6個(gè)中國小型豬種SLA-DQB基因外顯子2多態(tài)性分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-13 03:00
采用PCR-RFLP法對甘孜藏豬、合作豬、滇南小耳豬、荷包豬、五指山豬和巴馬小型豬SLA-DQB基因外顯子2多態(tài)性進(jìn)行分析。結(jié)果表明:經(jīng)RsaⅠ酶切檢測到5種等位基因,14種RFLP帶型,遺傳雜合度(He)在0.5380.729,多態(tài)信息含量(PIC)在0.4880.728,該位點(diǎn)表現(xiàn)為高度多態(tài);χ2適合性檢驗(yàn)顯示,甘孜藏豬、巴馬小型豬和五指山豬3個(gè)群體處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。經(jīng)HinfⅠ酶切檢測到3種等位基因,6種RFLP帶型,He在0.3150.524,PIC在0.2910.461,在該位點(diǎn)表現(xiàn)為中度多態(tài)。χ2適合性檢驗(yàn)顯示,甘孜藏豬、滇南小耳豬、巴馬小型豬、荷包豬4個(gè)群體處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。因此,6個(gè)小型豬種的SLA-DQB基因外顯子2多態(tài)性豐富且存在明顯差異。
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2017年08期 北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
SLA-DQB基因HinfI-RFLP酶切圖譜
平衡(P<0.05)。而SLA-DQB經(jīng)HinfⅠ酶切后有3個(gè)等位基因和6種RFLP帶型,HH帶型出現(xiàn)的頻率最高。χ2適合性檢驗(yàn)表明,甘孜藏豬、滇南小耳豬、巴馬小型豬、荷包豬4個(gè)群體在該酶切位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);而合作豬、五指山豬2個(gè)群體在該位點(diǎn)偏離基因平衡(P<0.05)。甘孜藏豬和巴馬小型豬在RsaI和HinfI2個(gè)酶切位點(diǎn)上均處于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。123456789101112131415750bp500bp250bp100bp123456789101112131415750bp500bp250bp100bp圖1SLA-DQB基因HinfI-RFLP酶切圖譜圖2SLA-DQB基因RsaI-RFLP酶切圖譜1為Marker,2、8、11、14為HH,3為HI,4、9為II,5、12、15為HJ,6、7為IJ;10、13為JJ1為Marker,2為CC,3為DD,5、11、14、15為CD,4、6為GF,7為DF,8、12為CF,9為DG,10、13為EF帶型甘孜臧豬n=25合作豬n=30滇南小耳豬n=30巴馬小型豬n=34五指山豬n=33荷包豬n=34CC---0.2650.1210.059DD-----0.029GG0.055-0.167-0.061-FF-----0.147CD0.4000.7000.1000.1170.3330.029CG0.0400.1000.0670.0590.091-CE--0.3000.4710.0910.088CF0.0400.1000.1000.0880.03-DG0.2800.0340.133-0.121-DE0.040----0.500DF0.0400.0330.067--0.030表16個(gè)小型豬種SLA-DQB基因RsaI酶切PCR-RFLP帶型及基因頻率注:χ2值為對各品種內(nèi)不同RFLP帶型分布的Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)值,同列肩標(biāo)ns表示沒有達(dá)到顯著水平(P>0.05)。下表同
本文編號:2913769
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2017年08期 北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
SLA-DQB基因HinfI-RFLP酶切圖譜
平衡(P<0.05)。而SLA-DQB經(jīng)HinfⅠ酶切后有3個(gè)等位基因和6種RFLP帶型,HH帶型出現(xiàn)的頻率最高。χ2適合性檢驗(yàn)表明,甘孜藏豬、滇南小耳豬、巴馬小型豬、荷包豬4個(gè)群體在該酶切位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);而合作豬、五指山豬2個(gè)群體在該位點(diǎn)偏離基因平衡(P<0.05)。甘孜藏豬和巴馬小型豬在RsaI和HinfI2個(gè)酶切位點(diǎn)上均處于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。123456789101112131415750bp500bp250bp100bp123456789101112131415750bp500bp250bp100bp圖1SLA-DQB基因HinfI-RFLP酶切圖譜圖2SLA-DQB基因RsaI-RFLP酶切圖譜1為Marker,2、8、11、14為HH,3為HI,4、9為II,5、12、15為HJ,6、7為IJ;10、13為JJ1為Marker,2為CC,3為DD,5、11、14、15為CD,4、6為GF,7為DF,8、12為CF,9為DG,10、13為EF帶型甘孜臧豬n=25合作豬n=30滇南小耳豬n=30巴馬小型豬n=34五指山豬n=33荷包豬n=34CC---0.2650.1210.059DD-----0.029GG0.055-0.167-0.061-FF-----0.147CD0.4000.7000.1000.1170.3330.029CG0.0400.1000.0670.0590.091-CE--0.3000.4710.0910.088CF0.0400.1000.1000.0880.03-DG0.2800.0340.133-0.121-DE0.040----0.500DF0.0400.0330.067--0.030表16個(gè)小型豬種SLA-DQB基因RsaI酶切PCR-RFLP帶型及基因頻率注:χ2值為對各品種內(nèi)不同RFLP帶型分布的Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)值,同列肩標(biāo)ns表示沒有達(dá)到顯著水平(P>0.05)。下表同
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