小麥A基因組中γ類醇溶蛋白基因的克隆及其對小麥面筋品質(zhì)的影響
發(fā)布時間:2021-01-06 16:36
小麥作為世界上主要的糧食作物之一,可以制作成面包、饅頭、蛋糕等制品,這種多樣的加工品質(zhì)特性主要受籽粒中面筋品質(zhì)的影響。面筋品質(zhì)由面筋所含的谷蛋白和醇溶蛋白共同決定,然而,編碼醇溶蛋白的基因作為多基因家族,具有拷貝多、序列相似性高等特點,且普通小麥(Triticum aestivum)作為異源六倍體,基因組龐大、遺傳背景復(fù)雜,對于醇溶蛋白多基因家族的鑒定及分析帶來了困難。鑒于上述因素,本研究使用已經(jīng)測序的普通小麥A基因組祖先種烏拉爾圖小麥(Triticum urartu)作為研究材料,對編碼醇溶蛋白主要成員之一的γ類醇溶蛋白多基因家族進行克隆,并分析其對小麥面筋品質(zhì)的影響。通過簡并PCR擴增及序列比對分析,共鑒定到99條γ類醇溶蛋白基因;诨虻亩嘈蛄斜葘瓦M化樹構(gòu)建,分析發(fā)現(xiàn)該類多基因家族可分為4組,兩大類,其中分組1、2、3歸為一類,均含有烏拉爾圖小麥中已報道的γ類醇溶蛋白基因,而4單獨歸為一類,不含有已報道的基因,可能屬于新型γ類醇溶蛋白的多基因類別。通過對這些基因的表達模式分析,發(fā)現(xiàn)在15天小麥籽粒中,分組1、2、3、4的基因表達水平依次降低;诙嗷蚓哂胁煌谋磉_模式,本研...
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻綜述
1.1 小麥醇溶蛋白研究現(xiàn)狀
1.1.1 小麥籽粒蛋白分類
1.1.2 小麥醇溶蛋白基因的染色體定位
1.1.3 小麥醇溶蛋白對小麥面筋品質(zhì)的影響
1.1.4 小麥醇溶蛋白的一級結(jié)構(gòu)
1.1.5 小麥醇溶蛋白與乳糜瀉
1.2 轉(zhuǎn)錄組測序
1.3 基因芯片技術(shù)
1.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析
1.5 本研究的目的與意義
2 γ類醇溶蛋白基因的克隆及序列分析
2.1 材料
2.1.1 材料
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 DNA提取
2.2.2 引物設(shè)計與合成
2.2.3 γ類醇溶蛋白基因的PCR擴增
2.2.4 目的DNA片段的回收
2.2.5 目的DNA片段的連接
2.2.6 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.2.7 菌落PCR檢測陽性單克隆
2.2.8 序列分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 烏拉爾圖小麥中γ類醇溶蛋白基因擴增結(jié)果及序列匯總
2.3.2 多序列比對及序列分析
2.3.3 進化樹構(gòu)建與聚類分析
2.3.4 乳糜瀉抗原表位的預(yù)測
2.4 小結(jié)
3 γ類醇溶蛋白基因表達模式的分析
3.1 材料
3.1.1 材料
3.1.2 主要試劑
3.1.3 主要儀器
3.2 方法
3.2.1 實時熒光定量PCR
3.2.2 啟動子甲基化分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 γ類醇溶蛋白基因在烏拉爾圖小麥不同組織中的表達趨勢
3.3.2 γ類醇溶蛋白基因啟動子甲基化頻率及順式調(diào)控元件分析
3.4 小結(jié)
4 γ類醇溶蛋白對小麥面筋品質(zhì)的影響
4.1 材料
4.1.1 材料
4.1.2 主要試劑
4.1.3 主要儀器
4.2 方法
4.2.1 轉(zhuǎn)錄組測序
4.2.2 小麥面筋品質(zhì)指標(biāo)檢測
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 品質(zhì)指標(biāo)在不同小麥品種間的變異與相關(guān)性
4.3.2 γ類醇溶蛋白基因在120個品種內(nèi)的表達量
4.3.3 γ類醇溶蛋白基因的表達量與不同品質(zhì)數(shù)據(jù)間的相關(guān)分析
4.4 小結(jié)
5 γ類醇溶蛋白基因表達量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
5.1 材料
5.2 方法
5.3 結(jié)果與分析
5.4 小結(jié)
6 討論與結(jié)論
6.1 γ類醇溶蛋白基因在普通小麥A基因組中的拷貝與分類
6.2 γ類醇溶蛋白基因的表達特點及其與小麥面筋品質(zhì)間的關(guān)系
6.3 影響γ類醇溶蛋白基因表達水平的因素及關(guān)鍵位點的檢測
6.4 結(jié)論
參考文獻
附錄
個人簡歷
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]使用面筋峰值儀快速評價小麥品質(zhì)的研究[J]. 宋亞博,宋斌,麻琦,趙仁勇. 河南工業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(05)
[2]The brassinosteroid signal transduction pathway[J]. Zhi-Yong Wang~(1,2) Qiaomei Wang~3 Kang Chong~2 Fengru Wang~2 Lei Wang~2 Mingyi Bai~2 Chengguo Jia~3 ~1Department of Plant Biology,Carnegie Institution,Stanford,CA 94305,USA;~2Key Laboratory of Photosynthesis and Environmental Molecular Physiology,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100093,China:~3Department of Horticulture,Zheijang University,Hangzhou 310029,China. Cell Research. 2006(05)
