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菘藍IiYUCCA6基因的克隆及其功能研究

發(fā)布時間:2020-10-13 08:25
   菘藍(Isatis indigotica Fort.)是十字花科(Cruciferae)菘藍屬(Isatis)兩年生草本植物,其干燥的根和葉入藥分別稱為板藍根和大青葉。IAA作為內(nèi)源生長激素,在植物的生長發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用,YUCCA家族基因是IAA吲哚-3-丙酮酸(IPA)合成途徑中的關鍵限速酶基因。目前,尚無菘藍YUCCA家族基因的研究報道。本研究基于菘藍轉錄組數(shù)據(jù)信息,從10個候選內(nèi)參基因中,篩選出適宜于不同研究條件的最適內(nèi)參基因;并進一步運用qRT-PCR技術探究了菘藍YUCCA基因家族成員的表達模式;最后,對IiYUCCA6基因進行克隆和生物信息學分析,并構建相應的亞細胞定位載體、原核表達載體和過表達載體,對其功能進行了初步研究。本研究所得主要實驗結果如下:(1)基于geNorm和NormFinder分析結果,從10個候選基因中確定了在菘藍不同發(fā)育階段、不同組織部位和不同非生物脅迫條件下適用于qRT-PCR技術的最適內(nèi)參基因分別為IiPP2A-4,IieIF2和IiRPL15。(2)對菘藍 YUCCA 基因家族成員(IiYUCCA2、IiYUCCA5、IiYUCCA6 和IiYUCCA8)在不同組織部位、不同發(fā)育時期的表達情況進行了研究,結果表明:對于不同組織部位而言,IiYUCCA5基因在根中表達水平最高,而liYUCCA2、IiYUCCA6和IiYUCCA8則在老莖和老葉中的表達具有明顯優(yōu)勢;對于不同發(fā)育時期而言,LiYUCCA6在花期的表達水平最高,IiYUCCA2、IiYUCCA5和IiYUCCA8在幼苗期的表達水平高于其他發(fā)育階段。(3)對菘藍 YUCCA 基因家族成員(IiYYUCCA2、IiYUCCA5、IiYUCCA6 和IiYUCCA8)在不同非生物脅迫誘導條件下的表達情況進行了研究,結果表明:干旱能夠有效誘導IiYUCCA6和IiYUCCA8的高表達,并在一定程度上抑制IiYUCCA2和IiYUCCA5的表達。鹽脅迫對IiYUCCA5基因的表達呈現(xiàn)初期抑制,后期促進的影響,而對IiYUCCA2、IiYUCCA6和IiYUCCA8則具有良好的促進作用。低溫誘導IiYUCCA8基因的高表達,而對IiYUCCA2、IiYUCCA5和IiYUCCA6的表達則呈現(xiàn)前期抑制后期促進的影響作用。傷害處理對IiYUCCA2、IiYUCCA5、IiYUCCA6和IiYUCCA8表達的影響作用較為一致,均表現(xiàn)為前期抑制,后期促進。(4)對菘藍IiTYUCCA6基因(Genbank登錄號:KY318462.1)進行了克隆和生物信息學分析,結果表明:該基因的ORF區(qū)全長為1,335 bp,編碼444個氨基酸;分子量為49.78 kDa,等電點為8.71,無跨膜結構域,無信號肽,屬親水性蛋白,包含F(xiàn)MO黃素單加氧酶的所有保守基序,可能定位于細胞質中。進一步通過多序列比對以及系統(tǒng)進化分析發(fā)現(xiàn),IiYUCCA6基因的氨基酸序列與十字花科植物蘿卜(Raphanus sativus)的親緣關系最近。(5)構建IiYUCCA6亞細胞定位載體,運用根癌農(nóng)桿菌GV3101介導的遺傳轉化方法浸染洋蔥內(nèi)表皮細胞,熒光顯微鏡觀察結果顯示,該基因表達的蛋白主要分布于細胞質中,而在細胞核中也有少量分布。(6)構建IiYUCCA6基因原核表達載體,并轉化大腸桿菌BL21(DE3),探究其在大腸桿菌表達系統(tǒng)中誘導融合蛋白表達的最優(yōu)條件。結果顯示:該融合蛋白表達的最佳條件為0.5 mMIPTG,37 ℃下誘導3 h,且主要以包涵體的形式進行表達。(7)構建IiYUCCA6基因過表達載體,并轉化煙草,共獲得10個陽性轉基因株系。其中,目的基因表達量最高的兩個陽性株系3和9,其表型呈現(xiàn)株高增加、頂端優(yōu)勢明顯等高生長素表型,且IAA含量也有所升高,分別達到對照的1.20和1.19倍;進一步對這兩個株系中生長素響應基因的表達水平進行檢測,結果顯示NtIAA8、NtIAA16、NtGH3.1和NtGH3.6相對于對照組表達水平均有顯著性升高,分別達到對照的2.7、15.2、8.0、59.6倍和6.5、26.9、3.7、42.0倍;同時,對這兩個陽性株系進行黑暗脅迫處理后發(fā)現(xiàn),處理7 d后,相對于對照組,葉綠素含量下降比例顯著性降低、H202含量增加值顯著性減少。此外,黑暗處理7 d后,衰老相關基因NtSAG12的表達水平也顯著降低。因此,IiYUC,CA6基因在煙草中異源表達,能夠有效延緩植物在黑暗條件下的衰老進程,表現(xiàn)出一定程度的抗逆性。
【學位單位】:陜西師范大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S567.239
【部分圖文】:

