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羅氏沼蝦生長性狀候選基因的克隆及mRNA表達(dá)規(guī)律研究

發(fā)布時(shí)間:2021-01-10 14:11
  羅氏沼蝦(Macrobrachium rosenbergii)是國內(nèi)主要的淡水蝦養(yǎng)殖品。當(dāng)前,我國羅氏沼蝦種苗繁育和養(yǎng)殖技術(shù)達(dá)到國際先進(jìn)水平,但仍存在規(guī)格不均、個(gè)體小型化、產(chǎn)量低下等問題,嚴(yán)重制約著我國羅氏沼蝦養(yǎng)殖業(yè)優(yōu)質(zhì)、高效地發(fā)展。因此,開展羅氏沼蝦生長性狀候選基因的研究,明確其表達(dá)規(guī)律,可為進(jìn)一步探究候選基因在生長發(fā)育過程中的調(diào)控機(jī)制提供依據(jù)。以孟加拉群體為基礎(chǔ)群,構(gòu)建20個(gè)全同胞家系,比較其生長性狀,篩選出生長快速家系(fast-growing group,FG)和生長慢速家系(slow-growing group,SG);選取胰蛋白酶(Trypsin,TRY)、淀粉酶(Amylase,AMY)、組織蛋白酶L(Cathepsin,CaTL)、肌肉生長抑制素(Myostatin,MSTN)、維甲酸X受體(Retinoid X receptor,RXR)、Ras相關(guān)蛋白(Ras-related nuclear protein,Ran)、熱休克蛋白 90(Heat shock protein 90,HSP90)和蛻皮激素受體(Ecdysone receptor,EcR)8個(gè)與生長性狀相... 