[3]麥膠性腸病實驗診斷的進展[J]. 張燕,劉小方,歐陽欽. 臨床內(nèi)科雜志. 2001(01)
[4]小麥品質(zhì)性狀的遺傳及其遺傳改良[J]. 劉廣田,李保云. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2000(04)
碩士論文
[1]優(yōu)質(zhì)麥籽發(fā)育轉(zhuǎn)錄組構(gòu)建及品質(zhì)相關(guān)基因的挖掘[D]. 謝瑩.鄭州大學(xué) 2014
本文編號:2960898
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻綜述
1.1 小麥醇溶蛋白研究現(xiàn)狀
1.1.1 小麥籽粒蛋白分類
1.1.2 小麥醇溶蛋白基因的染色體定位
1.1.3 小麥醇溶蛋白對小麥面筋品質(zhì)的影響
1.1.4 小麥醇溶蛋白的一級結(jié)構(gòu)
1.1.5 小麥醇溶蛋白與乳糜瀉
1.2 轉(zhuǎn)錄組測序
1.3 基因芯片技術(shù)
1.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析
1.5 本研究的目的與意義
2 γ類醇溶蛋白基因的克隆及序列分析
2.1 材料
2.1.1 材料
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 DNA提取
2.2.2 引物設(shè)計與合成
2.2.3 γ類醇溶蛋白基因的PCR擴增
2.2.4 目的DNA片段的回收
2.2.5 目的DNA片段的連接
2.2.6 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.2.7 菌落PCR檢測陽性單克隆
2.2.8 序列分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 烏拉爾圖小麥中γ類醇溶蛋白基因擴增結(jié)果及序列匯總
2.3.2 多序列比對及序列分析
2.3.3 進化樹構(gòu)建與聚類分析
2.3.4 乳糜瀉抗原表位的預(yù)測
2.4 小結(jié)
3 γ類醇溶蛋白基因表達模式的分析
3.1 材料
3.1.1 材料
3.1.2 主要試劑
3.1.3 主要儀器
3.2 方法
3.2.1 實時熒光定量PCR
3.2.2 啟動子甲基化分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 γ類醇溶蛋白基因在烏拉爾圖小麥不同組織中的表達趨勢
3.3.2 γ類醇溶蛋白基因啟動子甲基化頻率及順式調(diào)控元件分析
3.4 小結(jié)
4 γ類醇溶蛋白對小麥面筋品質(zhì)的影響
4.1 材料
4.1.1 材料
4.1.2 主要試劑
4.1.3 主要儀器
4.2 方法
4.2.1 轉(zhuǎn)錄組測序
4.2.2 小麥面筋品質(zhì)指標(biāo)檢測
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 品質(zhì)指標(biāo)在不同小麥品種間的變異與相關(guān)性
4.3.2 γ類醇溶蛋白基因在120個品種內(nèi)的表達量
4.3.3 γ類醇溶蛋白基因的表達量與不同品質(zhì)數(shù)據(jù)間的相關(guān)分析
4.4 小結(jié)
5 γ類醇溶蛋白基因表達量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
5.1 材料
5.2 方法
5.3 結(jié)果與分析
5.4 小結(jié)
6 討論與結(jié)論
6.1 γ類醇溶蛋白基因在普通小麥A基因組中的拷貝與分類
6.2 γ類醇溶蛋白基因的表達特點及其與小麥面筋品質(zhì)間的關(guān)系
6.3 影響γ類醇溶蛋白基因表達水平的因素及關(guān)鍵位點的檢測
6.4 結(jié)論
參考文獻
附錄
個人簡歷
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]使用面筋峰值儀快速評價小麥品質(zhì)的研究[J]. 宋亞博,宋斌,麻琦,趙仁勇. 河南工業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(05)
[2]The brassinosteroid signal transduction pathway[J]. Zhi-Yong Wang~(1,2) Qiaomei Wang~3 Kang Chong~2 Fengru Wang~2 Lei Wang~2 Mingyi Bai~2 Chengguo Jia~3 ~1Department of Plant Biology,Carnegie Institution,Stanford,CA 94305,USA;~2Key Laboratory of Photosynthesis and Environmental Molecular Physiology,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100093,China:~3Department of Horticulture,Zheijang University,Hangzhou 310029,China. Cell Research. 2006(05)
[3]麥膠性腸病實驗診斷的進展[J]. 張燕,劉小方,歐陽欽. 臨床內(nèi)科雜志. 2001(01)
[4]小麥品質(zhì)性狀的遺傳及其遺傳改良[J]. 劉廣田,李保云. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2000(04)
碩士論文
[1]優(yōu)質(zhì)麥籽發(fā)育轉(zhuǎn)錄組構(gòu)建及品質(zhì)相關(guān)基因的挖掘[D]. 謝瑩.鄭州大學(xué) 2014
本文編號:2960898
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