星豹蛛CYP3313A3基因克隆與生物信息學分析
發(fā)布時間:2021-01-23 06:47
[目的]星豹蛛是農(nóng)業(yè)害蟲的重要捕食性天敵,本課題組通過轉(zhuǎn)錄組測序鑒定出66條星豹蛛細胞色素P450基因,篩選分析出5條基因預(yù)測其與外源物質(zhì)代謝有關(guān),選取其中一條基因進行克隆并進行生物信息學分析。[方法]本試驗采用RT-PCR技術(shù),將提取的星豹蛛總RNA進行反轉(zhuǎn)錄PCR擴增,用割膠回收的擴增產(chǎn)物完成克隆及測序,并對CYP3313A3基因編碼產(chǎn)物進行生物信息學分析。[結(jié)果]克隆到CYP3313A3基因序列,該基因開放閱讀框為906bp,編碼301個氨基酸,其相對分子質(zhì)量為34. 38 kDa,等電點6. 12,原子總數(shù)4 865,分子式C1546H2451N403O449S16;其中正電荷殘基36個,占氨基酸總數(shù)的12%,負電荷殘基39個,占氨基酸總數(shù)的13%,編碼蛋白存在細胞色素P450 3A亞族特征基序,其編碼的蛋白的二級結(jié)構(gòu)中,α螺旋為45. 18%,β折疊為14. 29%,β轉(zhuǎn)角為3. 32%,無規(guī)則卷曲為37. 21%,亞細胞定位結(jié)果顯示在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上。對其編碼的蛋白進行信號...
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2020,40(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗材料
1.2 主要試劑
1.3 星豹蛛總RNA的提取及cDNA的合成
1.4 CYP3313A3基因克隆
1.5 CYP3313A3基因及其編碼產(chǎn)物的生物信息學分析
2 結(jié)果與分析
2.1 CYP3313A3基因克隆
2.2 CYP3313A3編碼的蛋白理化性質(zhì)分析
2.3 CYP3313A3跨膜預(yù)測、信號肽和亞細胞定位分析
2.4 CYP3313A3編碼的蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
2.5 CYP3313A3編碼的蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.6 系統(tǒng)發(fā)育分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]家蠶抗性基因細胞色素P450的研究進展[J]. 高瑞娜. 特種經(jīng)濟動植物. 2019(04)
[2]薇甘菊頸盲蝽細胞色素P450 PmCYP4基因克隆及表達分析[J]. 張傳光,澤桑梓,朱家穎,季梅,劉凌,張乃明. 生物安全學報. 2019(01)
[3]除草劑對星豹蛛活動行為的影響[J]. 袁澤斌,郭鋼鋼,白曉雪,?¢,李慧芳,李銳. 植物保護學報. 2017(02)
[4]3種重金屬對星豹蛛SOD與CAT活性的影響[J]. 張曉陽,馬敏,李銳,李生才. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2015(06)
[5]溫度誘導(dǎo)對星豹蛛熱激蛋白hsp70和hsp90基因表達的影響[J]. 李銳,劉佳,李薩麗,李娜,李生才,洪堅平. 植物保護學報. 2015(03)
[6]低劑量殺蟲劑對星豹蛛捕食效應(yīng)的影響及其機理[J]. 李銳,李娜,劉佳,李生才,洪堅平. 生態(tài)學報. 2014(10)
[7]家蠶細胞色素P450基因CYP6AE2的分子克隆與序列分析[J]. 艾均文,董元凌,孔衛(wèi)青,楊金宏,劉勁,張永亮,張學松,柳照應(yīng),朱勇. 蠶業(yè)科學. 2007(03)
[8]昆蟲細胞色素P450基因的克隆及其策略[J]. 李顯春,王蔭長,韓召軍. 華東昆蟲學報. 1999(02)
博士論文
[1]飛蝗細胞色素P450基因的分子特性及功能研究[D]. 郭艷瓊.山西大學 2012
碩士論文
[1]星豹蛛生物學研究及卵黃蛋白特性分析[D]. 姬娜.山西農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]基于轉(zhuǎn)錄組測序的星豹蛛細胞色素P450的基因鑒定與差異表達分析[D]. 李薩麗.山西農(nóng)業(yè)大學 2017
本文編號:2994760
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2020,40(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗材料
1.2 主要試劑
1.3 星豹蛛總RNA的提取及cDNA的合成
1.4 CYP3313A3基因克隆
1.5 CYP3313A3基因及其編碼產(chǎn)物的生物信息學分析
2 結(jié)果與分析
2.1 CYP3313A3基因克隆
2.2 CYP3313A3編碼的蛋白理化性質(zhì)分析
2.3 CYP3313A3跨膜預(yù)測、信號肽和亞細胞定位分析
2.4 CYP3313A3編碼的蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
2.5 CYP3313A3編碼的蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.6 系統(tǒng)發(fā)育分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]家蠶抗性基因細胞色素P450的研究進展[J]. 高瑞娜. 特種經(jīng)濟動植物. 2019(04)
[2]薇甘菊頸盲蝽細胞色素P450 PmCYP4基因克隆及表達分析[J]. 張傳光,澤桑梓,朱家穎,季梅,劉凌,張乃明. 生物安全學報. 2019(01)
[3]除草劑對星豹蛛活動行為的影響[J]. 袁澤斌,郭鋼鋼,白曉雪,?¢,李慧芳,李銳. 植物保護學報. 2017(02)
[4]3種重金屬對星豹蛛SOD與CAT活性的影響[J]. 張曉陽,馬敏,李銳,李生才. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2015(06)
[5]溫度誘導(dǎo)對星豹蛛熱激蛋白hsp70和hsp90基因表達的影響[J]. 李銳,劉佳,李薩麗,李娜,李生才,洪堅平. 植物保護學報. 2015(03)
[6]低劑量殺蟲劑對星豹蛛捕食效應(yīng)的影響及其機理[J]. 李銳,李娜,劉佳,李生才,洪堅平. 生態(tài)學報. 2014(10)
[7]家蠶細胞色素P450基因CYP6AE2的分子克隆與序列分析[J]. 艾均文,董元凌,孔衛(wèi)青,楊金宏,劉勁,張永亮,張學松,柳照應(yīng),朱勇. 蠶業(yè)科學. 2007(03)
[8]昆蟲細胞色素P450基因的克隆及其策略[J]. 李顯春,王蔭長,韓召軍. 華東昆蟲學報. 1999(02)
博士論文
[1]飛蝗細胞色素P450基因的分子特性及功能研究[D]. 郭艷瓊.山西大學 2012
碩士論文
[1]星豹蛛生物學研究及卵黃蛋白特性分析[D]. 姬娜.山西農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]基于轉(zhuǎn)錄組測序的星豹蛛細胞色素P450的基因鑒定與差異表達分析[D]. 李薩麗.山西農(nóng)業(yè)大學 2017
本文編號:2994760
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