【文章來源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】:110 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞中英文對照表
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 羅氏沼蝦的生長發(fā)育過程
    1.2 羅氏沼蝦養(yǎng)殖現(xiàn)狀
        1.2.1 羅氏沼蝦的分布及現(xiàn)狀
        1.2.2 目前養(yǎng)殖過程中存在的問題
        1.2.3 常規(guī)育種現(xiàn)狀
    1.3 生長性狀候選基因的研究進(jìn)展
        1.3.1 TRY基因研究進(jìn)展
        1.3.2 AMY基因研究進(jìn)展
        1.3.3 CaTL基因研究進(jìn)展
        1.3.4 MSTN基因研究進(jìn)展
        1.3.5 RXR基因研究進(jìn)展
        1.3.6 Ran基因研究進(jìn)展
        1.3.7 HSP90基因研究進(jìn)展
        1.3.8 EcR基因研究進(jìn)展
    1.4 研究目的及意義
第二章 羅氏沼蝦家系構(gòu)建及不同家系間生長性狀比較
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 親蝦交配
        2.2.2 家系幼體的標(biāo)準(zhǔn)化培育
        2.2.3 性狀測量
        2.2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 20個(gè)家系生長性狀的表型數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
        2.3.2 羅氏沼蝦不同家系的生長性狀比較
        2.3.3 不同生長速度家系的生長性狀比較
    2.4 討論
        2.4.1 羅氏沼蝦家系構(gòu)建
        2.4.2 不同家系生長性狀比較
        2.4.3 生長快慢家系的性狀比較
    2.5 小結(jié)
第三章 羅氏沼蝦生長性狀候選基因的克隆和生物信息學(xué)分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
        3.1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑和配置方法
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)主要儀器設(shè)備
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 羅氏沼蝦肝胰腺組織總RNA的提取
        3.2.2 cDNA的合成
        3.2.3 克隆引物的設(shè)計(jì)與合成
        3.2.4 PCR擴(kuò)增
        3.2.5 目的片段與pMD18-T載體連接
        3.2.6 pMD18-T重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化
        3.2.7 重組質(zhì)粒的PCR鑒定和測序鑒定
        3.2.8 羅氏沼蝦候選基因的生物信息學(xué)分析
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 肝胰腺總RNA提取結(jié)果
        3.3.2 TRY基因結(jié)果
        3.3.3 AMY基因結(jié)果
        3.3.4 CaTL基因結(jié)果
        3.3.5 MSTN基因結(jié)果
        3.3.6 RXR基因結(jié)果
        3.3.7 Ran基因結(jié)果
        3.3.8 HSP90基因結(jié)果
        3.3.9 EcR基因結(jié)果
    3.4 討論
    3.5 小結(jié)
第四章 羅氏沼蝦生長性狀候選基因組織表達(dá)譜分析
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
        4.1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑
        4.1.3 主要儀器和設(shè)備
    4.2 實(shí)驗(yàn)方法
        4.2.1 羅氏沼蝦各組織RNA的提取
        4.2.2 羅氏沼蝦各組織cDNA的合成
        4.2.3 定量引物的設(shè)計(jì)與合成
        4.2.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
    4.3 結(jié)果
        4.3.1 羅氏沼蝦各組織RNA電泳圖
        4.3.2 羅氏沼蝦TRY基因的組織表達(dá)
        4.3.3 羅氏沼蝦AMY基因的組織表達(dá)
        4.3.4 羅氏沼蝦CaTL基因的組織表達(dá)
        4.3.5 羅氏沼蝦MSTN基因的組織表達(dá)
        4.3.6 羅氏沼蝦RXR基因的組織表達(dá)
        4.3.7 羅氏沼蝦Ran基因的組織表達(dá)
        4.3.8 羅氏沼蝦HSP90基因的組織表達(dá)
        4.3.9 羅氏沼蝦EcR基因的組織表達(dá)
    4.4 討論
        4.4.1 TRY、AMY、CaTL和HSP90基因的表達(dá)分析
        4.4.2 MSTN、RXR、Ran和ECR基因的表達(dá)分析
    4.5 小結(jié)
第五章 候選基因在羅氏沼蝦不同生長速度家系中的表達(dá)分析
    5.1 實(shí)驗(yàn)材料
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
        5.1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑
        5.1.3 主要儀器
    5.2 實(shí)驗(yàn)方法
        5.2.1 肌肉組織總RNA的提取
        5.2.2 羅氏沼蝦肌肉組織cDNA的合成
        5.2.3 引物的設(shè)計(jì)與合成
        5.2.4 羅氏沼蝦候選基因熒光定量表達(dá)
    5.3 結(jié)果
        5.3.1 羅氏沼蝦肌肉組織RNA電泳圖
        5.3.2 羅氏沼蝦不同生長速度
        5.3.3 基因在不同生長速度家系個(gè)體中的表達(dá)
    5.4 討論
        5.4.1 TRY、AMY、CaTL和HSP90基因在不同生長速度家系個(gè)體中的表達(dá)分析
        5.4.2 MSTN、RXR、Ran和ECR基因在不同生長速度家系個(gè)體中的表達(dá)分析
    5.5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
碩士期間發(fā)表論文情況


