番茄PIN基因家族的全基因組分析及抗逆相關(guān)基因篩選鑒定
發(fā)布時間:2021-01-14 22:16
番茄原產(chǎn)于南美洲、波利維亞、厄瓜多爾等地。16世紀開始做觀賞栽培,從20世紀20年代初開始作為我國蔬菜栽培,到20世紀20年代現(xiàn)已成為我國主要的蔬菜。番茄具有栽培方式容易多樣、果實色澤鮮艷、營養(yǎng)價值豐富、產(chǎn)量高等優(yōu)點。但其在生長發(fā)育過程中容易受逆境條件的影響而導致品質(zhì)和產(chǎn)量下降。尤其是在蔬菜供應不足的季節(jié),番茄常常會受到土壤鹽漬化、洪澇、干旱等逆境的影響,嚴重制約著番茄的供應和生產(chǎn)。生長素是一類主要的植物激素,在植物的整個生命周期中自始至終扮演著關(guān)鍵作用,包括調(diào)控植物的莖干及花分生組織的形成、胚胎發(fā)育、頂端優(yōu)勢、向重力性及響應內(nèi)外刺激等多個方面。因此,生長素極性運輸、生長素信號轉(zhuǎn)導以及生長素與逆境脅迫的關(guān)系逐漸引起了人們的興趣,已有的研究成果表明生長素幾乎參與植物生長發(fā)育的多個方面。生長素運輸?shù)鞍自谀ど系臉O性定位可調(diào)控生長素極性運輸,而PIN蛋白家族是一種公認的生長素輸出載體。總之,一系列的的環(huán)境應激反應均會導致特殊區(qū)域極化并重新調(diào)整生長素的方向,其中就包括PINs蛋白亞細胞轉(zhuǎn)運的下游調(diào)節(jié)。但是,例如重力因素,光照因素,和鹽濃度等外界信號接受條件是如何影響PINs蛋白轉(zhuǎn)運的正確機制還不...
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
SlPIN蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)
注:紅色表示 Short PINs;藍色表示 Long PINs圖 3-2 番茄、擬南芥、水稻、和高粱 PIN 生長素轉(zhuǎn)運蛋白的進化分析Fig. 3-2 Phylogenetic relationships of PIN auxin transporters from tomato (Sl), Athaliana(At), Rice (Os) and Sorghum (Sb)番茄 PIN 基因家族保守結(jié)構(gòu)域分析 DNAMAN Vesion 9 軟件對番茄 PIN 基因的氨基酸序列進行多序列對比。結(jié))番茄 PIN 氨基酸序列 N 端和 C 端具有高度保守的跨膜結(jié)構(gòu)域,保守區(qū)域的央親水區(qū)分開,且親水區(qū)的長度是不均勻的。中央親水區(qū)的長度在 317-382度在 47aa(SlPIN10)-243aa(SlPIN6)。long PINs 組的親水環(huán)包含 C1、 V1、V2 特殊的可變結(jié)構(gòu)域,而 short PINs 組的親水區(qū)僅有恒定區(qū) C1 和可變 C 端與可變區(qū)之間有一個對內(nèi)吞作用中的膜蛋白與受體蛋白的互作非常重要NPXXY,其中僅有 SlPIN8 的酪氨酸(Y)由組氨酸(I)代替。表 1 中 PIN主要是由于位于蛋白兩端的跨膜結(jié)構(gòu)域之間的親水區(qū)域長度不同而引起的。含 2 個可能的磷酸化位點(圖中用黑色三角標記),中央親水環(huán)的這些位點蘇氨酸蛋白酶磷酸化。
27注: 為磷酸化位點; 為 NPXXY 保守結(jié)構(gòu);藍色線為疏水區(qū);紅色線為親水環(huán)圖 3-3 SlPIN 蛋白的氨基酸序列比對Fig. 3-3 Alignment of amino acid sequences of SlPIN proteins3.1.5 SlPINs 保守基序的分析及染色體定位
【參考文獻】:
期刊論文
[1]番茄抗旱基因工程研究進展[J]. 李金華,王亞玲,潘宇,蘇承剛,張興國. 中國蔬菜. 2017(12)
[2]蘋果全基因組PIN成員鑒定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌發(fā)中的表達分析[J]. 劉小杰,樊勝,李國防,檀鳴,默寧,馬娟娟,張東,韓明玉. 園藝學報. 2017(11)
[3]十字花科植物PIN3基因調(diào)控元件及表達分析[J]. 李玉軍,趙燕,黃麗華,湯賓,黃妤,張學文. 中國農(nóng)業(yè)大學學報. 2017(07)
[4]人參生長素極性運輸基因PIN的表達譜研究[J]. 劉娟,陳同,袁媛,紀瑞鋒,郭娟,王英平,王國良,黃璐琦. 藥學學報. 2017(04)
[5]番茄PIN2基因的生物信息學分析[J]. 張春利,袁岐,趙婷婷,許向陽. 分子植物育種. 2017(07)
[6]生長素運輸載體研究進展[J]. 俞晨良,董文其,張成浩. 延邊大學農(nóng)學學報. 2016(04)
[7]植物生長素響應冷脅迫反應的研究進展[J]. 陳丹,王衛(wèi)安,岳全奇,趙琴. 植物生理學報. 2016(07)
