因,無疑具有重要的理論意義和應(yīng)用價值。1.以大白菜DH系(‘FT’)萌發(fā)種子為誘變材料,利用0.8%EMS處理12小時,然后流水處理12小時,最終獲得528個M0誘變株系,其中有6個不同株系內(nèi)出現(xiàn)早抽薹突變植株,經(jīng)過M2和M3代連續(xù)鑒定,均表現(xiàn)為早抽薹,分別命名為ebm3、ebm4、ebm5、ebm6和ebm7、ebm8。2.相較于野生型‘FT’,大白菜早抽薹突變體ebm4在秋季不經(jīng)過春化就可實(shí)現(xiàn)抽薹開花,沒有明顯的結(jié)球階段。遺傳分析表明,該突變性狀是由單隱性核基因(ebm4)控制。3.采用改良的MutMap方法對ebm4進(jìn)行了基因定位,26個突變位點(diǎn)...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 抽薹開花的遺傳和分子機(jī)制
1.1.1 抽薹開花的遺傳機(jī)制
1.1.2 抽薹開花的分子機(jī)制
1.2 開花整合因子與花分生組織
1.3 DNA測序技術(shù)的發(fā)展及其應(yīng)用
1.3.1 DNA測序技術(shù)的發(fā)展
1.3.2 DNA測序技術(shù)在轉(zhuǎn)錄組分析中的應(yīng)用
第二章 大白菜早抽薹突變基因ebm4 的定位
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 大白菜早抽薹突變體ebm4 的遺傳分析
2.1.3 定位群體的構(gòu)建與候選基因的預(yù)測
2.1.4 候選基因的定位
2.1.5 候選基因的序列分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 大白菜早抽薹突變體ebm4 的遺傳分析
2.2.2 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量分析
2.2.3 候選基因的預(yù)測
2.2.4 候選基因的定位
2.2.5 候選基因的序列分析
第三章 大白菜早抽薹突變體ebm4 的轉(zhuǎn)錄組分析
3.1 材料與方法
3.1.1 總RNA提取檢測
3.1.2 構(gòu)建c DNA文庫及RNA-Seq
3.1.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)處理
3.1.4 參考序列比對分析
3.1.5 基因差異表達(dá)分析
3.1.6 差異表達(dá)基因的GO與 KEGG富集分析
3.1.7 qRT-PCR分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 總RNA的質(zhì)量檢測
3.2.2 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量分析
3.2.3 參考序列比對分析
3.2.4 差異表達(dá)基因分析
3.2.5 差異表達(dá)基因的GO富集分析
3.2.6 差異表達(dá)基因的KEGG富集分析
3.2.7 qRT-PCR驗(yàn)證
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]菜薹乳白色花突變體的遺傳規(guī)律研究及瓣化型細(xì)胞質(zhì)不育系的應(yīng)用[J]. 張德雙,李佩榮,張鳳蘭,余陽俊,趙岫云,于拴倉,汪維紅,蘇同兵,辛?xí)栽?盧桂香. 中國蔬菜. 2019(02)
[2]木本植物EMS誘變育種研究進(jìn)展[J]. 高文杰,陳敏健,劉愛琴,帥鵬. 分子植物育種. 2019(20)
[3]轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展和應(yīng)用[J]. 王楚彪,盧萬鴻,林彥,羅建中. 桉樹科技. 2018(04)
[4]光周期途徑成花關(guān)鍵基因GIGANTEA和CONSTANS的研究進(jìn)展[J]. 帥敏敏,黃有軍. 分子植物育種. 2018(17)
[5]擬南芥成花調(diào)控途徑的研究進(jìn)展[J]. 齊仙惠,巫東堂,李改珍,趙軍良,李梅蘭. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(09)
[6]多年生黑麥草EMS誘變與耐旱性評價[J]. 董文科,路旭平,姜寒玉,馬暉玲. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(10)
[7]黃秋葵果實(shí)轉(zhuǎn)錄組測序及分析[J]. 李和平,姚運(yùn)法,練冬梅,賴正鋒,洪建基. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(03)
[8]改良CTAB法用于蘋果果實(shí)基因組DNA的提取[J]. 閆玖英,馬長青,常博,范獻(xiàn)光,李征,楊亞州,趙政陽. 分子植物育種. 2017(09)
[9]基于全基因組測序的MutMap方法在正向遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 袁金紅,李俊華,袁嬌嬌,賈克利,李書粉,鄧傳良,高武軍. 遺傳. 2017(12)
[10]鵝等級前卵泡組織轉(zhuǎn)錄組測序分析[J]. 孫永峰,武惠巖,王子遒,路洪濤,李書哲,楊威,隋玉健. 中國畜牧雜志. 2017(06)
博士論文