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]離體豬肝膽道內(nèi)射頻消融時(shí)毗鄰膽道熱休克蛋白70表達(dá)情況[J]. 楊超,盧偉,馬軍朋,楊劍,蔣富強(qiáng),杜鵬,張嘉誠,解鵬,張哲.  轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2018(03)
[2]淇河鯽不同家系生長性能的比較[J]. 王磊,施文瑞,宋東鎣,馬曉,吳利敏,李學(xué)軍,陳軍平,張世杰,孫亞威,許莎諾.  淡水漁業(yè). 2018(03)
[3]中華絨螯蟹MSTN基因SNPs多態(tài)性及與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 陳義培,吳廉,陳曉雯,岳武成,黃姝,王軍,王成輝.  水生生物學(xué)報(bào). 2018(02)
[4]淇河鯽家系早期生長性能的比較[J]. 陳軍平,王婭,王磊,樊云鵬,張世杰,許沙諾,齊如意,張紅,高興磊.  河南水產(chǎn). 2018(01)
[5]斑節(jié)對蝦α-淀粉酶基因的克隆及其表達(dá)分析[J]. 楊其彬,李運(yùn)東,江世貴,黃建華,姜松,邱麗華,朱彩艷,周發(fā)林.  水生生物學(xué)報(bào). 2017(06)
[6]青蝦Ran基因的克隆、表達(dá)及其在卵巢發(fā)育中的功能[J]. 卜宗元,傅洪拓,孫盛明,喬慧,金舒博,張文宜,龔永生,蔣速飛,熊貽偉,吳滟.  中國水產(chǎn)科學(xué). 2017(03)
[7]脊尾白蝦MSTN基因組織及不同蛻皮后時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)特征[J]. 薛蓓,張培,李志輝,趙蓮,邰小飛,徐曄,賴曉芳,高煥,閻斌倫.  淮海工學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(04)
[8]中華絨螯蟹蛻殼生長及其與相關(guān)基因表達(dá)的關(guān)聯(lián)分析[J]. 陳嬌,岳武成,陳曉雯,慈元吉,黃姝,王軍,王成輝.  動(dòng)物學(xué)雜志. 2016(06)
[9]甲殼類生長相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 閻斌倫,薛蓓,趙蓮,高煥.  海洋湖沼通報(bào). 2016(04)
[10]斷肢再生對中華絨螯蟹蛻殼、生長及相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 岳武成,陳嬌,慈元吉,黃姝,王軍,王成輝.  浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2016(04)

博士論文
[1]凡納濱對蝦生長性能相關(guān)候選基因的分離鑒定、表達(dá)規(guī)律及調(diào)控功能研究[D]. 錢昭英.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[2]草魚、鳡和翹嘴鲌胰蛋白酶和淀粉酶的早期發(fā)育[D]. 阮國良.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010

碩士論文
[1]白藜蘆醇通過脂聯(lián)素信號(hào)通路調(diào)控肌纖維類型轉(zhuǎn)化的研究[D]. 程曉芳.廣西大學(xué) 2017
[2]抑制熱休克蛋白90(HSP90)功能對斑馬魚發(fā)育的影響[D]. 羅軍濤.上海海洋大學(xué) 2017
[3]斑節(jié)對蝦生長性狀相關(guān)基因克隆及其SNP位點(diǎn)的篩選與驗(yàn)證[D]. 李運(yùn)東.上海海洋大學(xué) 2016
[4]糖化酵母葡萄糖淀粉酶基因在釀酒酵母中克隆與表達(dá)[D]. 郭彥言.長春工業(yè)大學(xué) 2015
[5]克氏原螯蝦α-淀粉酶基因的克隆與功能分析[D]. 彭濤.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[6]三疣梭子蟹RXR基因在蛻皮和卵巢發(fā)育過程中的表達(dá)分析[D]. 湯潔.寧波大學(xué) 2014
[7]三疣梭子蟹EcR基因在蛻皮和卵巢發(fā)育過程中的表達(dá)分析[D]. 崔曉雨.寧波大學(xué) 2014
[8]養(yǎng)殖密度、鹽度和溫度對羅氏沼蝦性別分化和早期性腺發(fā)育的影響[D]. 周夢穎.上海海洋大學(xué) 2014
[9]雜色鮑維甲酸X受體轉(zhuǎn)錄激活系統(tǒng)的構(gòu)建與配體篩選[D]. 鐘恩惠.集美大學(xué) 2014
[10]合浦珠母貝α-淀粉酶基因結(jié)構(gòu)、SNP篩選、生長關(guān)聯(lián)與生態(tài)響應(yīng)研究[D]. 李璐.上海海洋大學(xué) 2013



本文編號(hào):2968850

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