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基于CRISPR/Cas9的水稻ALOG家族成員基因敲除突變體的構(gòu)建及其成員G1L6的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究

發(fā)布時(shí)間:2021-01-21 02:26
  ALOG(ArabidopsisLSH1andOryza G1)基因家族成員廣泛存在于陸生植物中,并在其生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中起到關(guān)鍵的作用。在水稻中ALOG基因家族共有10個(gè)成員(Gi,G1I1~G1L9)。其中三個(gè)成員(G1,G1L5和G1L6)的功能已被研究,它們都參與了水稻花發(fā)育的過(guò)程,而其它7個(gè)成員的功能尚屬未知。本項(xiàng)目主要關(guān)注水稻功能未知的7個(gè)ALOG基因和已經(jīng)報(bào)道過(guò)的G1L6基因,通過(guò)CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù),構(gòu)建它們的基因敲除株系,并進(jìn)一步地構(gòu)建基因過(guò)表達(dá)株系,以此來(lái)研究它們的基因功能。觀察發(fā)現(xiàn),所有的基因家族成員過(guò)表達(dá)株系都沒(méi)有明顯的發(fā)育缺陷表型,而大多數(shù)的家族成員的基因敲除株系也沒(méi)有明顯的發(fā)育缺陷表型(G1L1和G1L2的基因敲除株系除外)。考慮到這些基因家族成員之間序列有相似性,這種家族內(nèi)單基因突變未出現(xiàn)缺陷表型的原因可能跟他們之間功能冗余性有關(guān)。G1L6轉(zhuǎn)基因敲除植株表型跟之前報(bào)道過(guò)的內(nèi)外稃變窄,呈現(xiàn)“鳥(niǎo)嘴”狀的表型很相似,但是其純合植株表現(xiàn)出明顯的不育性狀。G1L1和G1L2的轉(zhuǎn)基因敲除株系表現(xiàn)出穗發(fā)育缺陷的表型,具體表現(xiàn)為主穗軸變長(zhǎng),而且上面的小穗變少。... 

【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于CRISPR/Cas9的水稻ALOG家族成員基因敲除突變體的構(gòu)建及其成員G1L6的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究


通過(guò)~lappingPCR方法構(gòu)建sgRNA表達(dá)盒方法示意圖

轉(zhuǎn)錄組,實(shí)驗(yàn)流程,測(cè)序,檢測(cè)指標(biāo)


圖2-2轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程圖??Fig.?2-2?The?flow?diagram?of?RNA-seq??樣品的質(zhì)量好壞是整個(gè)實(shí)驗(yàn)是否成下方法對(duì)樣品進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果A的純度(OD260/280)、濃度、核酸檢測(cè)1^六的完整性,檢測(cè)指標(biāo)包括:檢測(cè)合格后,便可以進(jìn)行文庫(kù)的構(gòu)建品的二級(jí)結(jié)構(gòu),用帶有Oligo(dT)的26??

轉(zhuǎn)錄組,生物信息,分析流程,測(cè)序


.??上機(jī)測(cè)序??圖2-2轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程圖??Fig.?2-2?The?flow?diagram?of?RNA-seq??2.3.2?RN?A樣品檢測(cè)??高通量測(cè)序的RNA樣品的質(zhì)量好壞是整個(gè)實(shí)驗(yàn)是否成功的基礎(chǔ),為保證得到高質(zhì)??量的數(shù)據(jù),本實(shí)驗(yàn)采用以下方法對(duì)樣品進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果達(dá)到要求后方可進(jìn)行建庫(kù):??1)


本文編號(hào):2990266

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