[1]小尾寒羊和杜泊羊臂二頭肌轉(zhuǎn)錄組及肌球蛋白輕鏈基因家族結(jié)構(gòu)特征分析[D]. 張春蘭.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]大白菜葉片黃化突變基因lcm3的克隆與鑒定[D]. 侯愛琳.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]甘藍(lán)TT8及WD40轉(zhuǎn)錄因子影響花青素合成及開花時間的研究[D]. 周雯.西南大學(xué) 2017
本文編號:2995119
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 抽薹開花的遺傳和分子機(jī)制
1.1.1 抽薹開花的遺傳機(jī)制
1.1.2 抽薹開花的分子機(jī)制
1.2 開花整合因子與花分生組織
1.3 DNA測序技術(shù)的發(fā)展及其應(yīng)用
1.3.1 DNA測序技術(shù)的發(fā)展
1.3.2 DNA測序技術(shù)在轉(zhuǎn)錄組分析中的應(yīng)用
第二章 大白菜早抽薹突變基因ebm4 的定位
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 大白菜早抽薹突變體ebm4 的遺傳分析
2.1.3 定位群體的構(gòu)建與候選基因的預(yù)測
2.1.4 候選基因的定位
2.1.5 候選基因的序列分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 大白菜早抽薹突變體ebm4 的遺傳分析
2.2.2 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量分析
2.2.3 候選基因的預(yù)測
2.2.4 候選基因的定位
2.2.5 候選基因的序列分析
第三章 大白菜早抽薹突變體ebm4 的轉(zhuǎn)錄組分析
3.1 材料與方法
3.1.1 總RNA提取檢測
3.1.2 構(gòu)建c DNA文庫及RNA-Seq
3.1.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)處理
3.1.4 參考序列比對分析
3.1.5 基因差異表達(dá)分析
3.1.6 差異表達(dá)基因的GO與 KEGG富集分析
3.1.7 qRT-PCR分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 總RNA的質(zhì)量檢測
3.2.2 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量分析
3.2.3 參考序列比對分析
3.2.4 差異表達(dá)基因分析
3.2.5 差異表達(dá)基因的GO富集分析
3.2.6 差異表達(dá)基因的KEGG富集分析
3.2.7 qRT-PCR驗(yàn)證
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]菜薹乳白色花突變體的遺傳規(guī)律研究及瓣化型細(xì)胞質(zhì)不育系的應(yīng)用[J]. 張德雙,李佩榮,張鳳蘭,余陽俊,趙岫云,于拴倉,汪維紅,蘇同兵,辛?xí)栽?盧桂香. 中國蔬菜. 2019(02)
[2]木本植物EMS誘變育種研究進(jìn)展[J]. 高文杰,陳敏健,劉愛琴,帥鵬. 分子植物育種. 2019(20)
[3]轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展和應(yīng)用[J]. 王楚彪,盧萬鴻,林彥,羅建中. 桉樹科技. 2018(04)
[4]光周期途徑成花關(guān)鍵基因GIGANTEA和CONSTANS的研究進(jìn)展[J]. 帥敏敏,黃有軍. 分子植物育種. 2018(17)
[5]擬南芥成花調(diào)控途徑的研究進(jìn)展[J]. 齊仙惠,巫東堂,李改珍,趙軍良,李梅蘭. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(09)
[6]多年生黑麥草EMS誘變與耐旱性評價[J]. 董文科,路旭平,姜寒玉,馬暉玲. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(10)
[7]黃秋葵果實(shí)轉(zhuǎn)錄組測序及分析[J]. 李和平,姚運(yùn)法,練冬梅,賴正鋒,洪建基. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(03)
[8]改良CTAB法用于蘋果果實(shí)基因組DNA的提取[J]. 閆玖英,馬長青,常博,范獻(xiàn)光,李征,楊亞州,趙政陽. 分子植物育種. 2017(09)
[9]基于全基因組測序的MutMap方法在正向遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 袁金紅,李俊華,袁嬌嬌,賈克利,李書粉,鄧傳良,高武軍. 遺傳. 2017(12)
[10]鵝等級前卵泡組織轉(zhuǎn)錄組測序分析[J]. 孫永峰,武惠巖,王子遒,路洪濤,李書哲,楊威,隋玉健. 中國畜牧雜志. 2017(06)
博士論文
[1]小尾寒羊和杜泊羊臂二頭肌轉(zhuǎn)錄組及肌球蛋白輕鏈基因家族結(jié)構(gòu)特征分析[D]. 張春蘭.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]大白菜葉片黃化突變基因lcm3的克隆與鑒定[D]. 侯愛琳.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]甘藍(lán)TT8及WD40轉(zhuǎn)錄因子影響花青素合成及開花時間的研究[D]. 周雯.西南大學(xué) 2017
本文編號:2995119
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