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高通量技術(shù)檢測(cè)抑癌基因Pitx2靜默后PanIN細(xì)胞中下游基因改變

發(fā)布時(shí)間:2021-01-08 01:27
  目的:運(yùn)用小鼠基因轉(zhuǎn)錄本的全基因表達(dá)譜芯片,研究Pitx2基因靜默前后胰腺上皮內(nèi)瘤變(pancreatic intraepithelial neoplasia, PanIN)細(xì)胞下游基因表達(dá)譜的變化。方法 :應(yīng)用小鼠全基因芯片檢測(cè)Pitx2基因靜默前后PanIN細(xì)胞基因表達(dá)譜的變化,并運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量多聚酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)對(duì)部分芯片結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:根據(jù)基因芯片篩選出差異倍數(shù)3倍以上的差異表達(dá)基因共97條。其中上調(diào)58條,涉及細(xì)胞增殖的基因包括Rac1、Ccr1、Fut9、PPP3CA、Sox5、Bmp7、Chtf18、Btg4、Flt4、Dscaml1和Pftk1;涉及細(xì)胞轉(zhuǎn)移的基因包括Sesn1、Rpl7a、PPP3CA、Sox5、Bmp7、PIK3C2G、Cxcl12、Btg4和Kcnj14。下調(diào)39條,涉及細(xì)胞增殖的基因包括PPP2R2A、Nav1、PPP2R3C、Katnb1、Gpbp1、Nat3、Tgm5和PRKRA;涉及細(xì)胞轉(zhuǎn)移的基因包括PPP2R2A、Lce1c、Hcn1、PPP2R3C、Tbxas1、Chrna1、... 

【文章來源】:內(nèi)科理論與實(shí)踐. 2020,15(04)

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
材料與方法
    一、細(xì)胞株
    二、基因芯片
    三、細(xì)胞復(fù)蘇與培養(yǎng)
    四、RNA提取
    五、單標(biāo)記芯片實(shí)驗(yàn)
    六、實(shí)時(shí)定量PCR
    七、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
結(jié)果
    一、基因芯片結(jié)果
    二、Pan IN-P細(xì)胞與Pan IN-C細(xì)胞差異基因功能匯總
    三、實(shí)時(shí)定量PCR對(duì)部分芯片結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證
討論



本文編號(hào):2963632

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