基于轉錄組測序的中國水仙成花基因的研究
【學位單位】:福建農林大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S682.21
【部分圖文】:
圖1-1擬南芥中的成花途徑示意圖[22】??Fig.?1-1?Overview?on?flowering?pathways?in?Arabidopsis??指在外界環(huán)境不適宜植物生長時,植物通過自身的營開花。近年來科學家們對自主途徑中的晚花突變體進因的突變體無論在什么樣的光周期條件下都表現(xiàn)為相關基因一般不受其他幾個途徑的影響。目前在擬南己發(fā)現(xiàn)多個與自主途徑相關的基因,如凡〇灰E/e/iVWERING?CONTROL?LOCUS?A?(FCA)?,?FLOWERINE?RING?LOCUS?DiFLD')?,1UMINIDEPENDENC?LD\?)、FLOWERING?LOCUS?KHDOMAIN?<:FLK)、RELTVG?6?(狀項等間。有研究表明雖然這些基因調控花[29]
對兩個樣本獲得的原始數(shù)據進行過濾后得到的clean?reads進行組裝,共得到??289,544?條?Transcript?和?123,544?條?Unigene,Transcript?與?Unigene?的?N50?分別為??1,476和800。具體組裝數(shù)據統(tǒng)計如表2-2及圖2-3所示。??12??
2500bpB??1000bp^SjB|?18S??圖2-2中國水仙主芽總RNA??DL15000;1-2.RNA??Fig.?2-2?The?total?RNA?of?Chinese?narcissus?bud??3.2測序與組裝結果分析??2個生物學重復樣本測序共獲得12.35Gb?Clean?Data,各樣品Q30堿基百分??比均不小于89.99%?(表2-1)。??表2-1樣品測序數(shù)據評估統(tǒng)計表???Table?2-1?Assessment?of?assembly?quality?illumina?sequencing?technique???Samples?Total?reads?Total?nucleotides(bp)?GC?Content?Q30?percentage??T01?27,664,547?6,969,215,666?47.96%?90.63%??T02?21,354,592?5,379,699,215?48.03%?89.99%??對兩個樣本獲得的原始數(shù)據進行過濾后得到的clean?reads進行組裝,共得到??289,544?條?Transcript?和?123,544?條?Unigene,Transcript?與?Unigene?的?N50?分別為??1,476和800。具體組裝數(shù)據統(tǒng)計如表2-2及圖2-3所示。??12??
【參考文獻】
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本文編號:2843607
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