金錢魚Sox3基因cDNA克隆及組織表達(dá)
發(fā)布時(shí)間:2021-01-12 00:39
金錢魚是中國(guó)重要經(jīng)濟(jì)型魚類,但其人工繁殖難以取得成功。本研究利用cDNA末端快速擴(kuò)增法(rapid-amplification of cDNA ends, RACE)克隆了金錢魚(Scatophagus argus) Sox3基因cDNA全長(zhǎng)序列,分析該基因序列在不同物種間的差異,并用RT-PCR半定量方法分析其在雌、雄組織中的表達(dá)差異。結(jié)果表明:金錢魚Sox3 c DNA全長(zhǎng)1 270 bp,包括5’非翻譯區(qū)(5’-UTR) 217 bp、3’非翻譯區(qū)(3’-UTR) 150 bp和開放閱讀框(open reading frame, ORF) 903 bp,編碼300個(gè)氨基酸,該氨基酸序列34104位為HMG保守盒。金錢魚Sox3氨基酸序列與大黃魚(Larimichthys crocea)的同源性最高,為99.3%,其次是金頭鯛(Sparus aurata),為98.7%。Sox3前體蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,金錢魚與大黃魚親緣關(guān)系最近。金錢魚Sox3基因的組織表達(dá)有明顯的組織特異性及性別差異,在性腺中表達(dá)量最高,雄性個(gè)體腦和垂體次之,肌肉、腎臟、心臟和腸有低量的表...
【文章來(lái)源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(07)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
金錢魚Sox3 cDNA序列及其推導(dǎo)的氨基酸序列
本研究發(fā)現(xiàn)Sox3基因在金錢魚不同組織中存在表達(dá)差異,且不同性別個(gè)體的組織表達(dá)也存在差異,表明Sox3基因在多種組織中表達(dá),并存在多種生理功能。金錢魚體內(nèi)Sox3基因的表達(dá)與其他魚類存在相似性也存在差異性。相似性是在多種魚類的腦組織中均檢測(cè)到Sox3基因具有較高的表達(dá)量,與斜帶石斑魚(姚波等,2003)、許氏平鲉(馬麗曼,2014)、斑馬魚(Dee et al,2008)和泥鰍(張林霞,2015)等魚類相似,表明Sox3基因?qū)ι窠?jīng)系統(tǒng)的正常生長(zhǎng)發(fā)育及組織分化有著重要作用(Wang et al.,2006;許可等,2017,中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志,27(8):1214-1216)。在金錢魚的卵巢和精巢中均能檢測(cè)到Sox3基因較高的表達(dá)量,這點(diǎn)與泥鰍(張林霞,2015)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)相似,而斜帶石斑魚(姚波等,2003)和許氏平鲉(馬麗曼,2014)的Sox3基因在卵巢中的表達(dá)水平顯著高于精巢,表明Sox3基因?qū)π詣e決定及分化有著重要作用(Weiss et al.,2003;許可等,2017,中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志,27(8):1214-1216)。在雌性金錢魚的鰓中檢測(cè)到Sox3基因較高的表達(dá)量,而雄性金錢魚鰓中無(wú)Sox3基因表達(dá),但在許氏平鲉(馬麗曼,2014)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)雄雌魚的鰓組織中均檢測(cè)到了較高水平的Sox3基因轉(zhuǎn)錄本。在金錢魚中,Sox3基因無(wú)性別差異地高表達(dá)于腦、垂體和性腺中,說(shuō)明Sox3對(duì)于金錢魚神經(jīng)系統(tǒng)和性腺的生長(zhǎng)發(fā)育具有重要意思,而鰓中存在Sox3性別表達(dá)差異,其差異原因及其在鰓中表達(dá)的意思仍需探討。圖5 不同脊椎動(dòng)物Sox3的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
不同脊椎動(dòng)物Sox3的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金錢魚繁殖生物學(xué)及誘導(dǎo)產(chǎn)卵試驗(yàn)[J]. 蔡澤平,王毅,胡家瑋,張俊彬,林岳光. 熱帶海洋學(xué)報(bào). 2010(05)
[2]金錢魚生物學(xué)研究及回顧[J]. 蘭國(guó)寶,閻冰,廖思明,羅硯,謝若癡. 水產(chǎn)科學(xué). 2005(07)
[3]斜帶石斑魚sox3基因cDNA的克隆及其時(shí)空表達(dá)特征分析[J]. 姚波,周莉,桂建芳. 高技術(shù)通訊. 2003(05)
[4]東北虎Sox3和Sox4基因的保守區(qū)序列分析[J]. 杜啟艷,常重杰,牛紅星. 河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2003(01)
[5]Sox基因家族研究的新進(jìn)展[J]. 常重杰,杜啟艷,邵紅偉. 遺傳. 2002(04)
[6]SOX基因家族的研究現(xiàn)狀[J]. 常重杰,周榮家,余其興. 遺傳. 2000(01)
[7]金錢魚的生長(zhǎng)特性與咸水池塘馴養(yǎng)[J]. 張邦杰,梁仁杰,毛大寧,張邦豪. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 1999(10)
博士論文
