玉米CKX基因的遺傳演化及其與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-10 05:19
細(xì)胞分裂素氧化酶(CKX,cytokinin oxidase)通過(guò)降解細(xì)胞分裂素(CK)參與植物生長(zhǎng)發(fā)育的諸多過(guò)程,是調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育的關(guān)鍵因素之一。細(xì)胞分裂素氧化酶由細(xì)胞分裂素氧化酶基因(CKX)編碼,后者往往以多基因家族的形式存在于植物基因組中。玉米中有13個(gè)CKX基因,其對(duì)玉米植株形態(tài)建成有著重要的影響。然而,CKX基因的遺傳演化及其遺傳變異對(duì)玉米農(nóng)藝性狀的影響卻少有報(bào)道。本研究以32份大芻草、68份玉米地方品種、348份玉米自交系為試驗(yàn)群體,采用華大基因科技有限公司的NimbleGen平臺(tái)的目標(biāo)序列捕獲技術(shù)對(duì)CKX基因進(jìn)行重測(cè)序,分析CKX基因在三個(gè)群體中的序列多態(tài)性,并探究其玉米馴化過(guò)程中的演變模式。在此基礎(chǔ)上,結(jié)合3個(gè)環(huán)境下測(cè)定的12個(gè)玉米農(nóng)藝性狀表型數(shù)據(jù),采用候選基因關(guān)聯(lián)分析方法,挖掘影響玉米農(nóng)藝性狀的關(guān)鍵變異位點(diǎn)。主要結(jié)果如下:1.在448份材料中成功地捕獲到玉米CKX基因家族的10個(gè)成員,經(jīng)多序列比對(duì)后,對(duì)其進(jìn)行序列變異分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),CKX基因在起始密碼子上游、內(nèi)含子、終止密碼子下游的核苷酸多態(tài)性較高,而編碼區(qū)(CDS)則相對(duì)較低。從馴化過(guò)程來(lái)看,CKX基因各區(qū)段的...
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:52 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
1 前言
1.1 細(xì)胞分裂素的發(fā)現(xiàn)
1.2 細(xì)胞分裂素氧化酶的研究概況
1.2.1 細(xì)胞分裂素氧化酶的作用機(jī)制
1.2.2 細(xì)胞分裂素氧化酶的生理作用
1.2.3 細(xì)胞分裂素氧化酶基因的研究進(jìn)展
1.2.4 細(xì)胞分裂素氧化酶基因的表達(dá)調(diào)控
1.3 玉米的起源與馴化
1.4 中性進(jìn)化理論
1.5 關(guān)聯(lián)分析
1.5.1 關(guān)聯(lián)分析的基本原理
1.5.2 關(guān)聯(lián)分析的優(yōu)勢(shì)
1.5.3 關(guān)聯(lián)分析的策略
1.5.4 關(guān)聯(lián)分析在玉米中的研究進(jìn)展
1.6 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 供試材料與田間試驗(yàn)
2.2 表型分析
2.3 DNA提取及候選基因重測(cè)序
2.4 序列變異分析
2.5 群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系分析
2.6 候選基因的關(guān)聯(lián)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 CKX基因的序列變異
3.1.1 CKX基因的重測(cè)序及其在所有材料中的核苷酸多態(tài)性
3.1.2 CKX基因在不同群體中核苷酸多態(tài)性
3.1.4 CKX基因的序列演化模式
3.2 自交系群體農(nóng)藝性狀的統(tǒng)計(jì)分析
3.3 CKX基因家族與玉米農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.3.1 CKX6與葉寬的關(guān)聯(lián)分析
3.3.2 CKX4與莖粗、葉寬的關(guān)聯(lián)分析
4 討論
4.1 候選基因的多序列比對(duì)
4.2 CKX基因的序列變異
4.3 CKX基因與玉米農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)
4.4 農(nóng)藝性狀對(duì)玉米育種的重要性
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物內(nèi)源激素研究進(jìn)展[J]. 王麗萍,李志剛,譚樂和,宋應(yīng)輝,練飛松,楊逢春,閆林,吳剛. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(04)
[2]細(xì)胞分裂素氧化酶/脫氫酶的生理生化和分子特性[J]. 張芬,郭得平,林明麗,閆淼淼. 植物生理學(xué)通訊. 2008(04)
[3]細(xì)胞分裂素氧化酶[J]. 鄧江明,潘瑞熾. 植物生理學(xué)通訊. 1997(05)
碩士論文
[1]玉米花序發(fā)育相關(guān)基因TD1與FEA2的序列變異及其與產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 喻俊杰.揚(yáng)州大學(xué) 2018
本文編號(hào):2968136
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:52 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
1 前言
1.1 細(xì)胞分裂素的發(fā)現(xiàn)
1.2 細(xì)胞分裂素氧化酶的研究概況
1.2.1 細(xì)胞分裂素氧化酶的作用機(jī)制
1.2.2 細(xì)胞分裂素氧化酶的生理作用
1.2.3 細(xì)胞分裂素氧化酶基因的研究進(jìn)展
1.2.4 細(xì)胞分裂素氧化酶基因的表達(dá)調(diào)控
1.3 玉米的起源與馴化
1.4 中性進(jìn)化理論
1.5 關(guān)聯(lián)分析
1.5.1 關(guān)聯(lián)分析的基本原理
1.5.2 關(guān)聯(lián)分析的優(yōu)勢(shì)
1.5.3 關(guān)聯(lián)分析的策略
1.5.4 關(guān)聯(lián)分析在玉米中的研究進(jìn)展
1.6 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 供試材料與田間試驗(yàn)
2.2 表型分析
2.3 DNA提取及候選基因重測(cè)序
2.4 序列變異分析
2.5 群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系分析
2.6 候選基因的關(guān)聯(lián)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 CKX基因的序列變異
3.1.1 CKX基因的重測(cè)序及其在所有材料中的核苷酸多態(tài)性
3.1.2 CKX基因在不同群體中核苷酸多態(tài)性
3.1.4 CKX基因的序列演化模式
3.2 自交系群體農(nóng)藝性狀的統(tǒng)計(jì)分析
3.3 CKX基因家族與玉米農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.3.1 CKX6與葉寬的關(guān)聯(lián)分析
3.3.2 CKX4與莖粗、葉寬的關(guān)聯(lián)分析
4 討論
4.1 候選基因的多序列比對(duì)
4.2 CKX基因的序列變異
4.3 CKX基因與玉米農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)
4.4 農(nóng)藝性狀對(duì)玉米育種的重要性
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物內(nèi)源激素研究進(jìn)展[J]. 王麗萍,李志剛,譚樂和,宋應(yīng)輝,練飛松,楊逢春,閆林,吳剛. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(04)
[2]細(xì)胞分裂素氧化酶/脫氫酶的生理生化和分子特性[J]. 張芬,郭得平,林明麗,閆淼淼. 植物生理學(xué)通訊. 2008(04)
[3]細(xì)胞分裂素氧化酶[J]. 鄧江明,潘瑞熾. 植物生理學(xué)通訊. 1997(05)
碩士論文
[1]玉米花序發(fā)育相關(guān)基因TD1與FEA2的序列變異及其與產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 喻俊杰.揚(yáng)州大學(xué) 2018
本文編號(hào):2968136
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