鐵皮石斛轉錄因子基因DoWRKY3的克隆與分子特性分析
發(fā)布時間:2020-12-24 03:07
目的克隆珍稀瀕危藥用植物鐵皮石斛轉錄因子基因DoWRKY3,并進行生物信息學和表達模式分析。方法采用RT-PCR和RACE技術獲取基因全長;利用生物信息學軟件預測蛋白的理化性質、結構域和亞細胞定位等分子特性;用軟件DNASTAR 6.0和MEGA 6.0分別進行氨基酸多序列比對和進化關系分析;借助定量PCR檢測基因表達模式。結果分離到DoWRKY3基因(GenBank注冊號KT957549),cDNA全長2 065 bp,編碼1條由509個氨基酸組成的多肽,相對分子質量55 580,等電點6.58;推定的DoWRKY3氨基酸序列具有植物WRKY蛋白家族保守的2個WRKY結構域(217279、381449)、2個WRKYGQK位點和2個C2H2型鋅指結構元件(C-X4-C-X22-23-H-X1-H);該蛋白預測無信號肽或跨膜域,定位在細胞核;DoWRKY3蛋白與多種植物WRKY蛋白一致性較高(46.3%57.4%...
【文章來源】:中草藥. 2017年14期 北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料
2 方法
2.1 RNA提取和c DNA合成
2.2 RACE和q PCR驗證
2.3 序列分析
2.4 定量PCR分析
3 結果與分析
3.1 Do WRKY3基因全長克隆
3.2 Do WRKY3基因編碼的蛋白理化特性分析
3.3 Do WRKY3蛋白結構域、定位和跨膜區(qū)分析
3.4 Do WRKY3蛋白的三維建模
3.5 Do WRKY3與植物WRKY蛋白序列比對分析
3.6 Do WRKY3基因編碼蛋白的系統(tǒng)進化樹分析
3.7 基因表達模式分析
4 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鐵皮石斛轉錄因子基因(DoWRKY2)的克隆與表達分析[J]. 趙俊,孟燦燦,趙亦帆,王晨曦,樊洪泓,金青,李大輝,林毅,蔡永萍. 農業(yè)生物技術學報. 2015(08)
[2]鐵皮石斛轉錄因子基因DoWRKY1的克隆與表達分析[J]. 趙俊,孫時偉,孟燦燦,金青,樊洪泓,林毅,蔡永萍. 中國中藥雜志. 2015(14)
[3]鐵皮石斛化學成分研究[J]. 周佳,周先麗,梁成欽,蘇小建,李伯林,卿亞艷,吳園娥. 中草藥. 2015(09)
[4]鐵皮石斛咖啡酰輔酶A氧甲基轉移酶基因的分離與表達分析[J]. 張崗,胡本祥,張大為,陳偉,郭順星. 中草藥. 2014(08)
本文編號:2934857
【文章來源】:中草藥. 2017年14期 北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料
2 方法
2.1 RNA提取和c DNA合成
2.2 RACE和q PCR驗證
2.3 序列分析
2.4 定量PCR分析
3 結果與分析
3.1 Do WRKY3基因全長克隆
3.2 Do WRKY3基因編碼的蛋白理化特性分析
3.3 Do WRKY3蛋白結構域、定位和跨膜區(qū)分析
3.4 Do WRKY3蛋白的三維建模
3.5 Do WRKY3與植物WRKY蛋白序列比對分析
3.6 Do WRKY3基因編碼蛋白的系統(tǒng)進化樹分析
3.7 基因表達模式分析
4 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鐵皮石斛轉錄因子基因(DoWRKY2)的克隆與表達分析[J]. 趙俊,孟燦燦,趙亦帆,王晨曦,樊洪泓,金青,李大輝,林毅,蔡永萍. 農業(yè)生物技術學報. 2015(08)
[2]鐵皮石斛轉錄因子基因DoWRKY1的克隆與表達分析[J]. 趙俊,孫時偉,孟燦燦,金青,樊洪泓,林毅,蔡永萍. 中國中藥雜志. 2015(14)
[3]鐵皮石斛化學成分研究[J]. 周佳,周先麗,梁成欽,蘇小建,李伯林,卿亞艷,吳園娥. 中草藥. 2015(09)
[4]鐵皮石斛咖啡酰輔酶A氧甲基轉移酶基因的分離與表達分析[J]. 張崗,胡本祥,張大為,陳偉,郭順星. 中草藥. 2014(08)
本文編號:2934857
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