多倍化是植物中的普遍現(xiàn)象,在進(jìn)化中起著至關(guān)重要的作用。多倍化過程中,會(huì)發(fā)生DNA丟失、同源重組、基因轉(zhuǎn)換和DNA甲基化等一系列的基因組變化,以克服異源多倍體引發(fā)的不相容性。近年來眾多學(xué)者已經(jīng)研究了各種多倍體植物中存在的基因表達(dá)變化。多倍體油菜作為一種重要的油料作物,在人類生活中有重要作用。高通量測(cè)序方法近年來在組學(xué)研究中被普遍應(yīng)用,是一種非常高效實(shí)用的手段。在本研究中,使用人工合成的具有明確親本關(guān)系的蕓薹屬六倍體,通過高通量測(cè)序得到了六倍體及其親本（白菜型油菜和埃塞俄比亞芥）種子兩個(gè)后期成熟階段的轉(zhuǎn)錄組,以研究蕓薹屬六倍體種子相對(duì)于親本的基因表達(dá)變化,并通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證了測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性。測(cè)序共得到805116806條reads,匹配到40142個(gè)基因。根據(jù)差異倍數(shù)≥5倍且Padj≤0.05的標(biāo)準(zhǔn)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行鑒定,在綠熟期,蕓薹屬六倍體與白菜型油菜之間有2085個(gè)差異表達(dá)基因,和埃塞俄比亞芥之間有1265個(gè)差異基因;在完熟期,六倍體與白菜型油菜和埃塞俄比亞芥之間各有2649個(gè)和1491個(gè)差異表達(dá)基因。其中大多數(shù)差異表達(dá)基因在蕓薹屬六倍體種子中與其親本相比表達(dá)水平上調(diào)。在... 

【文章來源】：武漢大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
1 緒論
    1.1 多倍體的形成與進(jìn)化
        1.1.1 植物多倍體的形成
        1.1.2 植物多倍體的特征
        1.1.3 多倍體基因表達(dá)和表觀遺傳變化
        1.1.4 蕓薹屬六倍體在多倍體研究中的應(yīng)用
    1.2 被子植物種子發(fā)育過程中的基因調(diào)控
        1.2.1 種子形態(tài)建成過程相關(guān)基因表達(dá)
        1.2.2 種子成熟過程相關(guān)基因表達(dá)
    1.3 轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物生長發(fā)育具有重要作用
    1.4 本研究的意義和目的
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 總RNA的提取與檢測(cè)
    2.3 cDNA文庫的構(gòu)建與高通量測(cè)序
    2.4 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)處理及分析
    2.5 差異表達(dá)基因分析
    2.6 qRT-PCR實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)測(cè)序準(zhǔn)確性
3 結(jié)果與分析
    3.1 植物材料形態(tài)鑒定
    3.2 RNA提取和質(zhì)量檢測(cè)
    3.3 測(cè)序結(jié)果總體分析
    3.4 基因表達(dá)和功能分析
    3.5 差異表達(dá)基因鑒定
    3.6 差異表達(dá)基因的GO功能分析
    3.7 差異表達(dá)基因的KEGG通路分析
    3.8 差異表達(dá)基因的轉(zhuǎn)錄因子基因預(yù)測(cè)
    3.9 非加性表達(dá)基因分析
    3.10 蕓薹屬六倍體基因表達(dá)偏向性分析
    3.11 實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)
4 討論
    4.1 蕓薹屬六倍體種子基因表達(dá)偏向性及非加性表達(dá)
    4.2 轉(zhuǎn)錄因子基因可能加強(qiáng)蕓薹屬六倍體種子的環(huán)境適應(yīng)能力
    4.3 差異表達(dá)基因可能在蕓薹屬六倍體種子后期成熟過程中具有重要作用
5 結(jié)論與展望
    5.1 本文主要結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表及投稿論文
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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