比較轉(zhuǎn)錄組分析揭示參與樹莓頂端生根調(diào)節(jié)的候選基因
發(fā)布時間:2020-12-16 16:54
懸鉤子屬(Rubus spp.)樹莓(Raspberry)有豐富的營養(yǎng)價值和藥用價值,被國際農(nóng)糧組織譽為“第三代水果”,作為近年開發(fā)的功能性食品熱點小漿果類樹種之一,樹莓的發(fā)展前景非常廣闊。樹莓表現(xiàn)出一種獨特的頂端生根方式,即從其基生枝莖尖端開始生根,而這種基生枝頂端生根是一種獨特的無性生殖方式。對于其生根機制進行研究有利于樹莓種植業(yè)的發(fā)展。而時至今日,還沒有與樹莓頂端生根的基生枝與不生根的花果枝之間差異表達基因的篩選相關(guān)的研究,樹莓基生枝與花果枝差異表達基因的功能分析也未見報道,參與樹莓頂端生根過程的基因尚未鑒定。本次研究將樹莓基生枝頂端生根過程劃分為三個時期,分別命名為:SAP1(primocane at developmentalstage 1),SAP2(primocane at developmentalstage 2),SAP3(primocane at developmentalstage 3)。其中:SAP1代表樹莓基生枝延伸生長時期;SAP2代表樹莓基生枝生長停滯,且頂端開始出現(xiàn)向地性彎曲的時期;SAP3則代表樹莓基生枝尖端分化出短根的時期。同時期花果枝,分別命名為:...
【文章來源】:吉林師范大學(xué)吉林省
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
表達譜測序標準流程
圖 2. 典型的“四季紅”紅樹莓晚季莖圖Fig. 2 Diagrams of typical late season stems of “Sijihong” red raspberry狀態(tài)如圖所示,(A)為去除頂芽后的基生枝的特征(莖在當前季節(jié)的生長)。芽2,3和芽4是芽1被去除后新誘導(dǎo)的側(cè)枝;(B)在它第一個生長季節(jié)去除兩年生花果枝的頂芽。ified from Heslop-Harrison, 1959).The state of the buds is as indicated in the key. (A) Characteristicsimocane after terminal bud was removed (stem of the current season’s growth). Shoot 2, 3, and 4 arely induced lateral branches after the terminal bud 1 was cut off; (B) A 2-year-old floricane, terminalwas cut during its first growth season.
圖 3.樹莓基生枝莖尖頂端生根的三個發(fā)育階段Fig. 3 Three rooting developmental stages of Rubus spp圖示(a-c)分別對應(yīng)(A-C)中用紅色圈出的部分。(A,a)SAP1,在這一時期,樹莓莖尖的枝葉生長活躍;(B,b)SAP2,在此時期,莖尖葉子枯萎,尖變鈍,莖端直徑顯著增加;(C,c)SAP3,在此時期,莖尖端變枯黃,短根開始形成。圖中的黑色箭頭顯示了軸的方向性。PM代表基生枝;PMA代表基生枝尖端;FO代表葉子;RT代表不定根。A,b和c的比例尺等于2.0mm。stem apex (modified from Heslop-Harrison, 1959. Panels (a-c) are enlarged views of the parts circled in redin panels (A-C), respectively. (A, a) SAP1, foliage on the tapering apex remains active; (B, b) SAP2,foliage on the apex withers, apex becomes blunt and its diameter increased dramatically; (C, c) SAP3, theapex becomes chlorotic and short roots began to form. Black arrows in above panels show axis orientations.PM, primocane; PMA, primocane apex; FO, foliage; RT, root. Scale bars in a, b, and c = 2.0 mm.2.2 實驗方法2.2.1 RNA 的提取及質(zhì)量檢測
【參考文獻】:
期刊論文
[1]發(fā)展樹莓前景廣闊[J]. 劉秀娟. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2017(12)
[2]阜新地區(qū)樹莓品種選擇及省力栽培技術(shù)要點[J]. 齊金海. 現(xiàn)代園藝. 2017(07)
[3]多重PCR靶向富集結(jié)合高通量測序篩查結(jié)直腸癌中MMR基因的突變[J]. 黃凱,陳慧杰,劉方奇,徐燁,李軒,南蓬. 復(fù)旦學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2016(02)
