金錢魚Sox3基因cDNA克隆及組織表達
發(fā)布時間：2021-01-12 00:39
金錢魚是中國重要經(jīng)濟型魚類,但其人工繁殖難以取得成功。本研究利用cDNA末端快速擴增法（rapid-amplification of cDNA ends, RACE）克隆了金錢魚（Scatophagus argus） Sox3基因cDNA全長序列,分析該基因序列在不同物種間的差異,并用RT-PCR半定量方法分析其在雌、雄組織中的表達差異。結(jié)果表明:金錢魚Sox3 c DNA全長1 270 bp,包括5’非翻譯區(qū)（5’-UTR） 217 bp、3’非翻譯區(qū)（3’-UTR） 150 bp和開放閱讀框（open reading frame, ORF） 903 bp,編碼300個氨基酸,該氨基酸序列34104位為HMG保守盒。金錢魚Sox3氨基酸序列與大黃魚（Larimichthys crocea）的同源性最高,為99.3%,其次是金頭鯛（Sparus aurata）,為98.7%。Sox3前體蛋白的系統(tǒng)進化樹顯示,金錢魚與大黃魚親緣關(guān)系最近。金錢魚Sox3基因的組織表達有明顯的組織特異性及性別差異,在性腺中表達量最高,雄性個體腦和垂體次之,肌肉、腎臟、心臟和腸有低量的表...
【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(07)北大核心
【文章頁數(shù)】：9 頁
【部分圖文】：
金錢魚Sox3 cDNA序列及其推導的氨基酸序列
本研究發(fā)現(xiàn)Sox3基因在金錢魚不同組織中存在表達差異，且不同性別個體的組織表達也存在差異，表明Sox3基因在多種組織中表達，并存在多種生理功能。金錢魚體內(nèi)Sox3基因的表達與其他魚類存在相似性也存在差異性。相似性是在多種魚類的腦組織中均檢測到Sox3基因具有較高的表達量，與斜帶石斑魚(姚波等,2003)、許氏平鲉(馬麗曼,2014)、斑馬魚(Dee et al,2008)和泥鰍(張林霞,2015)等魚類相似，表明Sox3基因?qū)ι窠?jīng)系統(tǒng)的正常生長發(fā)育及組織分化有著重要作用(Wang et al.,2006;許可等,2017,中國衛(wèi)生檢驗雜志,27(8):1214-1216)。在金錢魚的卵巢和精巢中均能檢測到Sox3基因較高的表達量，這點與泥鰍(張林霞,2015)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)相似，而斜帶石斑魚(姚波等,2003)和許氏平鲉(馬麗曼,2014)的Sox3基因在卵巢中的表達水平顯著高于精巢，表明Sox3基因?qū)π詣e決定及分化有著重要作用(Weiss et al.,2003;許可等,2017,中國衛(wèi)生檢驗雜志,27(8):1214-1216)。在雌性金錢魚的鰓中檢測到Sox3基因較高的表達量，而雄性金錢魚鰓中無Sox3基因表達，但在許氏平鲉(馬麗曼,2014)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)雄雌魚的鰓組織中均檢測到了較高水平的Sox3基因轉(zhuǎn)錄本。在金錢魚中，Sox3基因無性別差異地高表達于腦、垂體和性腺中，說明Sox3對于金錢魚神經(jīng)系統(tǒng)和性腺的生長發(fā)育具有重要意思，而鰓中存在Sox3性別表達差異，其差異原因及其在鰓中表達的意思仍需探討。圖5 不同脊椎動物Sox3的系統(tǒng)進化樹分析
不同脊椎動物Sox3的系統(tǒng)進化樹分析
【參考文獻】：
期刊論文
[1]金錢魚繁殖生物學及誘導產(chǎn)卵試驗[J]. 蔡澤平,王毅,胡家瑋,張俊彬,林岳光. 熱帶海洋學報. 2010(05)
[2]金錢魚生物學研究及回顧[J]. 蘭國寶,閻冰,廖思明,羅硯,謝若癡. 水產(chǎn)科學. 2005(07)
[3]斜帶石斑魚sox3基因cDNA的克隆及其時空表達特征分析[J]. 姚波,周莉,桂建芳. 高技術(shù)通訊. 2003(05)
[4]東北虎Sox3和Sox4基因的保守區(qū)序列分析[J]. 杜啟艷,常重杰,牛紅星. 河南師范大學學報(自然科學版). 2003(01)
[5]Sox基因家族研究的新進展[J]. 常重杰,杜啟艷,邵紅偉. 遺傳. 2002(04)
[6]SOX基因家族的研究現(xiàn)狀[J]. 常重杰,周榮家,余其興. 遺傳. 2000(01)
[7]金錢魚的生長特性與咸水池塘馴養(yǎng)[J]. 張邦杰,梁仁杰,毛大寧,張邦豪. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 1999(10)
