動態(tài)基因調(diào)控網(wǎng)是展現(xiàn)生物體內(nèi)基因與基因之間相互關(guān)系隨時間變化而變化的動力學(xué)行為的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò).這種相互作用關(guān)系可以分為兩類:激勵和抑制.對動態(tài)基因調(diào)控網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)演化的研究,可以預(yù)測未來時刻生物體內(nèi)的基因調(diào)控關(guān)系,從而在疾病預(yù)測和診斷、藥物開發(fā)、生物學(xué)實驗等領(lǐng)域起到重要的指導(dǎo)和輔助作用.現(xiàn)實世界中,動態(tài)基因調(diào)控網(wǎng)的網(wǎng)絡(luò)演化是一個復(fù)雜而巨大的系統(tǒng),當(dāng)前,對于其演化機(jī)制的研究存在只關(guān)注靜態(tài)網(wǎng)絡(luò)而忽略動態(tài)網(wǎng)絡(luò)和只關(guān)注相互作用關(guān)系而忽略相互作用類型的缺陷.針對上述問題,提出了一種動態(tài)基因調(diào)控網(wǎng)演化分析方法（dynamic gene regulatory network evolution analyzing method,簡稱DGNE）,將研究擴(kuò)展到了動態(tài)帶符號網(wǎng)絡(luò)領(lǐng)域.通過該方法包含的基于模體轉(zhuǎn)換概率的連邊預(yù)測算法（link prediction algorithm based on motif transfer probability,簡稱MT）和基于隱空間特征的符號判別算法,能夠動態(tài)地捕捉基因調(diào)控網(wǎng)的演化機(jī)制,并準(zhǔn)確地預(yù)測未來時刻基因調(diào)控網(wǎng)的連邊情況.實驗結(jié)果表明,DGNE方法在仿真數(shù)據(jù)集和真實數(shù)... 

【文章來源】：軟件學(xué)報. 2020,31(11)北大核心

【文章頁數(shù)】：17 頁

【部分圖文】：

Fig.6ROCcurvesunderdifferentmodelsandparameters圖6各模型及參數(shù)下的ROC曲線

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]面向節(jié)點演化波動的社會網(wǎng)絡(luò)事件檢測方法[J]. 胡文斌,王歡,嚴(yán)麗平,邱振宇,聶聰,杜博.  軟件學(xué)報. 2017(10)
[2]混合指標(biāo)量子群智能社會網(wǎng)絡(luò)事件檢測方法[J]. 胡文斌,王歡,嚴(yán)麗平,邱振宇,肖雷,杜博.  軟件學(xué)報. 2016(11)



本文編號：2994428