[8]植物非生物脅迫的研究進展[J]. 于新海,李濛,周紅昕. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2016(09)
[9]番茄對非生物脅迫響應機制研究進展[J]. 徐佳寧,徐艷群,嚴振,張利云,高建偉. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2015(12)
[10]茶樹生長素外運載體基因CsPIN3的克隆與表達分析[J]. 王博,曹紅利,黃玉婷,胡玉榮,錢文俊,郝心愿,王璐,楊亞軍,王新超. 作物學報. 2016(01)
博士論文
[1]干旱誘導基因TaDLea3的功能及在小麥不同生長期的時空表達規(guī)律研究[D]. 陳娟.西北農(nóng)林科技大學 2016
[2]玉米WRKY轉(zhuǎn)錄因子Ⅱd亞族抗逆相關(guān)基因的鑒定及ZmWRKY17的功能分析[D]. 蔡榮號.安徽農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]棉花抗冷性鑒定及相關(guān)基因的表達研究[D]. 王俊娟.中國農(nóng)業(yè)科學院 2016
[4]棉花(Gossypium hirsutum)DREB/CBF基因的篩選鑒定及其在植物抗逆應答中的功能研究[D]. 馬劉峰.華中師范大學 2015
[5]兩個E3泛素連接酶基因在水稻耐非生物逆境脅迫中的作用研究[D]. 方慧敏.南京農(nóng)業(yè)大學 2014
[6]番茄SpMPKs基因響應非生物脅迫的功能分析[D]. 李翠.西北農(nóng)林科技大學 2014
[7]陸地棉逆境脅迫相關(guān)同源基因的克隆及其在非生物脅迫下的表達特性分析[D]. 孟超敏.南京農(nóng)業(yè)大學 2008
[8]番茄中病毒誘導基因沉默體系的建立及LeEIN2基因功能分析[D]. 傅達奇.中國農(nóng)業(yè)大學 2005
碩士論文
[1]擬南芥NHX5和NHX6調(diào)節(jié)生長素轉(zhuǎn)運蛋白PIN6的功能研究[D]. 徐艷麗.蘭州大學 2017
[2]陸地棉GhSPO11-3基因的克隆與功能分析[D]. 梅麗琴.鄭州大學 2017
[3]LYC-B沉默對番茄果實揮發(fā)性物質(zhì)和品質(zhì)性狀的影響[D]. 呂潔.西北農(nóng)林科技大學 2016
[4]萬壽菊(Tagetes erecta)VIGS體系的建立與優(yōu)化[D]. 張洪義.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]利用VIGS技術(shù)沉默烤煙MYB基因的研究[D]. 曹曉玉.湖南農(nóng)業(yè)大學 2014
[6]薺菜PIN基因表達與其心皮形態(tài)建成的相關(guān)性[D]. 朱占偉.湖南農(nóng)業(yè)大學 2013
[7]增強UV-B輻射對番茄幼苗生理生化特性及內(nèi)源激素含量的影響[D]. 張昌達.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2009
[8]水分脅迫下番茄幼苗多胺代謝變化及其與抗旱性的關(guān)系[D]. 張志新.西北農(nóng)林科技大學 2009
[9]水稻PIN家族基因表達模式研究[D]. 王繼榮.浙江大學 2008
本文編號:2977657
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
SlPIN蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)
注:紅色表示 Short PINs;藍色表示 Long PINs圖 3-2 番茄、擬南芥、水稻、和高粱 PIN 生長素轉(zhuǎn)運蛋白的進化分析Fig. 3-2 Phylogenetic relationships of PIN auxin transporters from tomato (Sl), Athaliana(At), Rice (Os) and Sorghum (Sb)番茄 PIN 基因家族保守結(jié)構(gòu)域分析 DNAMAN Vesion 9 軟件對番茄 PIN 基因的氨基酸序列進行多序列對比。結(jié))番茄 PIN 氨基酸序列 N 端和 C 端具有高度保守的跨膜結(jié)構(gòu)域,保守區(qū)域的央親水區(qū)分開,且親水區(qū)的長度是不均勻的。中央親水區(qū)的長度在 317-382度在 47aa(SlPIN10)-243aa(SlPIN6)。long PINs 組的親水環(huán)包含 C1、 V1、V2 特殊的可變結(jié)構(gòu)域,而 short PINs 組的親水區(qū)僅有恒定區(qū) C1 和可變 C 端與可變區(qū)之間有一個對內(nèi)吞作用中的膜蛋白與受體蛋白的互作非常重要NPXXY,其中僅有 SlPIN8 的酪氨酸(Y)由組氨酸(I)代替。表 1 中 PIN主要是由于位于蛋白兩端的跨膜結(jié)構(gòu)域之間的親水區(qū)域長度不同而引起的。含 2 個可能的磷酸化位點(圖中用黑色三角標記),中央親水環(huán)的這些位點蘇氨酸蛋白酶磷酸化。
