發(fā)布時間：2021-01-03 00:38

　　石刁柏（Asparagus officinalis）是一種廣泛栽培的經(jīng)濟(jì)作物,同時也是研究性別決定機(jī)制的模式植物之一。但是對于其性別決定的分子機(jī)制,尤其是其單性性別決定及發(fā)育相關(guān)基因目前仍不清楚。本研究以石刁柏為材料,在高通量轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上,利用生物信息學(xué)、RT-PCR、熒光定量PCR、RACE及組織原位雜交技術(shù)分析了石刁柏雌雄性別差異表達(dá)基因,并對其中3個穩(wěn)定的性別發(fā)育相關(guān)基因進(jìn)行了克隆和表達(dá)分析。主要研究結(jié)果如下:1、以發(fā)育早期的雌雄花為材料,利用Illumina雙末端測序技術(shù)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,經(jīng)過整理后得到260 G高質(zhì)量數(shù)據(jù),組裝獲得平均長度為979 bp的unigenes 72,626個。通過對雌性、雄性和超雄株轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)比較分析后獲得性別差異表達(dá)基因4876個。其中,433個差異表達(dá)基因（differentially expressed genes,DEGs）與花的發(fā)育相關(guān),包括了285個雄性/超雄性偏向和149個雌性偏向基因。在雄性/超雄偏向表達(dá)基因中,102個DEGs可能與花藥發(fā)育相關(guān)。此外,我們發(fā)現(xiàn)了43個性別差異表達(dá)基因和調(diào)控性別發(fā)育的激素調(diào)節(jié)和生物合成相關(guān);... 

【文章來源】：河南師范大學(xué)河南省

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

OGI和MeGI的基因功能圖

圖 3-1 石刁柏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝的 unigenes 長度分布圖Fig. 3-1 Overview of length distribution of assembled unigenes in asparagus flower buds. 石刁柏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)功能注釋和分類利用四個公共數(shù)據(jù)庫（即 Nr，Swiss-Prot，COG 和 KEGG）對組裝的 unigen。結(jié)果顯示這些數(shù)據(jù)庫中分別有約 40.96％，29.39％，24.75％和 16.07％的表 3-2）。在至少 個公共蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中總共有 29,967（41.26％）個 unig功。將 17,973 個 unigenes 進(jìn)行基因注釋分類，共分成 25 個類別（圖 3-2A）。”(6564,36.52%)是其中最大的 組，其次是“轉(zhuǎn)錄后修飾、蛋白翻轉(zhuǎn)344,18.61%)，“信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制”(2727,15.17%)和“RNA 處理和修飾”(1725,9.60將石刁柏 unigenes 與其他植物基因匹配結(jié)果表明，和石刁柏基因匹配基因最物均為單子葉植物，分別為油棕（Elaeis guineensis）（6736 個）、鳳仙花（Immina）（5515 個）、野芭蕉（Musa acuminata）（2695 個）、水稻（Oryza sativa）可可樹（Theobroma cacao）（943 個）。這 發(fā)現(xiàn)與石刁柏是單子葉植物的

21圖 3-2 石刁柏花蕾轉(zhuǎn)錄組注釋注：A 圖為石刁柏花蕾轉(zhuǎn)錄組在基因數(shù)據(jù)庫的注釋；B 圖為注釋的種類分布柱狀圖Fig. 3-2 Transcriptome annotation of asparagus flower buds.

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：2953962