[4]轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在果樹研究中的應(yīng)用[J]. 薛輝,曹尚銀,李好先,牛娟,張富紅,趙弟廣. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(05)
[5]大豆轉(zhuǎn)錄組測序研究進展綜述[J]. 劉佳偉,姚丹,趙東海,石放放. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2015(08)
[6]小鼠頜骨發(fā)育過程中長鏈非編碼RNA的表達譜變化[J]. 夏昕,伍虹,陳絳媛,孔祥波,阮毅. 中華口腔醫(yī)學(xué)研究雜志(電子版). 2014(06)
[7]高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)及其在鱗翅目昆蟲上的應(yīng)用[J]. 楊帆,黃立華,張愛兵. 昆蟲學(xué)報. 2014(08)
[8]樹莓扦插繁育技術(shù)[J]. 李紅秀. 青海農(nóng)林科技. 2014(02)
[9]轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在玉米中的應(yīng)用研究進展[J]. 許波,張偉強,馮曉曦,王成業(yè),張海申,許海濤,王友華,張今瀚. 玉米科學(xué). 2014(01)
[10]樹莓的研究現(xiàn)狀及開發(fā)利用[J]. 楊婷婷. 四川林業(yè)科技. 2013(03)
博士論文
[1]甘藍型油菜粒重母體調(diào)控機理解析[D]. 李娜.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]黃芪次生代謝途徑調(diào)控誘導(dǎo)子篩選及轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 劉秀波.東北林業(yè)大學(xué) 2013
[3]銀杏和木蘭屬植物的轉(zhuǎn)錄組、葉綠體基因組及其相關(guān)研究[D]. 林小涵.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2011
碩士論文
[1]黑龍江省樹莓產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策[D]. 張巖.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]樹莓果實中多糖的降解、結(jié)構(gòu)及生物活性研究[D]. 劉璐.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]樹莓引種的栽培區(qū)劃研究[D]. 蘆霞.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]小菜蛾免疫Bt動力學(xué)的DGE分析及其PGRP-LB基因的克隆[D]. 張玉清.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]銀杏轉(zhuǎn)錄組測序及葉片與胚珠數(shù)字基因表達譜分析[D]. 路兆庚.揚州大學(xué) 2015
[6]基于轉(zhuǎn)錄組和VIGS技術(shù)發(fā)掘棉花抗黃萎病相關(guān)基因[D]. 鄭永杰.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]納米TiO2對家蠶飼料效率影響的研究[D]. 張華.蘇州大學(xué) 2015
[8]花生種子不同發(fā)育時期的表達譜及DGAT基因的表達分析[D]. 胡曉鋒.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]水稻無中葉脈dl2突變體轉(zhuǎn)錄組與蛋白組的相關(guān)性分析[D]. 彭小燕.重慶大學(xué) 2015
[10]洋蔥轉(zhuǎn)錄組分析及雄性不育細胞質(zhì)類型鑒定[D]. 李滿堂.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:2920473
【文章來源】:吉林師范大學(xué)吉林省
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
表達譜測序標準流程
圖 2. 典型的“四季紅”紅樹莓晚季莖圖Fig. 2 Diagrams of typical late season stems of “Sijihong” red raspberry狀態(tài)如圖所示,(A)為去除頂芽后的基生枝的特征(莖在當前季節(jié)的生長)。芽2,3和芽4是芽1被去除后新誘導(dǎo)的側(cè)枝;(B)在它第一個生長季節(jié)去除兩年生花果枝的頂芽。ified from Heslop-Harrison, 1959).The state of the buds is as indicated in the key. (A) Characteristicsimocane after terminal bud was removed (stem of the current season’s growth). Shoot 2, 3, and 4 arely induced lateral branches after the terminal bud 1 was cut off; (B) A 2-year-old floricane, terminalwas cut during its first growth season.