27注: 為磷酸化位點; 為 NPXXY 保守結(jié)構(gòu);藍色線為疏水區(qū);紅色線為親水環(huán)圖 3-3 SlPIN 蛋白的氨基酸序列比對Fig. 3-3 Alignment of amino acid sequences of SlPIN proteins3.1.5 SlPINs 保守基序的分析及染色體定位
【參考文獻】:
期刊論文
[1]番茄抗旱基因工程研究進展[J]. 李金華,王亞玲,潘宇,蘇承剛,張興國. 中國蔬菜. 2017(12)
[2]蘋果全基因組PIN成員鑒定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌發(fā)中的表達分析[J]. 劉小杰,樊勝,李國防,檀鳴,默寧,馬娟娟,張東,韓明玉. 園藝學報. 2017(11)
[3]十字花科植物PIN3基因調(diào)控元件及表達分析[J]. 李玉軍,趙燕,黃麗華,湯賓,黃妤,張學文. 中國農(nóng)業(yè)大學學報. 2017(07)
[4]人參生長素極性運輸基因PIN的表達譜研究[J]. 劉娟,陳同,袁媛,紀瑞鋒,郭娟,王英平,王國良,黃璐琦. 藥學學報. 2017(04)
[5]番茄PIN2基因的生物信息學分析[J]. 張春利,袁岐,趙婷婷,許向陽. 分子植物育種. 2017(07)
[6]生長素運輸載體研究進展[J]. 俞晨良,董文其,張成浩. 延邊大學農(nóng)學學報. 2016(04)
[7]植物生長素響應冷脅迫反應的研究進展[J]. 陳丹,王衛(wèi)安,岳全奇,趙琴. 植物生理學報. 2016(07)
[8]植物非生物脅迫的研究進展[J]. 于新海,李濛,周紅昕. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2016(09)
[9]番茄對非生物脅迫響應機制研究進展[J]. 徐佳寧,徐艷群,嚴振,張利云,高建偉. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2015(12)
[10]茶樹生長素外運載體基因CsPIN3的克隆與表達分析[J]. 王博,曹紅利,黃玉婷,胡玉榮,錢文俊,郝心愿,王璐,楊亞軍,王新超. 作物學報. 2016(01)
博士論文
[1]干旱誘導基因TaDLea3的功能及在小麥不同生長期的時空表達規(guī)律研究[D]. 陳娟.西北農(nóng)林科技大學 2016
[2]玉米WRKY轉(zhuǎn)錄因子Ⅱd亞族抗逆相關(guān)基因的鑒定及ZmWRKY17的功能分析[D]. 蔡榮號.安徽農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]棉花抗冷性鑒定及相關(guān)基因的表達研究[D]. 王俊娟.中國農(nóng)業(yè)科學院 2016
[4]棉花(Gossypium hirsutum)DREB/CBF基因的篩選鑒定及其在植物抗逆應答中的功能研究[D]. 馬劉峰.華中師范大學 2015
[5]兩個E3泛素連接酶基因在水稻耐非生物逆境脅迫中的作用研究[D]. 方慧敏.南京農(nóng)業(yè)大學 2014
[6]番茄SpMPKs基因響應非生物脅迫的功能分析[D]. 李翠.西北農(nóng)林科技大學 2014
[7]陸地棉逆境脅迫相關(guān)同源基因的克隆及其在非生物脅迫下的表達特性分析[D]. 孟超敏.南京農(nóng)業(yè)大學 2008
[8]番茄中病毒誘導基因沉默體系的建立及LeEIN2基因功能分析[D]. 傅達奇.中國農(nóng)業(yè)大學 2005
碩士論文
[1]擬南芥NHX5和NHX6調(diào)節(jié)生長素轉(zhuǎn)運蛋白PIN6的功能研究[D]. 徐艷麗.蘭州大學 2017
[2]陸地棉GhSPO11-3基因的克隆與功能分析[D]. 梅麗琴.鄭州大學 2017
[3]LYC-B沉默對番茄果實揮發(fā)性物質(zhì)和品質(zhì)性狀的影響[D]. 呂潔.西北農(nóng)林科技大學 2016
[4]萬壽菊(Tagetes erecta)VIGS體系的建立與優(yōu)化[D]. 張洪義.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]利用VIGS技術(shù)沉默烤煙MYB基因的研究[D]. 曹曉玉.湖南農(nóng)業(yè)大學 2014
[6]薺菜PIN基因表達與其心皮形態(tài)建成的相關(guān)性[D]. 朱占偉.湖南農(nóng)業(yè)大學 2013
[7]增強UV-B輻射對番茄幼苗生理生化特性及內(nèi)源激素含量的影響[D]. 張昌達.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2009
[8]水分脅迫下番茄幼苗多胺代謝變化及其與抗旱性的關(guān)系[D]. 張志新.西北農(nóng)林科技大學 2009
[9]水稻PIN家族基因表達模式研究[D]. 王繼榮.浙江大學 2008
本文編號:2977657
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