MdFD基因的功能驗證及蘋果早花相關(guān)基因的表達分析
【學(xué)位單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S661.1
【部分圖文】:
2.1.10.2 MdFD 基因表達分析依據(jù) MdFD 序列,設(shè)計定量引物,以 AtQub 作為內(nèi)參基因,采用三步法進行熒光定量 PCR分析,方法同上。2.2 結(jié)果與分析2.2.1 MdFD 基因克隆及生物信息學(xué)分析2.2.1.1 MdFD 基因結(jié)構(gòu)分析及克隆根據(jù)已知的擬南芥 AtFD 基因序列,通過在線分析軟件 NCBI 進行 Blast,篩選得到蘋果 FD同源基因 MdFD 基因序列,根據(jù)其序列設(shè)計引物,以‘嘎啦’蘋果莖尖分生組織 cDNA 為模板擴增 MdFD 基因。經(jīng) DNAMAN 分析結(jié)果顯示,MdFD 開放閱讀框為 840 bp,編碼 279 個氨基酸殘基,其蛋白的分子量為 30.207 kDa,等電點 10.01,為親水性蛋白質(zhì)。通過在蘋果基因組上進行比對,結(jié)果顯示 MdFD 定位到第 15 號染色體上,對其基因組結(jié)構(gòu)進行分析,發(fā)現(xiàn)蘋果 FD 同源基因 MdFD 與擬南芥 FD 基因結(jié)構(gòu)一樣,都含有 3 個外顯子和 2 個內(nèi)含子(圖 2-1)。
蘋果MdFD蛋白系統(tǒng)進化樹分析
bZIP功能域保守性分析
【參考文獻】
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本文編號:2832829
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