毛韌革菌(Stereum hirsutum)中3個(gè)PKS的基因克隆與異源表達(dá)
發(fā)布時(shí)間:2020-12-09 02:26
本課題組前期運(yùn)用經(jīng)典的單菌多產(chǎn)物發(fā)酵策略(One Strain Many Compound s,OSMAC),對毛韌革菌(Stereum hirsutum)的天然次代物進(jìn)行分離,其中一些化合物結(jié)構(gòu)較為新穎且有抗菌活性。為進(jìn)一步探究毛韌革菌(Stereum hirsutum)的次生代謝產(chǎn)物能力,我們通過anti SMASH結(jié)合Inter Pro、Blast、CDD數(shù)據(jù)庫,預(yù)測并選擇了三個(gè)可能處于沉默或低表達(dá)狀態(tài)的三個(gè)PKS(PKS1、PKS2、PKS3)進(jìn)行研究。研究結(jié)果如下:1.針對三個(gè)目的基因,進(jìn)行基因功能注釋,完成對目的基因模序的確定與可能的產(chǎn)物結(jié)構(gòu)以及類型的預(yù)測。通過分析PKS1與PKS2,發(fā)現(xiàn)兩者的功能域只是相差一個(gè)ACP模塊,并且兩者在系統(tǒng)發(fā)育上比較近,它們的KS同源性達(dá)到61.8%,推測PKS1和PKS2可能參與苷色酸類代謝產(chǎn)物的合成。PKS3可能是非典型蘑菇聚酮合成酶,能夠參與多不飽和脂肪酸類藥物的生物合成。2.以p RS314和p BARGPE1-Hygro-EGFP質(zhì)粒構(gòu)建釀酒酵母異源表達(dá)載體p YUZ02,該載體能夠在釀酒酵母中處于一個(gè)穩(wěn)定的低拷貝狀態(tài),并結(jié)合內(nèi)源性...
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
毛韌革菌(S.hirsutum)部分次級代謝物Fig1-1SelectedsecondarymetabolitesfromS.hirsutum
毛韌革菌5個(gè)PKS的簡單系統(tǒng)發(fā)育樹
STEHIDRAFT_170496的antiSMASH預(yù)測圖
本文編號:2906089
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
毛韌革菌(S.hirsutum)部分次級代謝物Fig1-1SelectedsecondarymetabolitesfromS.hirsutum
毛韌革菌5個(gè)PKS的簡單系統(tǒng)發(fā)育樹
STEHIDRAFT_170496的antiSMASH預(yù)測圖
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