番茄PIN基因家族的全基因組分析及抗逆相關(guān)基因篩選鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-01-14 22:16
番茄原產(chǎn)于南美洲、波利維亞、厄瓜多爾等地。16世紀(jì)開(kāi)始做觀賞栽培,從20世紀(jì)20年代初開(kāi)始作為我國(guó)蔬菜栽培,到20世紀(jì)20年代現(xiàn)已成為我國(guó)主要的蔬菜。番茄具有栽培方式容易多樣、果實(shí)色澤鮮艷、營(yíng)養(yǎng)價(jià)值豐富、產(chǎn)量高等優(yōu)點(diǎn)。但其在生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中容易受逆境條件的影響而導(dǎo)致品質(zhì)和產(chǎn)量下降。尤其是在蔬菜供應(yīng)不足的季節(jié),番茄常常會(huì)受到土壤鹽漬化、洪澇、干旱等逆境的影響,嚴(yán)重制約著番茄的供應(yīng)和生產(chǎn)。生長(zhǎng)素是一類主要的植物激素,在植物的整個(gè)生命周期中自始至終扮演著關(guān)鍵作用,包括調(diào)控植物的莖干及花分生組織的形成、胚胎發(fā)育、頂端優(yōu)勢(shì)、向重力性及響應(yīng)內(nèi)外刺激等多個(gè)方面。因此,生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸、生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及生長(zhǎng)素與逆境脅迫的關(guān)系逐漸引起了人們的興趣,已有的研究成果表明生長(zhǎng)素幾乎參與植物生長(zhǎng)發(fā)育的多個(gè)方面。生長(zhǎng)素運(yùn)輸?shù)鞍自谀ど系臉O性定位可調(diào)控生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸,而PIN蛋白家族是一種公認(rèn)的生長(zhǎng)素輸出載體?傊,一系列的的環(huán)境應(yīng)激反應(yīng)均會(huì)導(dǎo)致特殊區(qū)域極化并重新調(diào)整生長(zhǎng)素的方向,其中就包括PINs蛋白亞細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn)的下游調(diào)節(jié)。但是,例如重力因素,光照因素,和鹽濃度等外界信號(hào)接受條件是如何影響PINs蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)的正確機(jī)制還不...
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
SlPIN蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)
注:紅色表示 Short PINs;藍(lán)色表示 Long PINs圖 3-2 番茄、擬南芥、水稻、和高粱 PIN 生長(zhǎng)素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的進(jìn)化分析Fig. 3-2 Phylogenetic relationships of PIN auxin transporters from tomato (Sl), Athaliana(At), Rice (Os) and Sorghum (Sb)番茄 PIN 基因家族保守結(jié)構(gòu)域分析 DNAMAN Vesion 9 軟件對(duì)番茄 PIN 基因的氨基酸序列進(jìn)行多序列對(duì)比。結(jié))番茄 PIN 氨基酸序列 N 端和 C 端具有高度保守的跨膜結(jié)構(gòu)域,保守區(qū)域的央親水區(qū)分開(kāi),且親水區(qū)的長(zhǎng)度是不均勻的。中央親水區(qū)的長(zhǎng)度在 317-382度在 47aa(SlPIN10)-243aa(SlPIN6)。long PINs 組的親水環(huán)包含 C1、 V1、V2 特殊的可變結(jié)構(gòu)域,而 short PINs 組的親水區(qū)僅有恒定區(qū) C1 和可變 C 端與可變區(qū)之間有一個(gè)對(duì)內(nèi)吞作用中的膜蛋白與受體蛋白的互作非常重要NPXXY,其中僅有 SlPIN8 的酪氨酸(Y)由組氨酸(I)代替。表 1 中 PIN主要是由于位于蛋白兩端的跨膜結(jié)構(gòu)域之間的親水區(qū)域長(zhǎng)度不同而引起的。含 2 個(gè)可能的磷酸化位點(diǎn)(圖中用黑色三角標(biāo)記),中央親水環(huán)的這些位點(diǎn)蘇氨酸蛋白酶磷酸化。
27注: 為磷酸化位點(diǎn); 為 NPXXY 保守結(jié)構(gòu);藍(lán)色線為疏水區(qū);紅色線為親水環(huán)圖 3-3 SlPIN 蛋白的氨基酸序列比對(duì)Fig. 3-3 Alignment of amino acid sequences of SlPIN proteins3.1.5 SlPINs 保守基序的分析及染色體定位
