對蝦白斑綜合癥病毒極早期基因wsv249啟動子分析及轉(zhuǎn)錄因子CREB-3鑒定
【學(xué)位單位】:廈門大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S945.4
【部分圖文】:
SMARTScribe反轉(zhuǎn)錄酶合成完整的cDNA。當(dāng)SMARTScribe反轉(zhuǎn)錄酶到達提取逡逑的RNA5’末端時,其末端轉(zhuǎn)錄酶活性能夠在cDNA的第一鏈的3’末端加上額外逡逑的核苷酸(如圖2-1)。逡逑Poly邋RNA逡逑5邋v\/wwx/wv\/v邋polyA邋3‘逡逑5邋^1-邐Oligo邋(dT)邋primer逡逑SMARTer邋IIA邐First-strand邋synthesis逡逑O^onudeDtide邐coupled邋with逡逑tailing邋by逡逑SMARTScribe邋RT逡逑Y逡逑義>000^邐_A逡逑S'邐〕逡逑Template邋switching逡逑and邋extension邋by逡逑y邋SMARTScribe邋RT逡逑5—XXXXX邐polyA逡逑—XXXXX邋邐逡逑圖2-1邋cDNA合成示意圖逡逑26逡逑
CREB-l-R邐ACGTTTTCGTGAGGCTTCCTCTGCT逡逑CREB-3-F邐ACAGTGGACGCTCACAGGTCAACG逡逑CREB-3-R邐GAATGACCTGCTGACGGCATCTTTG逡逑bZIP-TF-like-F邐GGACCAATGCCACACCAACTCAG逡逑bZIP-TF-like-R邐GCGGCGACATCTTTCCATCTCTG逡逑二輪引物名稱邐引物序列逡逑CREB-1-F邋’邐GTAATTCC邋AGCC邋AGCAGTCTCC邋AGC逡逑CREB-l-R'邐ACTGCC邋ACTCTATTCTCC邋AGGC邋ATTTG逡逑CREB-3-F,邐CTCCAGAAACGCATCCGAACCCT逡逑CREB-3-R,邐GGCAGTTCATCATCAACGCCTTCC逡逑bZIP-TF-like-F邋’邐CAACTTTGTGG邋ACGGTAAGGG邋AGGAA逡逑bZIP-TF-like-R’邐CCGCACTCGTGGTCATTTCACCT逡逑3’/5’RACE邋原理見圖邋2-2:逡逑
第一部分對蝦WSSV極早期基因WW249啟動子序列分析及其轉(zhuǎn)錄因子基因預(yù)測逡逑出1.77倍;P249(-200/-l)活性比P249(-175/-l)活性要高出1.62倍。通過上述實驗,逡逑我們推斷在mv2辦啟動子的-175到-200邋bp之間的區(qū)域存在一個正調(diào)控元件,在逡逑-250到-225邋bp之間的區(qū)域存在一些負調(diào)控元件(圖3-1邋)。逡逑
【參考文獻】
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本文編號:2816461
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