發(fā)布時間：2021-01-22 04:57

　　乳腺癌是發(fā)生在乳腺腺上皮組織的惡性腫瘤,居女性惡性腫瘤的第一位,乳腺癌信息的存儲和預判具有重要意義。mRNA和乳腺鉬靶X線攝影成像能夠?qū)θ橄侔┻M行早期診斷。本文對乳腺組織數(shù)據(jù)依次做了存儲、因子篩選與分類,形成一套完整的存儲與分析的流程�；谌橄侔┙M織和正常組織的mRNA表達水平數(shù)據(jù)和乳腺鉬靶X線攝影成像,將乳腺組織信息以基因的信息存儲在試管中。將數(shù)字信息轉(zhuǎn)化為三進制基因編碼,首尾相連地將長鏈基因分割為基因片段,并添加前引物、后引物和糾錯位�？紤]到一個信息存儲試驗管的“不安全性”,本文采取了分布式的存儲方法。將信息存儲在若干個試管中,依照同余數(shù)錯位剔除信息的方法提出每個試管中的一點信息,這樣只有在所有試管都存在的時候才能夠恢復原始信息。添加一定的人為擾動后,通過基因池中的基因序列逐相對比可以恢復為原來的信息。進行計算機模擬,發(fā)現(xiàn)錯誤率非常低,魯棒性高且安全性強。利用乳腺組織的開源數(shù)據(jù)集——來自不同乳腺組織的mRNA表達數(shù)據(jù)進行拓撲數(shù)據(jù)分析,用線性判別方法進行降維。構(gòu)建1133維mRNA數(shù)據(jù)的單純復形及其鏈復形,計算其邊界算子尋找鏈復形的所有邊緣,計算化簡后的邊界算子的秩的差得到了 Bet... 

【文章來源】：哈爾濱工業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－２?首尾相連”的基因存儲樓型??在這個模型中ｆ每一條鏈與前面一條鏈有７５％的重合，當前面一條鏈確定后，??后面一條鏈Ｓ然而然可以確定，并且有很高的概率不會與其他鏈重合

??．?哈第窮：￡業(yè)大＿學■娜位論文??綜合上述幾點要求，模型示意圖如下圖２－４所示，其中，黑色區(qū)域為刪除的基??ＣＤＮ＾?！?？?！?ｊ?ｉ?ｉ?；?ｉ?｜?；?ｉ?｜??＿；ｒ筆編‘?Ｊ?｜??丨雜??Ｖ?Ｖ．Ｖ．４Ｖ?乂?Ｊ．寺．??刪除部分位點?１??ａ）存儲在第一個試驗管中的核糖核苷酸鏈??ＣＤＮＡ長篳????１?｜?｜?Ｉ?｜?｜???ＤＮＡ?片段?｜Ｊ｜?Ｈ??Ｖ?Ｖ?＇?４Ｖ?＇?Ｖ?＇?Ｖ?Ｗ?Ｙ??刪除部分位點??ｂ）存儲在第一個試驗管中的核糖核苷酸鏈??ＣＤ，＿?�。。。。�！?ｆ?ｉ?ｉ??ｄｎａ｜?片?ｔ?—ｆ?Ｅｔｉｊｄ?Ｊ?：?；?１?：??ｌ??�。�！?ｗＶ?�。觯。�！?ｗ?�。妫。椋�??刪除部分位點?Ｉ??ｃ）存儲在第一個試驗管中的核糖核苷酸鏈??ＣＤＮ今長蘋?｜?｜?ｉ?：：?：??＇■…丨丨「ｒｒ??！?Ｗ?�。�?！?Ｖｓ?ｗ?�。�?！?Ｊ??刪除部分位點?Ｉ??ｄ）存儲在第一個試驗管中的核糖核苷酸鏈??圖２－４分布式菌．因存儲模塑??存儲的時候，一份信息會存入到四個實驗管中，每個實驗管按上述模型存儲內(nèi)??容。為了區(qū)分這四個存儲模型，在模型中添加兩條特殊的鏈。在第＿個模型中，重??復“ＧＴＣＡ”得到長度為１００的鏈，該鏈翻譯過來就是“５３４，?４３７，?２９１，４３７，?”，??－９－??

?轉(zhuǎn)灣隹歡???若使用該模型，１克ＤＮＡ不到指尖上＾滴露珠大小，卻能夠存儲１７５?ＴＢ的??數(shù)據(jù)。相爾于３５００張５０?ＧＢ容量的藍光光盤，或５８個３?ＴＢ的硬盤（其質(zhì)最大約??有３８?ｋｇ）。該模型將為海聾信息提供安全高效的存儲環(huán)境。??２．３．３編碼效果分析??首先建立了一個０重復糾錯模型”，將某份７０?ＫＢ的文本的數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)換，變??成＿因數(shù)據(jù)Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｇ；重復若干次；模報存儲池中的擾動一即以低于ｐ?＝?０．０３??的概率讓每個基因發(fā)生突變；進行重復糾錯，恢復數(shù)據(jù)，檢查“重復糾錯模型１勺糾??錯能力，得到下圖２－５：??｜：）??。°??圖２－５重復次數(shù)、擾動概率與錯誤率的三．＿關(guān)系圖??從上面的三維圖中，我們可以看到重復８次的效果是完美的。制作上圖的橫??截面，并觀察８次針對不同千擾概率的糾錯效果，如圖２－６所示《可以觀察到當擾??動概率小于０．０４的時候，存儲錯誤率小于１（Ｔ５，這個時候存儲效率是接近無損的。??０．０４??１?１?１?１?１?１?１?１?１?１??０．０３５?－??０．０３?－?／?Ａ??０．０２５?－?／?－＼??Ｉ??４＾?〇．〇２?－??０．０１５?－?／?－ｊ??０．０１?－?ｊ??０．００５?－?，??〇０?０．０２?０．０４?０．０６?０．０８?０．１?０．１２?０．１４?０．１６?０．１８?０．２??擾動概率??圖２－６重復８次的存儲效率圖??－１１－??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]DNA計算機中基于順序存儲方式的二叉樹數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)[J]. 朱雅莉,李肯立.  計算機應用. 2008(06)
[2]數(shù)據(jù)存儲新方向:DNA分子存儲技術(shù)[J]. 崔光照,劉玉琳,張勛才.  計算機工程與應用. 2006(26)

碩士論文
[1]面向乳腺癌數(shù)據(jù)的單純復形建模方法及拓撲不變量分析[D]. 陳劍楠.哈爾濱工業(yè)大學 2018
[2]機器學習的拓撲結(jié)構(gòu)研究[D]. 謝子雨.復旦大學 2013



本文編號：2992597