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纈草內生、根際放線菌中安莎類和鹵代類抗生素生物合成基因簇的篩選及研究

發(fā)布時間:2020-12-18 05:21
  藥用植物內生及根部微生物種類、數(shù)量以及活性代謝產物相對比較豐富,是生物活性物質的重要來源。本研究旨在分離纈草內生及根際放線菌,篩選其中含安莎霉素類和鹵代酶類抗生素生物合成基因簇的菌株,挖掘鑒定新的次級代謝產物。本研究通過分離純化共獲得143株纈草內生及根際放線菌,檢測其對細菌和真菌病原菌的抑菌活性,結果顯示22.4%的放線菌對病原菌具有抑制效果�;贏HBA合酶基因和鹵代酶基因設計安莎類和鹵代類抗生素簡并引物,對抑菌效果較好的菌株DNA進行PCR擴增。結果表明:菌株AJ21和AJ56分別含有安莎類和鹵代類抗生素生物合成基因。通過對兩株菌進行16S rDNA鑒定、形態(tài)特征觀察、生理生化研究以及系統(tǒng)發(fā)育分析,發(fā)現(xiàn)菌株AJ21和AJ56均為鏈霉菌屬�;诰闍J21和AJ56的抑菌效果以及抗生素生物合成基因片段,進行基因組分析發(fā)現(xiàn):菌株AJ21的基因組序列長約10 Mb,有8415個編碼基因,GC含量達到73.73%。菌株AJ56的基因組序列長約8 Mb,有7259個編碼基因,GC含量為71.85%�;蚬δ芊治霭l(fā)現(xiàn)兩者均含有特曲霉素抗性,并擁有豐富的次級代謝基因簇,其中菌株AJ21有54個... 

【文章來源】:西北農林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:70 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

纈草內生、根際放線菌中安莎類和鹵代類抗生素生物合成基因簇的篩選及研究


AHBA的生物合成途徑(QianjinKetal.2012)

生物合成基因簇,合成酶,聚酮


圖 1-2 不同的 AHBA 生物合成基因簇(Qianjin K et al. 2012)Fig 1-2 DifferentAHBA biosynthetic gene clusters(Qianjin K et al. 2012)注意的是,來自于萘型和苯型安莎類基因簇的 AHBA 合成酶表現(xiàn)出特征據(jù)了系統(tǒng)發(fā)育樹的不同分支 (圖 1-3)。更有意思的是,介于這兩種類型的聚酮合成酶的結構域的不同。還原型結構域的冗余廣泛存在于萘型安莎在苯安莎類抗生素的 myc 基因簇中克隆到 PKS 基因。目前仍有一些基因征不清楚的安沙霉素類化合物,如土霉素,它們代表著修飾異常的 AHB類抗生素比較,它們的生物合成是從 AHBA 開始,通過在聚酮合成酶上最初的 ANSA 結構經過氧化和/或重排發(fā)生較大的改變,形成這些不尋常

合成酶,系統(tǒng)發(fā)育分析


圖 1-2 不同的 AHBA 生物合成基因簇(Qianjin K et al. 2012)Fig 1-2 DifferentAHBA biosynthetic gene clusters(Qianjin K et al. 2012)意的是,來自于萘型和苯型安莎類基因簇的 AHBA 合成酶表現(xiàn)出特了系統(tǒng)發(fā)育樹的不同分支 (圖 1-3)。更有意思的是,介于這兩種類型酮合成酶的結構域的不同。還原型結構域的冗余廣泛存在于萘型安苯安莎類抗生素的 myc 基因簇中克隆到 PKS 基因。目前仍有一些基不清楚的安沙霉素類化合物,如土霉素,它們代表著修飾異常的 AH抗生素比較,它們的生物合成是從 AHBA 開始,通過在聚酮合成酶初的 ANSA 結構經過氧化和/或重排發(fā)生較大的改變,形成這些不尋

【參考文獻】:
期刊論文
[1]纈草醇提物和水提物萃取組分對小鼠的抗抑郁作用[J]. 趙麗輝,張一折,韓德明,陳玉娟,周麗云.  鄭州大學學報(醫(yī)學版). 2012(01)
[2]纈草素抗焦慮作用及其機制的初探[J]. 王延麗,劉勇,石晉麗,郭建友,鄭虎占,翟玉靜.  中國藥理學通報. 2011(04)
[3]纈草揮發(fā)油的化學成分及藥理活性研究進展[J]. 周霆,黃寶康.  時珍國醫(yī)國藥. 2008(11)
[4]纈草鎮(zhèn)靜催眠的物質基礎[J]. 黃寶康,鄭漢臣,秦路平.  藥學服務與研究. 2006(03)
[5]幾種選擇性分離稀有放線菌的方法[J]. 肖煒,李銘剛,崔曉龍,李一青,文孟良,劉宏偉,陳義光,彭謙.  微生物學通報. 2006(01)
[6]寬葉纈草提取物抗戊四氮致大鼠癲癇的作用機理研究[J]. 羅國君,何國厚,王曉勛,王華.  上海中醫(yī)藥雜志. 2004(12)
[7]國產纈草屬藥用植物資源調查[J]. 黃寶康,鄭漢臣,秦路平,鄭清明,辛海量.  中藥材. 2004(09)
[8]纈草揮發(fā)油成分分析及其含量影響因素探討[J]. 薛存寬,蔣鵬,沈凱,李穎,曾玲.  中草藥. 2003(09)
[9]纈草的化學成分、植物資源和藥理活性[J]. 陳磊,秦路平,鄭漢臣.  藥學實踐雜志. 2000(05)

博士論文
[1]黑水纈草抗老年癡呆有效部位化學成分和藥理作用研究[D]. 左月明.黑龍江中醫(yī)藥大學 2007



本文編號:2923432

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