基于CRISPR基因編輯技術的小鼠原發(fā)胃癌模型建立
發(fā)布時間:2021-01-10 12:57
胃癌是最常見的腫瘤之一,其發(fā)病率和死亡率在全球居于第五和第三,中國也是胃癌大國,僅次于肺癌。目前用于胃癌研究的小鼠原發(fā)性腫瘤模型造模時間長,成功率低。隨著CRISPR/Cas9基因編輯技術在腫瘤造模中的廣泛應用,針對肺癌、肝癌等的小鼠原發(fā)腫瘤模型可以快速、高效建立,幫助揭示了不同類型腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子機制,但基于CRISPR技術的小鼠原發(fā)性胃癌模型未見報導。本研究將34個抑癌基因的sg RNA文庫以及Cas9基因通過胃黏膜高壓注射導入胃部細胞,利用CRISPR/Cas9技術體內編輯抑癌基因,大約7周內誘導了胃癌的形成;利用免疫組化和PCR靶向擴增子二代測序等技術和方法,分析腫瘤結節(jié)、對應的癌旁組織、腫瘤原代細胞及單克隆,構建其抑癌基因編輯突變圖譜,發(fā)現(xiàn)在腫瘤組織中胃癌常見的抑癌基因發(fā)生了高頻率的突變,包括p53,Arid1a,Apc,Smad4,Pten等。根據(jù)突變圖譜,進一步從34個抑癌基因sg RNA文庫中選出12個sg RNA組裝成一個小文庫,這個小文庫也能在3個月內成功誘導胃部腫瘤的形成,其中p53、Arid1b、Smad4和Pten也發(fā)生了高頻突變,特別是在兩個不同文庫誘導成...
【文章來源】:浙江大學浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
靶向抑癌基因文庫信息
浙江大學碩士學位論文正文結果26圖2CRISPR技術成功誘導小鼠產生胃癌(A.實驗組和對照組小鼠胃部解剖大體觀圖,5-8號小鼠為對照組小鼠(綠色文本),9-12號小鼠為實驗組小鼠(紅色文本);B.實驗組和對照組小鼠胃黏膜高壓注射后體重變化折線圖;C.實驗組和對照組小鼠胃部腫瘤體積(1/2和腫瘤寬度2×腫瘤長度)差異圖;D.腫瘤
浙江大學碩士學位論文正文結果28圖3CRISPR誘導小鼠產生胃癌的免疫組化結果3.4胃癌靶向基因編輯圖譜本研究通過對產生腫瘤的癌旁組織,腫瘤組織和對應的原代細胞進行PCR擴增子二代深度測序來分析靶向位點的編輯情況,為了避免測序誤差的影響,本研究排除了基因編輯位點的編輯頻率小于5%的情況?偣矞y序12個樣本,其中4個癌旁組織,4個腫瘤組織和對應的原代腫瘤細胞(圖4A)。就9號小鼠所產生的癌旁組織(NT9),腫瘤組織(T9)和原代細胞(C9)而言(圖4B),發(fā)生靶向編輯的個數(shù)占總位點的個數(shù)的比率分別為5.9%(2/34),82.35%(28/34)和79.41%(27/34)。樣本NT9的Arid1b(100%)和Mlh1(21.95%)發(fā)生了編輯;T9除Apc、Atm、Axin1、Chd1、Fbxw7和Rps6ka3未發(fā)生編輯外,其余位點均
本文編號:2968747
【文章來源】:浙江大學浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
靶向抑癌基因文庫信息
浙江大學碩士學位論文正文結果26圖2CRISPR技術成功誘導小鼠產生胃癌(A.實驗組和對照組小鼠胃部解剖大體觀圖,5-8號小鼠為對照組小鼠(綠色文本),9-12號小鼠為實驗組小鼠(紅色文本);B.實驗組和對照組小鼠胃黏膜高壓注射后體重變化折線圖;C.實驗組和對照組小鼠胃部腫瘤體積(1/2和腫瘤寬度2×腫瘤長度)差異圖;D.腫瘤
浙江大學碩士學位論文正文結果28圖3CRISPR誘導小鼠產生胃癌的免疫組化結果3.4胃癌靶向基因編輯圖譜本研究通過對產生腫瘤的癌旁組織,腫瘤組織和對應的原代細胞進行PCR擴增子二代深度測序來分析靶向位點的編輯情況,為了避免測序誤差的影響,本研究排除了基因編輯位點的編輯頻率小于5%的情況?偣矞y序12個樣本,其中4個癌旁組織,4個腫瘤組織和對應的原代腫瘤細胞(圖4A)。就9號小鼠所產生的癌旁組織(NT9),腫瘤組織(T9)和原代細胞(C9)而言(圖4B),發(fā)生靶向編輯的個數(shù)占總位點的個數(shù)的比率分別為5.9%(2/34),82.35%(28/34)和79.41%(27/34)。樣本NT9的Arid1b(100%)和Mlh1(21.95%)發(fā)生了編輯;T9除Apc、Atm、Axin1、Chd1、Fbxw7和Rps6ka3未發(fā)生編輯外,其余位點均
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