圖 3.樹莓基生枝莖尖頂端生根的三個發(fā)育階段Fig. 3 Three rooting developmental stages of Rubus spp圖示(a-c)分別對應(yīng)(A-C)中用紅色圈出的部分。(A,a)SAP1,在這一時期,樹莓莖尖的枝葉生長活躍;(B,b)SAP2,在此時期,莖尖葉子枯萎,尖變鈍,莖端直徑顯著增加;(C,c)SAP3,在此時期,莖尖端變枯黃,短根開始形成。圖中的黑色箭頭顯示了軸的方向性。PM代表基生枝;PMA代表基生枝尖端;FO代表葉子;RT代表不定根。A,b和c的比例尺等于2.0mm。stem apex (modified from Heslop-Harrison, 1959. Panels (a-c) are enlarged views of the parts circled in redin panels (A-C), respectively. (A, a) SAP1, foliage on the tapering apex remains active; (B, b) SAP2,foliage on the apex withers, apex becomes blunt and its diameter increased dramatically; (C, c) SAP3, theapex becomes chlorotic and short roots began to form. Black arrows in above panels show axis orientations.PM, primocane; PMA, primocane apex; FO, foliage; RT, root. Scale bars in a, b, and c = 2.0 mm.2.2 實驗方法2.2.1 RNA 的提取及質(zhì)量檢測
【參考文獻】:
期刊論文
[1]發(fā)展樹莓前景廣闊[J]. 劉秀娟. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2017(12)
[2]阜新地區(qū)樹莓品種選擇及省力栽培技術(shù)要點[J]. 齊金海. 現(xiàn)代園藝. 2017(07)
[3]多重PCR靶向富集結(jié)合高通量測序篩查結(jié)直腸癌中MMR基因的突變[J]. 黃凱,陳慧杰,劉方奇,徐燁,李軒,南蓬. 復(fù)旦學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2016(02)
[4]轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在果樹研究中的應(yīng)用[J]. 薛輝,曹尚銀,李好先,牛娟,張富紅,趙弟廣. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(05)
[5]大豆轉(zhuǎn)錄組測序研究進展綜述[J]. 劉佳偉,姚丹,趙東海,石放放. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2015(08)
[6]小鼠頜骨發(fā)育過程中長鏈非編碼RNA的表達譜變化[J]. 夏昕,伍虹,陳絳媛,孔祥波,阮毅. 中華口腔醫(yī)學(xué)研究雜志(電子版). 2014(06)
[7]高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)及其在鱗翅目昆蟲上的應(yīng)用[J]. 楊帆,黃立華,張愛兵. 昆蟲學(xué)報. 2014(08)
[8]樹莓扦插繁育技術(shù)[J]. 李紅秀. 青海農(nóng)林科技. 2014(02)
[9]轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在玉米中的應(yīng)用研究進展[J]. 許波,張偉強,馮曉曦,王成業(yè),張海申,許海濤,王友華,張今瀚. 玉米科學(xué). 2014(01)
[10]樹莓的研究現(xiàn)狀及開發(fā)利用[J]. 楊婷婷. 四川林業(yè)科技. 2013(03)
博士論文
[1]甘藍型油菜粒重母體調(diào)控機理解析[D]. 李娜.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]黃芪次生代謝途徑調(diào)控誘導(dǎo)子篩選及轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 劉秀波.東北林業(yè)大學(xué) 2013
[3]銀杏和木蘭屬植物的轉(zhuǎn)錄組、葉綠體基因組及其相關(guān)研究[D]. 林小涵.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2011
碩士論文
[1]黑龍江省樹莓產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策[D]. 張巖.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]樹莓果實中多糖的降解、結(jié)構(gòu)及生物活性研究[D]. 劉璐.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]樹莓引種的栽培區(qū)劃研究[D]. 蘆霞.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]小菜蛾免疫Bt動力學(xué)的DGE分析及其PGRP-LB基因的克隆[D]. 張玉清.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]銀杏轉(zhuǎn)錄組測序及葉片與胚珠數(shù)字基因表達譜分析[D]. 路兆庚.揚州大學(xué) 2015
[6]基于轉(zhuǎn)錄組和VIGS技術(shù)發(fā)掘棉花抗黃萎病相關(guān)基因[D]. 鄭永杰.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]納米TiO2對家蠶飼料效率影響的研究[D]. 張華.蘇州大學(xué) 2015
[8]花生種子不同發(fā)育時期的表達譜及DGAT基因的表達分析[D]. 胡曉鋒.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]水稻無中葉脈dl2突變體轉(zhuǎn)錄組與蛋白組的相關(guān)性分析[D]. 彭小燕.重慶大學(xué) 2015
[10]洋蔥轉(zhuǎn)錄組分析及雄性不育細胞質(zhì)類型鑒定[D]. 李滿堂.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:2920473
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