[1]許氏平鲉性別相關(guān)基因Sox3、Sox9和Dmrt1的研究[D]. 馬麗曼.中國(guó)海洋大學(xué) 2014
碩士論文
[1]中國(guó)大鯢Sox3、Sox5基因cDNA序列的克隆及組織表達(dá)分析[D]. 張向偉.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]兩種泥鰍SOX3基因的克隆、表達(dá)和功能分析[D]. 張林霞.河南師范大學(xué) 2015
[3]青島文昌魚Sox1/2/3-like基因的擴(kuò)增與表達(dá)研究[D]. 曹慧慧.魯東大學(xué) 2011
本文編號(hào):2971787
【文章來(lái)源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(07)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
金錢魚Sox3 cDNA序列及其推導(dǎo)的氨基酸序列
本研究發(fā)現(xiàn)Sox3基因在金錢魚不同組織中存在表達(dá)差異,且不同性別個(gè)體的組織表達(dá)也存在差異,表明Sox3基因在多種組織中表達(dá),并存在多種生理功能。金錢魚體內(nèi)Sox3基因的表達(dá)與其他魚類存在相似性也存在差異性。相似性是在多種魚類的腦組織中均檢測(cè)到Sox3基因具有較高的表達(dá)量,與斜帶石斑魚(姚波等,2003)、許氏平鲉(馬麗曼,2014)、斑馬魚(Dee et al,2008)和泥鰍(張林霞,2015)等魚類相似,表明Sox3基因?qū)ι窠?jīng)系統(tǒng)的正常生長(zhǎng)發(fā)育及組織分化有著重要作用(Wang et al.,2006;許可等,2017,中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志,27(8):1214-1216)。在金錢魚的卵巢和精巢中均能檢測(cè)到Sox3基因較高的表達(dá)量,這點(diǎn)與泥鰍(張林霞,2015)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)相似,而斜帶石斑魚(姚波等,2003)和許氏平鲉(馬麗曼,2014)的Sox3基因在卵巢中的表達(dá)水平顯著高于精巢,表明Sox3基因?qū)π詣e決定及分化有著重要作用(Weiss et al.,2003;許可等,2017,中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志,27(8):1214-1216)。在雌性金錢魚的鰓中檢測(cè)到Sox3基因較高的表達(dá)量,而雄性金錢魚鰓中無(wú)Sox3基因表達(dá),但在許氏平鲉(馬麗曼,2014)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)雄雌魚的鰓組織中均檢測(cè)到了較高水平的Sox3基因轉(zhuǎn)錄本。在金錢魚中,Sox3基因無(wú)性別差異地高表達(dá)于腦、垂體和性腺中,說(shuō)明Sox3對(duì)于金錢魚神經(jīng)系統(tǒng)和性腺的生長(zhǎng)發(fā)育具有重要意思,而鰓中存在Sox3性別表達(dá)差異,其差異原因及其在鰓中表達(dá)的意思仍需探討。圖5 不同脊椎動(dòng)物Sox3的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
不同脊椎動(dòng)物Sox3的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金錢魚繁殖生物學(xué)及誘導(dǎo)產(chǎn)卵試驗(yàn)[J]. 蔡澤平,王毅,胡家瑋,張俊彬,林岳光. 熱帶海洋學(xué)報(bào). 2010(05)
[2]金錢魚生物學(xué)研究及回顧[J]. 蘭國(guó)寶,閻冰,廖思明,羅硯,謝若癡. 水產(chǎn)科學(xué). 2005(07)
[3]斜帶石斑魚sox3基因cDNA的克隆及其時(shí)空表達(dá)特征分析[J]. 姚波,周莉,桂建芳. 高技術(shù)通訊. 2003(05)
[4]東北虎Sox3和Sox4基因的保守區(qū)序列分析[J]. 杜啟艷,常重杰,牛紅星. 河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2003(01)
[5]Sox基因家族研究的新進(jìn)展[J]. 常重杰,杜啟艷,邵紅偉. 遺傳. 2002(04)
[6]SOX基因家族的研究現(xiàn)狀[J]. 常重杰,周榮家,余其興. 遺傳. 2000(01)
[7]金錢魚的生長(zhǎng)特性與咸水池塘馴養(yǎng)[J]. 張邦杰,梁仁杰,毛大寧,張邦豪. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 1999(10)
博士論文
[1]許氏平鲉性別相關(guān)基因Sox3、Sox9和Dmrt1的研究[D]. 馬麗曼.中國(guó)海洋大學(xué) 2014
碩士論文
[1]中國(guó)大鯢Sox3、Sox5基因cDNA序列的克隆及組織表達(dá)分析[D]. 張向偉.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]兩種泥鰍SOX3基因的克隆、表達(dá)和功能分析[D]. 張林霞.河南師范大學(xué) 2015
[3]青島文昌魚Sox1/2/3-like基因的擴(kuò)增與表達(dá)研究[D]. 曹慧慧.魯東大學(xué) 2011
本文編號(hào):2971787
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