內(nèi)參,基因,引物,單峰


Fig.?2-1?The?amplification?result?of?10?candidate?reference?genes??以菘藍葉片的第一鏈cDNA為模板,分別以10個候選內(nèi)參基因的qRT-PCR??引物進行實時定量PCR擴增,所得熔解曲線如圖(圖2-2),結果顯示所有基因??的擴增曲線均呈現(xiàn)單峰,表明引物的特異性較好。??flWi?t-ir.?A?6WS?mct-?A??s:?八?,:?八??,?*1C?J?\?/?\??。《5?J?\?〇?〇????J?\??0?9C0???0?000?^?—??moc?rtat?nM?no???:〇??mm?not?mco?mso?mm?mdcmco??zoe?*see?n<c?s:?o?*?oe?ree??:〇??mm?moo??i廣?八?A???J?\?,:???J?\??■???eoot?^???e?〇e?Meo?tjoo?rjac?y¥ce?noc?mm??7〇?????c?sj??utt?hbo?tjk?naa?nst-?*sw?moo?p.so?mco?noo??eoc??Tmenrnm??t82j?八?eon??

內(nèi)參,基因


.-.,。??表2-2?10個候選內(nèi)參基因的引物擴增效率???Table?2-2?The?amplification?efficiency?of?10?candidate?genes?in?Isatis?indigotica?Fort.?Gene?abbreviation??E?(%)IieIF2?0.9583?1.20??IiACT7?0.9829?1.15??HPP2A-4?0.9859?1.12??IiAP-2?0.9849?1.35??HAPT3?0.9983?1.04??HUBC29?0.9996?0.97??HRPL15?0.9920?1.05??HUBC22?0.9990?0.89??lime19?0.9845?0.94???IiTUB4?0.9790?\A22.3.3?10個候選內(nèi)參基因的qRT-PCR及原始ct值分析??運用上述經(jīng)檢測擴增效率良好的引物,分別以不同的cDNA稀釋20倍后模板進行qRT-PCR實驗,采用箱式圖對所得原始ct值進行分析(如圖2-3),果顯示所得原始ct值質量較好。??

軟件分析,內(nèi)參,基因,組織部


??迫條件下的最適內(nèi)參基因。表2-3和圖2-4均為geNorm軟件分析結果,該結果表??明在不同發(fā)育階段和不同組織部位,表達相對穩(wěn)定的內(nèi)參基因均為//P尸2H??/MC77和//e/F2
【參考文獻】

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本文編號:2838951

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