目的(1)通過(guò)全外顯子組測(cè)序搜尋非綜合征型唇腭裂的候選致病基因。(2)通過(guò)對(duì)候選致病基因的驗(yàn)證,確定NSCL/P的致病基因。(3)探索致病基因在NSCL/P發(fā)病機(jī)制中的作用,為將來(lái)的基因診斷與基因治療奠定基礎(chǔ)。方法(1)在青島大學(xué)附屬醫(yī)院口腔頜面外科收集30名非綜合征型唇腭裂的患兒進(jìn)行全外顯子組測(cè)序。(2)通過(guò)過(guò)濾千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)變異位點(diǎn),保留1000G中頻率低于0.01的變異位點(diǎn);保留位于外顯子區(qū)或剪接位點(diǎn)區(qū)的變異;過(guò)濾掉同義突變等不影響基因功能的突變,只保留影響基因功能的非同義突變、剪切位點(diǎn)等的突變;利用SIFT、Polyphen、MutationTaster、CADD這4個(gè)軟件對(duì)位點(diǎn)有害性進(jìn)行評(píng)估。(3)參考ACMG的證據(jù)對(duì)突變位點(diǎn)有害性進(jìn)行分類,減少候選基因的數(shù)目。(4)對(duì)基因功能進(jìn)行進(jìn)一步的分析,預(yù)測(cè)NSCL/P可能的致病基因。(5)用PCR測(cè)序方法,在測(cè)序過(guò)的30名患兒中驗(yàn)證外顯子組測(cè)序發(fā)現(xiàn)的突變位點(diǎn)以及在其他100名NSCL/P的患兒中檢驗(yàn)候選致病基因的外顯子中是否發(fā)生功能性突變。結(jié)果(1)經(jīng)過(guò)全基因組外顯子測(cè)序后,發(fā)現(xiàn)了506144個(gè)單核苷酸變異(single nucl... 

【文章來(lái)源】：青島大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】：49 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

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【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：2924337