博士論文
[1]許氏平鲉性別相關(guān)基因Sox3、Sox9和Dmrt1的研究[D]. 馬麗曼.中國海洋大學 2014
碩士論文
[1]中國大鯢Sox3、Sox5基因cDNA序列的克隆及組織表達分析[D]. 張向偉.四川農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]兩種泥鰍SOX3基因的克隆、表達和功能分析[D]. 張林霞.河南師范大學 2015
[3]青島文昌魚Sox1/2/3-like基因的擴增與表達研究[D]. 曹慧慧.魯東大學 2011
本文編號：2971787
【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(07)北大核心
【文章頁數(shù)】：9 頁
【部分圖文】：
金錢魚Sox3 cDNA序列及其推導的氨基酸序列
本研究發(fā)現(xiàn)Sox3基因在金錢魚不同組織中存在表達差異，且不同性別個體的組織表達也存在差異，表明Sox3基因在多種組織中表達，并存在多種生理功能。金錢魚體內(nèi)Sox3基因的表達與其他魚類存在相似性也存在差異性。相似性是在多種魚類的腦組織中均檢測到Sox3基因具有較高的表達量，與斜帶石斑魚(姚波等,2003)、許氏平鲉(馬麗曼,2014)、斑馬魚(Dee et al,2008)和泥鰍(張林霞,2015)等魚類相似，表明Sox3基因?qū)ι窠?jīng)系統(tǒng)的正常生長發(fā)育及組織分化有著重要作用(Wang et al.,2006;許可等,2017,中國衛(wèi)生檢驗雜志,27(8):1214-1216)。在金錢魚的卵巢和精巢中均能檢測到Sox3基因較高的表達量，這點與泥鰍(張林霞,2015)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)相似，而斜帶石斑魚(姚波等,2003)和許氏平鲉(馬麗曼,2014)的Sox3基因在卵巢中的表達水平顯著高于精巢，表明Sox3基因?qū)π詣e決定及分化有著重要作用(Weiss et al.,2003;許可等,2017,中國衛(wèi)生檢驗雜志,27(8):1214-1216)。在雌性金錢魚的鰓中檢測到Sox3基因較高的表達量，而雄性金錢魚鰓中無Sox3基因表達，但在許氏平鲉(馬麗曼,2014)和青島文昌魚(曹慧慧,2011)雄雌魚的鰓組織中均檢測到了較高水平的Sox3基因轉(zhuǎn)錄本。在金錢魚中，Sox3基因無性別差異地高表達于腦、垂體和性腺中，說明Sox3對于金錢魚神經(jīng)系統(tǒng)和性腺的生長發(fā)育具有重要意思，而鰓中存在Sox3性別表達差異，其差異原因及其在鰓中表達的意思仍需探討。圖5 不同脊椎動物Sox3的系統(tǒng)進化樹分析
不同脊椎動物Sox3的系統(tǒng)進化樹分析
【參考文獻】：
期刊論文
[1]金錢魚繁殖生物學及誘導產(chǎn)卵試驗[J]. 蔡澤平,王毅,胡家瑋,張俊彬,林岳光. 熱帶海洋學報. 2010(05)
[2]金錢魚生物學研究及回顧[J]. 蘭國寶,閻冰,廖思明,羅硯,謝若癡. 水產(chǎn)科學. 2005(07)
[3]斜帶石斑魚sox3基因cDNA的克隆及其時空表達特征分析[J]. 姚波,周莉,桂建芳. 高技術(shù)通訊. 2003(05)
[4]東北虎Sox3和Sox4基因的保守區(qū)序列分析[J]. 杜啟艷,常重杰,牛紅星. 河南師范大學學報(自然科學版). 2003(01)
[5]Sox基因家族研究的新進展[J]. 常重杰,杜啟艷,邵紅偉. 遺傳. 2002(04)
[6]SOX基因家族的研究現(xiàn)狀[J]. 常重杰,周榮家,余其興. 遺傳. 2000(01)
[7]金錢魚的生長特性與咸水池塘馴養(yǎng)[J]. 張邦杰,梁仁杰,毛大寧,張邦豪. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 1999(10)
博士論文
[1]許氏平鲉性別相關(guān)基因Sox3、Sox9和Dmrt1的研究[D]. 馬麗曼.中國海洋大學 2014
碩士論文
[1]中國大鯢Sox3、Sox5基因cDNA序列的克隆及組織表達分析[D]. 張向偉.四川農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]兩種泥鰍SOX3基因的克隆、表達和功能分析[D]. 張林霞.河南師范大學 2015
[3]青島文昌魚Sox1/2/3-like基因的擴增與表達研究[D]. 曹慧慧.魯東大學 2011
本文編號：2971787
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