烏珠穆沁羊Hoxd11、Hoxa11、Hoxc8基因克隆與多態(tài)分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-19 02:24
烏珠穆沁羊是內(nèi)蒙古自治區(qū)獨(dú)特的優(yōu)良地方品種。在它基因中許多變異既有適應(yīng)意義,又有生產(chǎn)應(yīng)用的價(jià)值。多脊椎現(xiàn)象是烏珠穆沁羊生產(chǎn)性能中最普遍的,也是烏珠穆沁羊特有的現(xiàn)象,多脊椎羊比普通羊產(chǎn)肉量多,因此多脊椎烏珠穆沁羊受到普遍好評(píng)和歡迎,越來(lái)越引起科技工作者和廣大牧民的重視。本研究選擇可能影響多脊椎現(xiàn)象的Hoxa11、Hoxd11、Hoxc8基因作為候選基因,旨在分子水平上探索這三個(gè)基因的多態(tài)性與多脊椎烏珠穆沁羊的四種表型(T13L6、T13L7、T14L6、T14L7)中的關(guān)系進(jìn)行研究,為展開(kāi)多脊椎烏珠穆沁羊四種表型Hoxa11、 Hoxd11、Hoxc8基因的遺傳學(xué)研究提供科學(xué)依據(jù),為培育我國(guó)肉用綿羊品種奠定基礎(chǔ)。本實(shí)驗(yàn)以40只烏珠穆沁羊作為研究對(duì)象,其中包含10只沒(méi)有多脊椎現(xiàn)象的烏珠穆沁羊(T13L6),10只多一枚腰椎的烏珠穆沁羊(T13L7),10只多一枚胸椎的烏珠穆沁羊(T14L6),10只胸椎和腰椎各多一枚的烏珠穆沁羊(T14L7),采集了40個(gè)血液樣本作為實(shí)驗(yàn)材料,根據(jù)已發(fā)布的特克賽爾綿羊的Hoxa11、Hoxd11和hoxc8三個(gè)基因的cDNA序列設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增四種表型烏珠穆...
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
1 引言
1.1 概述
1.2 同源異形盒基因的研究
1.2.1 同源異形盒基因的特點(diǎn)
1.2.2 基因克隆與Homeobox基因的發(fā)現(xiàn)
1.2.3 同源異形盒基因?qū)棺祫?dòng)物的調(diào)控與控制
1.2.4 同源異形盒基因的分類
1.3 不同物質(zhì)的Hox基因的研究現(xiàn)狀
1.3.1 果蠅的同源異位基因
1.3.2 鼠的Homeobox基因
1.3.3 雞的Homeobox基因
1.3.4 其它動(dòng)物的Homeobox基因
1.3.5 綿羊的Homeobox基因
1.4 多脊椎烏珠穆沁羊候選基因研究的意義
1.4.1 保護(hù)優(yōu)質(zhì)品種需加強(qiáng)遺傳多樣性研究
1.4.2 培育新品種要基于標(biāo)記輔助選擇
1.5 綿羊分子標(biāo)記研究進(jìn)展
1.5.1 SNP分析方法
1.6 試驗(yàn)中所涉及的實(shí)驗(yàn)方法的原理
1.6.1 PCR技術(shù)的基本原理
1.6.2 PCR的反應(yīng)體系與反應(yīng)條件
1.6.3 引物設(shè)計(jì)與合成
1.7 本研究的目的和意義
2 烏珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的克隆及序列分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料來(lái)源
2.1.2 主要儀器設(shè)備及分析軟件
2.1.3 主要試劑
2.1.4 主要溶液的配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 血液基因組DNA提取試劑盒操作步驟
2.2.2 PCR反應(yīng)
2.2.3 PCR產(chǎn)物的回收(DNA凝膠回收試劑盒)
2.2.4 鏈接反應(yīng)
2.2.5 轉(zhuǎn)化反應(yīng)
2.2.6 測(cè)序的拼接
2.2.7 向數(shù)據(jù)庫(kù)提交基因序列
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 DNA濃度和純度檢測(cè)
2.3.2 烏珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll和Hoxc8基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.3.3 序列的拼接結(jié)果
2.3.4 烏珠穆沁羊和幾種動(dòng)物Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的外顯子比對(duì)
2.3.5 小結(jié)
3 烏珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的多態(tài)分析
3.1 序列分析
3.2 基因多態(tài)性的統(tǒng)計(jì)方法
3.2.1 等位基因頻率
3.2.2 基因型頻率
3.2.3 多態(tài)信息含量、基因純合度、基因雜合度和有效等位基因數(shù)
3.2.4 群體Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)的檢驗(yàn)
