利用高通量測序技術(shù)對沙田柚自交和異交花柱進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。通過差異分析得到GDSL酯酶/脂肪酶的基因序列,該基因全長1 306 bp(Gen Bank登錄號:KU159279),開放閱讀框(簡稱ORF)全長1 104 bp,共編碼367個氨基酸,編碼的蛋白質(zhì)分子量為40.09 ku,理論等電點(diǎn)為6.44,含有1個與SGNH蛋白相同的保守結(jié)構(gòu)域(conserved active sites,簡稱CAS);GDSL基因在沙田柚自交1 d花柱中的表達(dá)量(簡稱RPKM)為4.68,2 d為2.41,3 d則迅速下降到0.27;在異交1 d花柱中該基因的表達(dá)量為4.48,2 d迅速升高至7.43,3 d仍維持較高水平為4.37;系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因與甜橙(Citrus sinensis)親緣關(guān)系很近,屬于同一進(jìn)化分支。 

【文章來源】：江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017年11期 北大核心

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 RNA的提取、建庫及測序
        1.2.2 序列分析和系統(tǒng)樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 基因的生物信息學(xué)分析
    2.2 編碼蛋白質(zhì)的分析和疏水性預(yù)測
    2.3 功能結(jié)構(gòu)域分析
    2.4 跨膜預(yù)測
    2.5 蛋白質(zhì)磷酸化預(yù)測
    2.6 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)及三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.7 同源性分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]植物GDSL脂酶家族基因的研究進(jìn)展[J]. 李志蘭,華水金,蔣立希.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2014(07)
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[8]沙田柚花柱S-糖蛋白的分離及鑒定[J]. 楊繼華,李紅艷,薛妙男.  廣西師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2000(04)
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本文編號：2945537