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄抗旱基因工程研究進(jìn)展[J]. 李金華,王亞玲,潘宇,蘇承剛,張興國(guó). 中國(guó)蔬菜. 2017(12)
[2]蘋(píng)果全基因組PIN成員鑒定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌發(fā)中的表達(dá)分析[J]. 劉小杰,樊勝,李國(guó)防,檀鳴,默寧,馬娟娟,張東,韓明玉. 園藝學(xué)報(bào). 2017(11)
[3]十字花科植物PIN3基因調(diào)控元件及表達(dá)分析[J]. 李玉軍,趙燕,黃麗華,湯賓,黃妤,張學(xué)文. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(07)
[4]人參生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸基因PIN的表達(dá)譜研究[J]. 劉娟,陳同,袁媛,紀(jì)瑞鋒,郭娟,王英平,王國(guó)良,黃璐琦. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2017(04)
[5]番茄PIN2基因的生物信息學(xué)分析[J]. 張春利,袁岐,趙婷婷,許向陽(yáng). 分子植物育種. 2017(07)
[6]生長(zhǎng)素運(yùn)輸載體研究進(jìn)展[J]. 俞晨良,董文其,張成浩. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[7]植物生長(zhǎng)素響應(yīng)冷脅迫反應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 陳丹,王衛(wèi)安,岳全奇,趙琴. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(07)
[8]植物非生物脅迫的研究進(jìn)展[J]. 于新海,李濛,周紅昕. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2016(09)
[9]番茄對(duì)非生物脅迫響應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐佳寧,徐艷群,嚴(yán)振,張利云,高建偉. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(12)
[10]茶樹(shù)生長(zhǎng)素外運(yùn)載體基因CsPIN3的克隆與表達(dá)分析[J]. 王博,曹紅利,黃玉婷,胡玉榮,錢文俊,郝心愿,王璐,楊亞軍,王新超. 作物學(xué)報(bào). 2016(01)
博士論文
[1]干旱誘導(dǎo)基因TaDLea3的功能及在小麥不同生長(zhǎng)期的時(shí)空表達(dá)規(guī)律研究[D]. 陳娟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]玉米WRKY轉(zhuǎn)錄因子Ⅱd亞族抗逆相關(guān)基因的鑒定及ZmWRKY17的功能分析[D]. 蔡榮號(hào).安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]棉花抗冷性鑒定及相關(guān)基因的表達(dá)研究[D]. 王俊娟.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[4]棉花(Gossypium hirsutum)DREB/CBF基因的篩選鑒定及其在植物抗逆應(yīng)答中的功能研究[D]. 馬劉峰.華中師范大學(xué) 2015
[5]兩個(gè)E3泛素連接酶基因在水稻耐非生物逆境脅迫中的作用研究[D]. 方慧敏.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]番茄SpMPKs基因響應(yīng)非生物脅迫的功能分析[D]. 李翠.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[7]陸地棉逆境脅迫相關(guān)同源基因的克隆及其在非生物脅迫下的表達(dá)特性分析[D]. 孟超敏.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]番茄中病毒誘導(dǎo)基因沉默體系的建立及LeEIN2基因功能分析[D]. 傅達(dá)奇.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]擬南芥NHX5和NHX6調(diào)節(jié)生長(zhǎng)素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白PIN6的功能研究[D]. 徐艷麗.蘭州大學(xué) 2017
[2]陸地棉GhSPO11-3基因的克隆與功能分析[D]. 梅麗琴.鄭州大學(xué) 2017
