背景:增加中性粒細胞的數(shù)量對于攻擊入侵的病原體是必不可少的,而不適當(dāng)?shù)卦黾咏M織中的中性粒細胞的數(shù)量可能會造成不必要的組織損傷。研究中性粒細胞增多的關(guān)鍵基因和通路的變化,可以為闡明炎癥性疾病、某些免疫學(xué)和血液學(xué)疾病的發(fā)病機制提供了理論依據(jù)。目的:找到中性粒細胞增多時發(fā)生明顯差異變化的關(guān)鍵基因及信號通路。方法:首先,從GEO（Gene Expression Omnibus）數(shù)據(jù)系列GSE64457,GSE94923,GSE54644中篩選并下載49個實驗樣本和22個對照樣本的基因芯片數(shù)據(jù)。這三個數(shù)據(jù)系列里實驗樣本分別包括膿毒性休克患者的中性粒細胞、用GM-CSF或PKA激動劑刺激后的正常中性粒細胞、紅細胞增多癥患者的中性粒細胞。其次,我們在R軟件中使用limma包等篩選鑒定出差異表達基因（differentially expressed genes,DEGs）,并進行了層次聚類分析。最后,通過將每兩個數(shù)據(jù)集中的上調(diào)的DEGs和下調(diào)的DEGs分別取交集,得到110個上調(diào)DEGs和108個下調(diào)DEGs用于進一步分析,然后采用包括DAVID、PATHER、Reactome、STRING及Cyto... 

【文章來源】： 何誠成 西南醫(yī)科大學(xué)

【文章頁數(shù)】：86 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

三個數(shù)據(jù)集的熱圖

西南醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文18圖3用所有的候選差異表達基因(DEGs)富集得到的前15位基因本體(GO)條目及通路。Figure3.Thetop15ofintegratedresultsofgeneontologyandpathwayenrichmentanalysisusingallcandidateDEGs.圖4用表達上調(diào)的候選差異表達基因(DEGs)富集得到的前15位基因本體(GO)條目及通路

西南醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文18圖3用所有的候選差異表達基因(DEGs)富集得到的前15位基因本體(GO)條目及通路。Figure3.Thetop15ofintegratedresultsofgeneontologyandpathwayenrichmentanalysisusingallcandidateDEGs.圖4用表達上調(diào)的候選差異表達基因(DEGs)富集得到的前15位基因本體(GO)條目及通路

【參考文獻】：
期刊論文
[1]CD44 and Hematologic Malignancies[J]. Jianing Liu1 and Guosheng Jiang1, 21Department of Hemato-oncology, Institute of Basic Medicine, Shandong Academy of Medical Science, Jinan 250062, Shandong, China;.  Cellular & Molecular Immunology. 2006(05)



本文編號：2966963