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基于CRISPR/Cas9的水稻ALOG家族成員基因敲除突變體的構(gòu)建及其成員G1L6的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究

發(fā)布時間:2021-01-21 02:26
  ALOG(ArabidopsisLSH1andOryza G1)基因家族成員廣泛存在于陸生植物中,并在其生長發(fā)育的過程中起到關(guān)鍵的作用。在水稻中ALOG基因家族共有10個成員(Gi,G1I1~G1L9)。其中三個成員(G1,G1L5和G1L6)的功能已被研究,它們都參與了水稻花發(fā)育的過程,而其它7個成員的功能尚屬未知。本項目主要關(guān)注水稻功能未知的7個ALOG基因和已經(jīng)報道過的G1L6基因,通過CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù),構(gòu)建它們的基因敲除株系,并進一步地構(gòu)建基因過表達株系,以此來研究它們的基因功能。觀察發(fā)現(xiàn),所有的基因家族成員過表達株系都沒有明顯的發(fā)育缺陷表型,而大多數(shù)的家族成員的基因敲除株系也沒有明顯的發(fā)育缺陷表型(G1L1和G1L2的基因敲除株系除外)。考慮到這些基因家族成員之間序列有相似性,這種家族內(nèi)單基因突變未出現(xiàn)缺陷表型的原因可能跟他們之間功能冗余性有關(guān)。G1L6轉(zhuǎn)基因敲除植株表型跟之前報道過的內(nèi)外稃變窄,呈現(xiàn)“鳥嘴”狀的表型很相似,但是其純合植株表現(xiàn)出明顯的不育性狀。G1L1和G1L2的轉(zhuǎn)基因敲除株系表現(xiàn)出穗發(fā)育缺陷的表型,具體表現(xiàn)為主穗軸變長,而且上面的小穗變少。... 

【文章來源】:廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】:78 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于CRISPR/Cas9的水稻ALOG家族成員基因敲除突變體的構(gòu)建及其成員G1L6的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究


通過~lappingPCR方法構(gòu)建sgRNA表達盒方法示意圖

轉(zhuǎn)錄組,實驗流程,測序,檢測指標


圖2-2轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒灹鞒虉D??Fig.?2-2?The?flow?diagram?of?RNA-seq??樣品的質(zhì)量好壞是整個實驗是否成下方法對樣品進行檢測,檢測結(jié)果A的純度(OD260/280)、濃度、核酸檢測1^六的完整性,檢測指標包括:檢測合格后,便可以進行文庫的構(gòu)建品的二級結(jié)構(gòu),用帶有Oligo(dT)的26??

轉(zhuǎn)錄組,生物信息,分析流程,測序


.??上機測序??圖2-2轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒灹鞒虉D??Fig.?2-2?The?flow?diagram?of?RNA-seq??2.3.2?RN?A樣品檢測??高通量測序的RNA樣品的質(zhì)量好壞是整個實驗是否成功的基礎(chǔ),為保證得到高質(zhì)??量的數(shù)據(jù),本實驗采用以下方法對樣品進行檢測,檢測結(jié)果達到要求后方可進行建庫:??1)


本文編號:2990266

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