[3]LYC-B沉默對(duì)番茄果實(shí)揮發(fā)性物質(zhì)和品質(zhì)性狀的影響[D]. 呂潔.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[4]萬(wàn)壽菊(Tagetes erecta)VIGS體系的建立與優(yōu)化[D]. 張洪義.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]利用VIGS技術(shù)沉默烤煙MYB基因的研究[D]. 曹曉玉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]薺菜PIN基因表達(dá)與其心皮形態(tài)建成的相關(guān)性[D]. 朱占偉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]增強(qiáng)UV-B輻射對(duì)番茄幼苗生理生化特性及內(nèi)源激素含量的影響[D]. 張昌達(dá).甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]水分脅迫下番茄幼苗多胺代謝變化及其與抗旱性的關(guān)系[D]. 張志新.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009
[9]水稻PIN家族基因表達(dá)模式研究[D]. 王繼榮.浙江大學(xué) 2008
本文編號(hào):2977657
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
SlPIN蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)
注:紅色表示 Short PINs;藍(lán)色表示 Long PINs圖 3-2 番茄、擬南芥、水稻、和高粱 PIN 生長(zhǎng)素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的進(jìn)化分析Fig. 3-2 Phylogenetic relationships of PIN auxin transporters from tomato (Sl), Athaliana(At), Rice (Os) and Sorghum (Sb)番茄 PIN 基因家族保守結(jié)構(gòu)域分析 DNAMAN Vesion 9 軟件對(duì)番茄 PIN 基因的氨基酸序列進(jìn)行多序列對(duì)比。結(jié))番茄 PIN 氨基酸序列 N 端和 C 端具有高度保守的跨膜結(jié)構(gòu)域,保守區(qū)域的央親水區(qū)分開(kāi),且親水區(qū)的長(zhǎng)度是不均勻的。中央親水區(qū)的長(zhǎng)度在 317-382度在 47aa(SlPIN10)-243aa(SlPIN6)。long PINs 組的親水環(huán)包含 C1、 V1、V2 特殊的可變結(jié)構(gòu)域,而 short PINs 組的親水區(qū)僅有恒定區(qū) C1 和可變 C 端與可變區(qū)之間有一個(gè)對(duì)內(nèi)吞作用中的膜蛋白與受體蛋白的互作非常重要NPXXY,其中僅有 SlPIN8 的酪氨酸(Y)由組氨酸(I)代替。表 1 中 PIN主要是由于位于蛋白兩端的跨膜結(jié)構(gòu)域之間的親水區(qū)域長(zhǎng)度不同而引起的。含 2 個(gè)可能的磷酸化位點(diǎn)(圖中用黑色三角標(biāo)記),中央親水環(huán)的這些位點(diǎn)蘇氨酸蛋白酶磷酸化。
27注: 為磷酸化位點(diǎn); 為 NPXXY 保守結(jié)構(gòu);藍(lán)色線為疏水區(qū);紅色線為親水環(huán)圖 3-3 SlPIN 蛋白的氨基酸序列比對(duì)Fig. 3-3 Alignment of amino acid sequences of SlPIN proteins3.1.5 SlPINs 保守基序的分析及染色體定位
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄抗旱基因工程研究進(jìn)展[J]. 李金華,王亞玲,潘宇,蘇承剛,張興國(guó). 中國(guó)蔬菜. 2017(12)
[2]蘋(píng)果全基因組PIN成員鑒定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌發(fā)中的表達(dá)分析[J]. 劉小杰,樊勝,李國(guó)防,檀鳴,默寧,馬娟娟,張東,韓明玉. 園藝學(xué)報(bào). 2017(11)
[3]十字花科植物PIN3基因調(diào)控元件及表達(dá)分析[J]. 李玉軍,趙燕,黃麗華,湯賓,黃妤,張學(xué)文. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(07)
[4]人參生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸基因PIN的表達(dá)譜研究[J]. 劉娟,陳同,袁媛,紀(jì)瑞鋒,郭娟,王英平,王國(guó)良,黃璐琦. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2017(04)
[5]番茄PIN2基因的生物信息學(xué)分析[J]. 張春利,袁岐,趙婷婷,許向陽(yáng). 分子植物育種. 2017(07)
