基于形態(tài)、線粒體及核基因對東海28種蝦虎魚類的系統(tǒng)進化分析
發(fā)布時間:2020-12-09 02:33
蝦虎魚亞目是鱸形目中種類最多的類群,其中所有魚類都稱為蝦虎魚類,廣泛分布于熱帶亞熱帶及溫帶地形復雜的淺海區(qū)域中。本文利用蝦虎魚的形態(tài)特征,線粒體COI基因以及核基因Ptr和plagl2對采自東海的28種蝦虎魚類的系統(tǒng)進化進行研究,并從NCBI下載5亞科45屬75種蝦虎魚條形碼序列,幾乎涵蓋了中國所有的蝦虎魚科中屬的種類,進行COI條形碼對中國蝦虎魚科魚類的適用性研究,以期為蝦虎魚的分類研究及物種鑒定工作提供理論依據(jù)。1.28種蝦虎魚類形態(tài)特征及分析測量蝦虎魚28個物種的長度、鱗片、鰭條等數(shù)量特征以及對蝦虎魚的形態(tài)進行簡單描述,從中找出26個主要的分級特征,特征的有無用1和0來表示,形成形態(tài)矩陣,運用貝葉斯的方法構建形態(tài)系統(tǒng)發(fā)育樹。近盲蝦虎魚亞科除孔蝦虎魚和小頭櫛孔蝦虎魚以外的三種魚親緣關系比較近,因為這三種蝦虎魚均為全身裸露。紋縞和雙帶縞蝦虎魚形態(tài)十分相似,但是此兩種魚跟髭縞蝦虎魚在形態(tài)上差異較明顯,最主要的差異為髭縞蝦虎魚下頜及吻邊都有小須,在之前魚類志中,髭縞蝦虎魚被分在髭縞蝦虎魚屬(Triaenopogon)中,但是形態(tài)聚類分析中三種蝦虎魚為平行關系,本結果較傾向于支持將三種蝦虎...
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
蝦虎魚早期分類發(fā)展Developmentintaxonomicofgobiesearly注:a-d分別為Berg(1940)、Miller(1973)、Hoses(1984)、Akihito(2000)的分
上海海洋大學碩士學位論文5圖1-2 近期蝦虎魚分類情況注:A、B分別為Nelson在1994和2006年提出的分類,C為Thacker在2009年提出的分類Fig.1-2 Classification of the gobies recentlyNote,A and B are the categories that Nelson proposed in 1994 and 2006respectively, and C is proposed by Thacker in 2009.Thacker等利用4個線粒體基因分析了蝦虎魚亞目4個科,得出其中最古老的是溪鱧科,蝦虎魚科與塘鱧科和峽塘鱧科是并系關系[24]。此后的研究中,Agorreta等多位學者的研究中發(fā)現(xiàn)分子系統(tǒng)研究結果與形態(tài)學基本一致[24-28]。但是仍有難區(qū)分的分類,如Christine(2003)利用三個線粒體基因蝦虎魚亞目的親緣關系,結果顯示Xenisthmidae 與 Eleotridae為姊妹群
圖 2-1 利用形態(tài)特征構建的拓撲結構Fig 2-1 The topology constructed with morphological features2.3 討論通過分析 28 種蝦虎魚的形態(tài)特征,以及利用 14 個主要的形態(tài)分級特征及其他的特征,構建系統(tǒng)發(fā)育樹。塘鱧科聚在最外部,為兩個并列的分支,因為鋸嵴塘鱧在各個鱗片的數(shù)目上跟中華烏塘鱧差異特別大,且中華烏塘鱧犁骨有錐狀齒,這兩個特征也是烏塘鱧區(qū)別于其他 27 種蝦虎魚的主要特征,鋸嵴塘鱧有一個很明顯的特征就是吻部附近及眼上部都有骨質嵴。背眼蝦虎魚亞科亞科和近盲蝦虎魚亞科的特征比較明顯,背眼蝦虎魚亞科亞科第一背鰭鰭棘的數(shù)目為 5,并且眼睛凸出于頭頂,區(qū)別于其他 26 種蝦虎魚。近盲蝦虎魚亞科背鰭前鱗都是 0,且眼睛都很小,具有不同程度的退化,且 5 種魚中,除了孔蝦虎魚和小頭櫛孔蝦虎魚以外
本文編號:2906099
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
蝦虎魚早期分類發(fā)展Developmentintaxonomicofgobiesearly注:a-d分別為Berg(1940)、Miller(1973)、Hoses(1984)、Akihito(2000)的分
上海海洋大學碩士學位論文5圖1-2 近期蝦虎魚分類情況注:A、B分別為Nelson在1994和2006年提出的分類,C為Thacker在2009年提出的分類Fig.1-2 Classification of the gobies recentlyNote,A and B are the categories that Nelson proposed in 1994 and 2006respectively, and C is proposed by Thacker in 2009.Thacker等利用4個線粒體基因分析了蝦虎魚亞目4個科,得出其中最古老的是溪鱧科,蝦虎魚科與塘鱧科和峽塘鱧科是并系關系[24]。此后的研究中,Agorreta等多位學者的研究中發(fā)現(xiàn)分子系統(tǒng)研究結果與形態(tài)學基本一致[24-28]。但是仍有難區(qū)分的分類,如Christine(2003)利用三個線粒體基因蝦虎魚亞目的親緣關系,結果顯示Xenisthmidae 與 Eleotridae為姊妹群
圖 2-1 利用形態(tài)特征構建的拓撲結構Fig 2-1 The topology constructed with morphological features2.3 討論通過分析 28 種蝦虎魚的形態(tài)特征,以及利用 14 個主要的形態(tài)分級特征及其他的特征,構建系統(tǒng)發(fā)育樹。塘鱧科聚在最外部,為兩個并列的分支,因為鋸嵴塘鱧在各個鱗片的數(shù)目上跟中華烏塘鱧差異特別大,且中華烏塘鱧犁骨有錐狀齒,這兩個特征也是烏塘鱧區(qū)別于其他 27 種蝦虎魚的主要特征,鋸嵴塘鱧有一個很明顯的特征就是吻部附近及眼上部都有骨質嵴。背眼蝦虎魚亞科亞科和近盲蝦虎魚亞科的特征比較明顯,背眼蝦虎魚亞科亞科第一背鰭鰭棘的數(shù)目為 5,并且眼睛凸出于頭頂,區(qū)別于其他 26 種蝦虎魚。近盲蝦虎魚亞科背鰭前鱗都是 0,且眼睛都很小,具有不同程度的退化,且 5 種魚中,除了孔蝦虎魚和小頭櫛孔蝦虎魚以外
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