由蕓薹根腫菌（Plasmodiophora brassicae）侵染引起的根腫病威脅到十字花科作物的生產(chǎn)。因此,培育具有廣譜抗病性的作物品種是防治根腫病最有效的方法之一。此前的一些研究定位了一些根腫病抗性基因,這些基因基因表現(xiàn)出了對(duì)蕓薹根腫菌的特異性抗性。然而,目前被克隆的抗根腫病基因并不多,對(duì)抗根腫病基因進(jìn)行功能驗(yàn)證的以及大白菜對(duì)致病型與非致病型根腫菌的防御機(jī)制知之甚少。本研究發(fā)掘并定位了CRd抗病位點(diǎn),并對(duì)候選基因進(jìn)行克隆及轉(zhuǎn)擬南芥進(jìn)行功能驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:1.CRd基因的定位及候選基因的預(yù)測(cè)本研究所使用的親本材料為大白菜自交系“85-74”（抗根腫�。┖汀癇JN3-1”（感根腫�。�,“85-74”自交系表現(xiàn)出了對(duì)生理小種4的根腫菌“LAB-19”的抗性;通過基于二代測(cè)序的集群分離分析方法結(jié)合遺傳作圖在大白菜自交系“85-74”和“BJN3-1”雜交產(chǎn)生的F₂分離群體中定位抗根腫病基因。遺傳分析顯示,其抗病性是由單個(gè)顯性基因控制的,并將其定位于染色體A03上yau389和yau376側(cè)翼連鎖標(biāo)記之間的約60 kb（1 cM）區(qū)域內(nèi),命名為CRd。在這個(gè)區(qū)... 

【文章來源】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：127 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

各樣本表達(dá)量豐度分布圖

組間表達(dá)量水平盒形圖

為了研究在用兩種類型的根腫菌侵染期間轉(zhuǎn)錄水平的變化,在4天和8天分析在兩種根腫菌和對(duì)照樣品之間差異表達(dá)的基因。差異表達(dá)基因的數(shù)量使用edgeR軟件對(duì)組間基因表達(dá)量進(jìn)行差異分析,利用FDR與log2FC來篩選差異基因,篩選條件為FDR<0.05且|log2FC|>1,是基于與對(duì)照樣品(即未接種根腫菌的“85-74”)在指定時(shí)間點(diǎn)的比較確定的。在4天時(shí),接種LAB-4的“85-74”與不接菌對(duì)照比較存在著304個(gè)差異表達(dá)基因,顯著低于接種SCCD-52的“85-74”中的5552個(gè)差異表達(dá)基因(圖5-5a,b和補(bǔ)充表S3)。差異表達(dá)基因數(shù)量的巨大差異表明,即使“85-74”中包含有CRd抗病基因,大白菜還是對(duì)致病型根腫菌SCCD-52的侵染響應(yīng)更加迅速。對(duì)于LAB-4,差異表達(dá)基因的數(shù)量隨著接種后時(shí)間的延長而增加,在接種后8天的差異表達(dá)基因數(shù)為3066個(gè)。然而,對(duì)于SCCD-52,與接種后4天的時(shí)間點(diǎn)相比,接種后8天的差異表達(dá)基因數(shù)量變少(1152)(圖5-5a,b和補(bǔ)充表S4)。此外,兩種根腫菌侵染后的“85-74”中的上調(diào)差異表達(dá)基因隨時(shí)間變化在所有差異表達(dá)基因中所占比例也發(fā)生了變化,SCCD-52從77.2%下降到60.7%,LAB-4從74.6%上升到76.6%,這些結(jié)果突出了含有CRd的“85-74”對(duì)不同致病型根腫菌表現(xiàn)出不同程度反應(yīng)。接種后4天時(shí),在LAB-4和SCCD-52中特異表達(dá)的差異基因分別為27和5552個(gè),在接種8天時(shí)特異表達(dá)的差異基因分別為2573和659個(gè)(圖5-6a,b),結(jié)果表明,在接種LAB-4的“85-74”中的特異表達(dá)的差異基因數(shù)量在8天時(shí)顯著增加。圖5-6不同樣品在4天和8天差異表達(dá)基因數(shù)維恩圖


本文編號(hào)：2985802