玉米散粉期的基因定位與全基因組選擇研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-04 23:03
玉米(Zea.mays.L)作為我國(guó)總產(chǎn)量最高的糧食作物,其產(chǎn)量和品質(zhì)的提高是保障我國(guó)糧食安全的重大舉措。全基因組選擇(Genomic Selection,GS)首先利用訓(xùn)練群體估計(jì)分子標(biāo)記效應(yīng),然后利用覆蓋基因組的分子標(biāo)記來計(jì)算預(yù)測(cè)群體的重要農(nóng)藝性狀的基因組估計(jì)育種值,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)育種材料的篩選,因而GS在玉米的商業(yè)化育種中具有廣闊的應(yīng)用前景。本研究利用骨干自交系PH4CV為父本,鄭58為母本,構(gòu)建481份BC1F3遺傳家系。通過2016和2017年北京順義和新疆昌吉的散粉期表型鑒定和玉米55 K芯片基因型鑒定,進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析和GS分析,主要研究結(jié)果如下:1.利用兩年兩點(diǎn)散粉期最佳線性無偏估計(jì)值(Best Linear Unbiased Estimation,BLUE)和基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行遺傳方差分解,發(fā)現(xiàn)在散粉期遺傳變異中,加性方差占據(jù)77.6%,加加互作方差占14.3%,顯顯互作方差占5.6%,不存在加顯互作方差,說明在該群體中散粉期性狀主要受到基因加性效應(yīng)影響,非加性效應(yīng)并不明顯。同時(shí),利用GWAS方法對(duì)數(shù)量性狀位點(diǎn)(Quantita...
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
全基因組選擇育種流程(Crossaetal.,2017)
士學(xué)位論文 第二章 花期性狀分析群體多環(huán)境表型分析結(jié)果境下的材料,計(jì)算 2 次重復(fù)的平均值,不同環(huán)境下散粉期性狀的果如表 1,可以發(fā)現(xiàn),散粉期數(shù)據(jù)的變異系數(shù)均在 5%以內(nèi),遺傳高溫、積溫偏高,導(dǎo)致 17BJ 環(huán)境下散粉期提前。表 2.1 四個(gè)環(huán)境下,BC1F3:4群體 DA 表型基本統(tǒng)計(jì)量e 2.1 Basic statistical description of DA of the BC1F3:4population in four environN Mean SD Min Max CV/%480 73.09 2.13 68.5 79.5 2.91467 72.68 2.57 67.5 79.5 3.53410 63.55 2.43 57 71 3.83355 70.13 2.69 64.5 78 3.84D:標(biāo)準(zhǔn)差;CV:變異系數(shù);Heritability: 遺傳力性的分析和數(shù)據(jù)分布如圖 2.1。在不同環(huán)境之間相關(guān)系數(shù)在 0.48環(huán)境的相關(guān)性較高。
學(xué)院碩士學(xué)位論文 第二章 花期性狀全基因表 2.2 SNP 標(biāo)記在基因組的分布Tbale 2.2 Distribution of SNPs across the genome標(biāo)記個(gè)數(shù) 起始物理位置(Mb) 終止物理距離(Mb) 區(qū)間大小(Mb) 標(biāo)記平均距1885 5.633 301.204 295.570 0.151162 0.167 236.968 236.801 0.201310 0.163 232.075 231.912 0.171420 4.321 246.361 242.040 0.171128 0.947 217.628 216.681 0.191043 5.398 169.227 163.829 0.15959 0.033 175.286 175.253 0.18988 0.098 175.787 175.689 0.171045 0.068 155.980 155.912 0.14841 0.276 150.018 149.743 0.17Mb大小為窗口,計(jì)算區(qū)間內(nèi)的標(biāo)記個(gè)數(shù),繪制標(biāo)記密度在基因組上分布的熱圖
本文編號(hào):2957528
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
全基因組選擇育種流程(Crossaetal.,2017)
士學(xué)位論文 第二章 花期性狀分析群體多環(huán)境表型分析結(jié)果境下的材料,計(jì)算 2 次重復(fù)的平均值,不同環(huán)境下散粉期性狀的果如表 1,可以發(fā)現(xiàn),散粉期數(shù)據(jù)的變異系數(shù)均在 5%以內(nèi),遺傳高溫、積溫偏高,導(dǎo)致 17BJ 環(huán)境下散粉期提前。表 2.1 四個(gè)環(huán)境下,BC1F3:4群體 DA 表型基本統(tǒng)計(jì)量e 2.1 Basic statistical description of DA of the BC1F3:4population in four environN Mean SD Min Max CV/%480 73.09 2.13 68.5 79.5 2.91467 72.68 2.57 67.5 79.5 3.53410 63.55 2.43 57 71 3.83355 70.13 2.69 64.5 78 3.84D:標(biāo)準(zhǔn)差;CV:變異系數(shù);Heritability: 遺傳力性的分析和數(shù)據(jù)分布如圖 2.1。在不同環(huán)境之間相關(guān)系數(shù)在 0.48環(huán)境的相關(guān)性較高。
學(xué)院碩士學(xué)位論文 第二章 花期性狀全基因表 2.2 SNP 標(biāo)記在基因組的分布Tbale 2.2 Distribution of SNPs across the genome標(biāo)記個(gè)數(shù) 起始物理位置(Mb) 終止物理距離(Mb) 區(qū)間大小(Mb) 標(biāo)記平均距1885 5.633 301.204 295.570 0.151162 0.167 236.968 236.801 0.201310 0.163 232.075 231.912 0.171420 4.321 246.361 242.040 0.171128 0.947 217.628 216.681 0.191043 5.398 169.227 163.829 0.15959 0.033 175.286 175.253 0.18988 0.098 175.787 175.689 0.171045 0.068 155.980 155.912 0.14841 0.276 150.018 149.743 0.17Mb大小為窗口,計(jì)算區(qū)間內(nèi)的標(biāo)記個(gè)數(shù),繪制標(biāo)記密度在基因組上分布的熱圖
本文編號(hào):2957528
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