磷脂酰肌醇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白（PITPs）廣泛存在于真核生物細(xì)胞中,能夠在體外膜脂質(zhì)雙層之間調(diào)控磷脂酰肌醇（PtdIns）或者磷脂酰膽堿（PtdCho）單體的獨(dú)立轉(zhuǎn)運(yùn)。參與磷酸肌醇代謝、膜運(yùn)輸、極性生長(zhǎng)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、逆境脅迫、胞漿運(yùn)動(dòng)和細(xì)胞周期調(diào)節(jié)等多種重要的生命過程,在植物的逆境響應(yīng)以及發(fā)育調(diào)節(jié)中具有重要的作用。為了研究甜菜磷脂酰肌醇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因及其在低溫脅迫下的表達(dá)情況。本研究以甜菜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中一條預(yù)測(cè)的磷脂酰肌醇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因CRS1為模板,用基因克隆的方法得到一條全長(zhǎng)765 bp,開放閱讀框596 bp,編碼198個(gè)氨基酸的甜菜SEC14基因,命名為SbSEC14。理化性質(zhì)分析表明,該蛋白質(zhì)為不穩(wěn)定親水蛋白;蛋白質(zhì)二、三級(jí)結(jié)構(gòu)分析表明,該蛋白質(zhì)α-螺旋所占的比例最高,為47.47%,β-轉(zhuǎn)角所占比例最低,為5.56%;蛋白質(zhì)保守結(jié)構(gòu)分析表明,該蛋白質(zhì)有典型的SEC14結(jié)構(gòu)域;蛋白質(zhì)系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,甜菜SbSEC14基因與菠菜、藜麥的磷脂酰肌醇運(yùn)轉(zhuǎn)蛋白基因親緣關(guān)系最近;實(shí)時(shí)熒光定量結(jié)果表明,SbSEC14基因在甜菜中組成型表達(dá),在甜菜葉中的表達(dá)量最高,在甜菜根中的表達(dá)量最低,在葉中表達(dá)量... 

【文章來源】：中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2020,36(32)

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【部分圖文】：

甜菜幼苗RNA電泳檢測(cè)

甜菜Sb SEC14蛋白信號(hào)肽預(yù)測(cè)表明（圖4）該蛋白序列是信號(hào)肽的可能為0.0016，是其他序列的可能為0.9984，因此判定該蛋白沒有信號(hào)肽；疏水性/親水性預(yù)測(cè)表明（圖5）該蛋白氨基酸位點(diǎn)疏水性在第122位疏水性最強(qiáng)，分值為2.089；在第76位親水性最強(qiáng)，分值為-2.389。分值大于0的氨基酸數(shù)為77個(gè)，分值小于0的氨基酸數(shù)為113，推測(cè)甜菜Sb SEC14蛋白是一種親水蛋白。2.3.2 甜菜Sb SEC14基因編碼蛋白的一級(jí)和二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

甜菜Sb SEC14基因編碼蛋白的一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示，該蛋白分子式為C1050H1622N264O293S9，分子量為22920.56，編碼198個(gè)氨基酸，等電點(diǎn)(PI)為5.97，有27個(gè)帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Asp+Glu),25個(gè)帶正電荷的氨基酸殘基(Arg+Lys)，不穩(wěn)定系數(shù)為43.91，數(shù)值大于40，表明該蛋白不穩(wěn)定，推測(cè)該蛋白為不穩(wěn)定酸性蛋白質(zhì)。脂肪族指數(shù)為86.62，親水性平均系數(shù)值為-0.154。二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示（圖6），甜菜Sb SEC14蛋白中α-螺旋所占的比例最高，為47.47%(94)，β轉(zhuǎn)角所占比例最低，為5.56%(11)，β折疊所占15.66%(31)，無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)占31.31%(61)。圖4 甜菜Sb SEC14蛋白序列的信號(hào)肽預(yù)測(cè)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]甘蔗磷脂酰肌醇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因ScSEC14響應(yīng)干旱和鹽脅迫[J]. 毛花英,劉峰,蘇煒華,黃寧,凌輝,張旭,王文舉,李聰娜,湯翰臣,蘇亞春,闕友雄.  作物學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]普通小麥TaSEC14p-5基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 蘇世超,唐益苗,徐磊,王偉偉,高世慶,馬錦繡,孫輝,王永波,喬亞科,趙昌平.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(08)



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