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對蝦白斑綜合癥病毒極早期基因wsv249啟動子分析及轉(zhuǎn)錄因子CREB-3鑒定

發(fā)布時間:2020-09-11 08:43
   自被發(fā)現(xiàn)以來,由于對蝦白斑綜合癥病毒(WSSV)的高傳染性,高死亡率,此病毒成為了危害蝦類養(yǎng)殖業(yè)的主要病原之一,并嚴(yán)重影響了對蝦產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。由于WSSV感染宿主的關(guān)鍵步驟之一是其極早期基因的轉(zhuǎn)錄與翻譯,因此本文著重分析了 WSSV極早期基因wsv249啟動子及其有關(guān)轉(zhuǎn)錄因子之間的聯(lián)系。WSSV極早期基因wsv249編碼了一種E3泛素連接酶,能夠與對蝦體內(nèi)的泛素結(jié)合酶相互作用。本研究中,為了了解wsv249轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)機制,將wsv249啟動子序列以25 bp為單位截短,并分析其啟動子活性。四個25 bp區(qū)域被認為是潛在的正向或逆向調(diào)控元件。值得注意的是,將啟動子CRE元件(-275/-250)截去,啟動子活性受到抑制而降低了 84.2%。CRE元件是環(huán)磷腺苷效應(yīng)元件結(jié)合蛋白(CREBs)和激活蛋白1(AP-1)的結(jié)合位點。為此,本文深入研究了對蝦體內(nèi)同源蛋白Lvc-Jun和LvCREB-3對wsv249啟動子的調(diào)控作用。我們通過(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技術(shù)在凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一種CREB同源蛋白LvCREB-3,并且LvCREB-3蛋白在鰓組織中分布最多,而在心臟中含量最少。通過WSSV感染實驗,發(fā)現(xiàn)在病毒感染12-24小時之間,LvCREB-3基因表達量在對蝦鰓組織中迅速上升。這一時間段剛好與WSSV病毒極早期基因的表達相對應(yīng)。另外,Lvc-Jun能夠上調(diào)wsv249啟動子活性高達12.4倍。EMSA實驗證明Lvc-Jun能夠與啟動子中CRE序列結(jié)合。雙熒光素酶報告基因檢測證明位于wsv249啟動子序列中-212/-205bp位置的CRE位點而不是-256/-249bp位置的CRE位點,在啟動子活性方面起關(guān)鍵作用。相反,對蝦體內(nèi)LvCREB-3蛋白并不能激活wsv249啟動子活性。上述研究有助于了解WSSV病毒與宿主體內(nèi)因子的相互關(guān)系,同時也能夠幫助了解病毒感染初期,其極早期基因在宿主體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,為將來病毒防治提供理論依據(jù)。
【學(xué)位單位】:廈門大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S945.4
【部分圖文】:

示意圖,示意圖,反轉(zhuǎn)錄酶,轉(zhuǎn)錄酶


SMARTScribe反轉(zhuǎn)錄酶合成完整的cDNA。當(dāng)SMARTScribe反轉(zhuǎn)錄酶到達提取逡逑的RNA5’末端時,其末端轉(zhuǎn)錄酶活性能夠在cDNA的第一鏈的3’末端加上額外逡逑的核苷酸(如圖2-1)。逡逑Poly邋RNA逡逑5邋v\/wwx/wv\/v邋polyA邋3‘逡逑5邋^1-邐Oligo邋(dT)邋primer逡逑SMARTer邋IIA邐First-strand邋synthesis逡逑O^onudeDtide邐coupled邋with逡逑tailing邋by逡逑SMARTScribe邋RT逡逑Y逡逑義>000^邐_A逡逑S'邐〕逡逑Template邋switching逡逑and邋extension邋by逡逑y邋SMARTScribe邋RT逡逑5—XXXXX邐polyA逡逑—XXXXX邋邐逡逑圖2-1邋cDNA合成示意圖逡逑26逡逑

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CREB-l-R邐ACGTTTTCGTGAGGCTTCCTCTGCT逡逑CREB-3-F邐ACAGTGGACGCTCACAGGTCAACG逡逑CREB-3-R邐GAATGACCTGCTGACGGCATCTTTG逡逑bZIP-TF-like-F邐GGACCAATGCCACACCAACTCAG逡逑bZIP-TF-like-R邐GCGGCGACATCTTTCCATCTCTG逡逑二輪引物名稱邐引物序列逡逑CREB-1-F邋’邐GTAATTCC邋AGCC邋AGCAGTCTCC邋AGC逡逑CREB-l-R'邐ACTGCC邋ACTCTATTCTCC邋AGGC邋ATTTG逡逑CREB-3-F,邐CTCCAGAAACGCATCCGAACCCT逡逑CREB-3-R,邐GGCAGTTCATCATCAACGCCTTCC逡逑bZIP-TF-like-F邋’邐CAACTTTGTGG邋ACGGTAAGGG邋AGGAA逡逑bZIP-TF-like-R’邐CCGCACTCGTGGTCATTTCACCT逡逑3’/5’RACE邋原理見圖邋2-2:逡逑

啟動子序列,截短,啟動子序列,啟動子


第一部分對蝦WSSV極早期基因WW249啟動子序列分析及其轉(zhuǎn)錄因子基因預(yù)測逡逑出1.77倍;P249(-200/-l)活性比P249(-175/-l)活性要高出1.62倍。通過上述實驗,逡逑我們推斷在mv2辦啟動子的-175到-200邋bp之間的區(qū)域存在一個正調(diào)控元件,在逡逑-250到-225邋bp之間的區(qū)域存在一些負調(diào)控元件(圖3-1邋)。逡逑

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號:2816461

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