3.2.5 基因型的獨(dú)立性檢驗(yàn)
3.2.6 方差分析
3.3 結(jié)果與分析
4 討論
4.1 樣品DNA提取
4.2 PCR擴(kuò)增
4.3 Hoxall、Hoxdll和Hoxc8基因多態(tài)與多脊椎的關(guān)系
4.3.1 果蠅的Homeobox基因
4.3.2 鼠的Homeobox基因
4.3.3 魚(yú)類的Homeobox基因
4.3.4 雞的Homeobox基因
4.3.5 綿羊的Homeobox基因
4.3.6 創(chuàng)新點(diǎn)
5 結(jié)論
附圖
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄1
附錄2
附錄3
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):2925075
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
1 引言
1.1 概述
1.2 同源異形盒基因的研究
1.2.1 同源異形盒基因的特點(diǎn)
1.2.2 基因克隆與Homeobox基因的發(fā)現(xiàn)
1.2.3 同源異形盒基因?qū)棺祫?dòng)物的調(diào)控與控制
1.2.4 同源異形盒基因的分類
1.3 不同物質(zhì)的Hox基因的研究現(xiàn)狀
1.3.1 果蠅的同源異位基因
1.3.2 鼠的Homeobox基因
1.3.3 雞的Homeobox基因
1.3.4 其它動(dòng)物的Homeobox基因
1.3.5 綿羊的Homeobox基因
1.4 多脊椎烏珠穆沁羊候選基因研究的意義
1.4.1 保護(hù)優(yōu)質(zhì)品種需加強(qiáng)遺傳多樣性研究
1.4.2 培育新品種要基于標(biāo)記輔助選擇
1.5 綿羊分子標(biāo)記研究進(jìn)展
1.5.1 SNP分析方法
1.6 試驗(yàn)中所涉及的實(shí)驗(yàn)方法的原理
1.6.1 PCR技術(shù)的基本原理
1.6.2 PCR的反應(yīng)體系與反應(yīng)條件
1.6.3 引物設(shè)計(jì)與合成
1.7 本研究的目的和意義
2 烏珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的克隆及序列分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料來(lái)源
2.1.2 主要儀器設(shè)備及分析軟件
2.1.3 主要試劑
2.1.4 主要溶液的配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 血液基因組DNA提取試劑盒操作步驟
2.2.2 PCR反應(yīng)
2.2.3 PCR產(chǎn)物的回收(DNA凝膠回收試劑盒)
2.2.4 鏈接反應(yīng)
2.2.5 轉(zhuǎn)化反應(yīng)
2.2.6 測(cè)序的拼接
2.2.7 向數(shù)據(jù)庫(kù)提交基因序列
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 DNA濃度和純度檢測(cè)
2.3.2 烏珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll和Hoxc8基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.3.3 序列的拼接結(jié)果
2.3.4 烏珠穆沁羊和幾種動(dòng)物Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的外顯子比對(duì)
2.3.5 小結(jié)
3 烏珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的多態(tài)分析
3.1 序列分析
3.2 基因多態(tài)性的統(tǒng)計(jì)方法
3.2.1 等位基因頻率
3.2.2 基因型頻率
3.2.3 多態(tài)信息含量、基因純合度、基因雜合度和有效等位基因數(shù)
3.2.4 群體Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)的檢驗(yàn)
3.2.5 基因型的獨(dú)立性檢驗(yàn)
3.2.6 方差分析
3.3 結(jié)果與分析
4 討論
4.1 樣品DNA提取
4.2 PCR擴(kuò)增
4.3 Hoxall、Hoxdll和Hoxc8基因多態(tài)與多脊椎的關(guān)系
4.3.1 果蠅的Homeobox基因
4.3.2 鼠的Homeobox基因
4.3.3 魚(yú)類的Homeobox基因
4.3.4 雞的Homeobox基因
4.3.5 綿羊的Homeobox基因
4.3.6 創(chuàng)新點(diǎn)
5 結(jié)論
附圖
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄1
附錄2
附錄3
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):2925075
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