縊蟶C型凝集素基因ScCTL-1和ScCTL-2的克隆鑒定與免疫功能研究
發(fā)布時(shí)間：2021-01-16 02:26
縊蟶（Sinonovacula constricta）是我國(guó)重要的海水養(yǎng)殖貝類之一。近年來(lái),隨著縊蟶高密度養(yǎng)殖的發(fā)展和養(yǎng)殖環(huán)境的不斷惡化,細(xì)菌性疾病成為了縊蟶養(yǎng)殖中的一大問(wèn)題。研究表明,C型凝集素（C-type lectin）作為一種模式識(shí)別受體（Pattern recognition receptor,PRR）,廣泛參與貝類的免疫防御機(jī)制,在貝類免疫中占據(jù)著重要的地位。但目前為止,在縊蟶中尚少有關(guān)于C型凝集素研究的報(bào)道。本文克隆了2個(gè)縊蟶C型凝集素基因,并對(duì)它們的mRNA表達(dá)模式以及重組蛋白的免疫功能進(jìn)行了研究。1.從之前構(gòu)建的縊蟶轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)中獲得了2個(gè)C型凝集素基因ScCTL-1和ScCTL-2的序列片段,使用RACE-PCR技術(shù)克隆得到它們的cDNA全長(zhǎng)序列。序列分析結(jié)果表明,ScCTL-1基因cDNA全長(zhǎng)2370bp,包含一個(gè)長(zhǎng)度為1899bp的開(kāi)放閱讀框（Open reading frame,ORF）,編碼632個(gè)氨基酸,蛋白相對(duì)分子量約為70.22kDa;ScCTL-2基因cDNA全長(zhǎng)2194bp,包含一個(gè)長(zhǎng)度為1893bp的ORF,編碼630個(gè)氨基酸,蛋白相對(duì)分子量約為7...
【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】：61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
CTLD空間結(jié)構(gòu)圖
LD 的 Ca2+結(jié)合位點(diǎn)。4 個(gè) Ca2+結(jié)合位點(diǎn)分別在人 ASGPR-I 與大鼠 MBP示，并用箭頭指明編號(hào)。Ca-binding sites in CTLDs. Shown are ribbon diagrams of two representa, rat MBP-Aand human ASGPR-I, demonstrating the four typical locations of cLD. Ca2+ions are shown as black spheres, and numbers referenced to the diffee indicated next to the arrows[27].a2+依賴的糖類結(jié)合TLD 中，直接參與糖類結(jié)合的 Ca2+結(jié)合位點(diǎn) 2 擁有兩個(gè)特征化基序和“WND”基序。兩個(gè)基序與 Ca2+一同參與 CTLD 對(duì)糖類鼠 MBP-A 為例：大鼠 MBP-A 的“EPN”基序（E185，P186， 的長(zhǎng)環(huán)區(qū)。位于基序中心順式構(gòu)象的脯氨酸是在所有 CTLD 中，它不參與 CTLD 的 Ca2+配合和糖類結(jié)合過(guò)程中化學(xué)鍵的形成側(cè)氨基酸結(jié)構(gòu)的作用。脯氨酸兩側(cè)的谷氨酸和天冬酰胺各自與鍵。大鼠 MBP-A 的“WND”基序（W204，N205，D206）位
16圖 2-2 縊蟶兩個(gè) C 型凝集素的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析。在 MEGA5 中使用鄰近法對(duì)經(jīng)ClustalW-generated 多重比對(duì)的 CTLD 序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建。拓?fù)浞�(wěn)定性使用 10,000 次自動(dòng)重復(fù)，圖中數(shù)值表示置信度。Fig. 2-2 Phylogenetic tree constructed to show the 8 CTLDs of two C-type lectins from S. constrictawith other CTLDs. The phylogenetic tree was constructed by ClustalW-generated multiple sequencealignment of the amino acid sequences, using neighbor-joining in the MEGA 5 package. Thetopological stability of the neighbor-joining trees was evaluated using 10,000 bootstrappingreplications. The numbers at branches indicate the bootstrap values (%).
本文編號(hào)：2979973
【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市
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【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
CTLD空間結(jié)構(gòu)圖
LD 的 Ca2+結(jié)合位點(diǎn)。4 個(gè) Ca2+結(jié)合位點(diǎn)分別在人 ASGPR-I 與大鼠 MBP示，并用箭頭指明編號(hào)。Ca-binding sites in CTLDs. Shown are ribbon diagrams of two representa, rat MBP-Aand human ASGPR-I, demonstrating the four typical locations of cLD. Ca2+ions are shown as black spheres, and numbers referenced to the diffee indicated next to the arrows[27].a2+依賴的糖類結(jié)合TLD 中，直接參與糖類結(jié)合的 Ca2+結(jié)合位點(diǎn) 2 擁有兩個(gè)特征化基序和“WND”基序。兩個(gè)基序與 Ca2+一同參與 CTLD 對(duì)糖類鼠 MBP-A 為例：大鼠 MBP-A 的“EPN”基序（E185，P186， 的長(zhǎng)環(huán)區(qū)。位于基序中心順式構(gòu)象的脯氨酸是在所有 CTLD 中，它不參與 CTLD 的 Ca2+配合和糖類結(jié)合過(guò)程中化學(xué)鍵的形成側(cè)氨基酸結(jié)構(gòu)的作用。脯氨酸兩側(cè)的谷氨酸和天冬酰胺各自與鍵。大鼠 MBP-A 的“WND”基序（W204，N205，D206）位
16圖 2-2 縊蟶兩個(gè) C 型凝集素的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析。在 MEGA5 中使用鄰近法對(duì)經(jīng)ClustalW-generated 多重比對(duì)的 CTLD 序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建。拓?fù)浞�(wěn)定性使用 10,000 次自動(dòng)重復(fù)，圖中數(shù)值表示置信度。Fig. 2-2 Phylogenetic tree constructed to show the 8 CTLDs of two C-type lectins from S. constrictawith other CTLDs. The phylogenetic tree was constructed by ClustalW-generated multiple sequencealignment of the amino acid sequences, using neighbor-joining in the MEGA 5 package. Thetopological stability of the neighbor-joining trees was evaluated using 10,000 bootstrappingreplications. The numbers at branches indicate the bootstrap values (%).
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