[6]生長(zhǎng)素運(yùn)輸載體研究進(jìn)展[J]. 俞晨良,董文其,張成浩. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[7]植物生長(zhǎng)素響應(yīng)冷脅迫反應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 陳丹,王衛(wèi)安,岳全奇,趙琴. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(07)
[8]植物非生物脅迫的研究進(jìn)展[J]. 于新海,李濛,周紅昕. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2016(09)
[9]番茄對(duì)非生物脅迫響應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐佳寧,徐艷群,嚴(yán)振,張利云,高建偉. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(12)
[10]茶樹(shù)生長(zhǎng)素外運(yùn)載體基因CsPIN3的克隆與表達(dá)分析[J]. 王博,曹紅利,黃玉婷,胡玉榮,錢文俊,郝心愿,王璐,楊亞軍,王新超. 作物學(xué)報(bào). 2016(01)
博士論文
[1]干旱誘導(dǎo)基因TaDLea3的功能及在小麥不同生長(zhǎng)期的時(shí)空表達(dá)規(guī)律研究[D]. 陳娟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]玉米WRKY轉(zhuǎn)錄因子Ⅱd亞族抗逆相關(guān)基因的鑒定及ZmWRKY17的功能分析[D]. 蔡榮號(hào).安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]棉花抗冷性鑒定及相關(guān)基因的表達(dá)研究[D]. 王俊娟.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[4]棉花(Gossypium hirsutum)DREB/CBF基因的篩選鑒定及其在植物抗逆應(yīng)答中的功能研究[D]. 馬劉峰.華中師范大學(xué) 2015
[5]兩個(gè)E3泛素連接酶基因在水稻耐非生物逆境脅迫中的作用研究[D]. 方慧敏.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]番茄SpMPKs基因響應(yīng)非生物脅迫的功能分析[D]. 李翠.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[7]陸地棉逆境脅迫相關(guān)同源基因的克隆及其在非生物脅迫下的表達(dá)特性分析[D]. 孟超敏.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]番茄中病毒誘導(dǎo)基因沉默體系的建立及LeEIN2基因功能分析[D]. 傅達(dá)奇.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]擬南芥NHX5和NHX6調(diào)節(jié)生長(zhǎng)素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白PIN6的功能研究[D]. 徐艷麗.蘭州大學(xué) 2017
[2]陸地棉GhSPO11-3基因的克隆與功能分析[D]. 梅麗琴.鄭州大學(xué) 2017
[3]LYC-B沉默對(duì)番茄果實(shí)揮發(fā)性物質(zhì)和品質(zhì)性狀的影響[D]. 呂潔.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[4]萬(wàn)壽菊(Tagetes erecta)VIGS體系的建立與優(yōu)化[D]. 張洪義.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]利用VIGS技術(shù)沉默烤煙MYB基因的研究[D]. 曹曉玉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]薺菜PIN基因表達(dá)與其心皮形態(tài)建成的相關(guān)性[D]. 朱占偉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]增強(qiáng)UV-B輻射對(duì)番茄幼苗生理生化特性及內(nèi)源激素含量的影響[D]. 張昌達(dá).甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]水分脅迫下番茄幼苗多胺代謝變化及其與抗旱性的關(guān)系[D]. 張志新.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009
[9]水稻PIN家族基因表達(dá)模式研究[D]. 王繼榮.浙江大學(xué) 2008
本文編號(hào):2977657
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