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煙蚜鞣化激素基因的克

發(fā)布時間:2020-08-25 12:05
【摘要】:Bursicon是調(diào)節(jié)昆蟲表皮硬化及展翅的激素類蛋白,它在昆蟲的表皮硬化和翅的伸展過程中起著關(guān)鍵作用。本研究克隆獲得煙蚜Myzus persicae(Sulzer)。Bursicon基因(Burs-α和Burs-β)全長并預(yù)測其結(jié)構(gòu)和功能,對這兩個基因的進(jìn)化地位進(jìn)行分析;通過實時定量PCR(real-time quantitative PCR,q-PCR)技術(shù)研究了Bursicon基因在煙蚜不同發(fā)育階段的表達(dá)特征,最后利用RNA干擾技術(shù)研究Bursicon基因在煙蚜體內(nèi)的功能。相應(yīng)結(jié)果如下:1.煙蚜不同翅型轉(zhuǎn)錄組分析為了豐富煙蚜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息,為探明煙蚜翅型分化的分子機(jī)制打下基礎(chǔ)。本研究利用高通量測序技術(shù)Illumina HiSeq~(TM) 2000分別檢測煙蚜若蚜、無翅成蚜和有翅成蚜轉(zhuǎn)錄組表達(dá)差異;通過熒光定量PCR方法,分析翅型相關(guān)基因表達(dá)模式。結(jié)果表明:經(jīng)過測序獲得質(zhì)量值高于20的堿基比例(Q20)均不低于94%的數(shù)據(jù)(GenBank登錄號:SRR6112438,SRR6112436和SRR6112437);所有reads組裝成128 065個unigenes,平均長度607.08 bp;將所得序列注釋到NR,NT,KOG,GO和KEGG等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,共有128 065個unigenes被注釋。基因表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),與無翅成蚜和若蚜兩者相比,有翅成蚜翅形成、肽類激素和受體蛋白相關(guān)基因的表達(dá)量存在顯著差異。qPCR分析結(jié)果顯示,在有翅成蚜與無翅成蚜中,Bursicon(Bur-α和Bur-β),Flightin(Fln),Wntless(Wnt),Distal-less(Dll),Decapentaplegic(Dpp),Juvenile hormone epoxide hydrolase基因(JHEH)和Ecdysone receptor基因(EcR)表達(dá)量存在顯著差異,表明這些基因可能與翅型發(fā)育有關(guān)。2.煙蚜Bursicon基因全長序列的獲得利用RT-PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)和cDNA末端快速擴(kuò)增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技術(shù)進(jìn)行Bursicon基因進(jìn)行全長擴(kuò)增,序列經(jīng)過DNAstar 5.0拼接得到848 bp Burs-α(GenBank登錄號:MF083566)全長cDNA序列和841 bp Burs-β(GenBank登錄號:MF083567)全長cDNA序列,將其分別命名為Mpburs-α和Mpburs-β。分析表明,Mpburs-α全長cDNA序列擁有一個完整483 bp的開放閱讀框(ORF),共編碼160個氨基酸,5端非編碼區(qū)(5'-UTR)63 bp,3端非編碼區(qū)(3'-UTR)302 bp,具有真核生物典型加尾信號(AATAAA)和polyA結(jié)構(gòu);Mpburs-β的全長cDNA序列擁有一個完整417 bp的開放閱讀框(ORF),共編碼138個氨基酸,5端非編碼區(qū)(5'-UTR)124bp,3端非編碼區(qū)(3'-UTR)300 bp,同樣具有典型的加尾信號(AATAAA)和polyA結(jié)構(gòu)。3.煙蚜Bursicon基因生物信息學(xué)分析對Mpburs-α和Mpburs-β基因全長序列分析,對Mpburs-α和Mpburs-β基因編碼的氨基酸及蛋白質(zhì)進(jìn)行理化性質(zhì)和高級結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)進(jìn)行預(yù)測分析,結(jié)果如下:Mpburs-α和Mpburs-β的相對分子量分別約為17.59 kDa和15.45 kDa,分別由2424個和2148個原子組成,估測理論等電點(diǎn)pI分別為7.96和4.84,化學(xué)分子式分別為C_(759)H_(1204)N_(210)O_(232)S_(19)和C_(672)H_(1072)N_(180)O_(212)S_(12);Mpburs-α和Mpburs-β的氨基酸序列與豌豆蚜Acyrthosiphon pisum和麥雙尾蚜Diuraphis noxia鞣化激素氨基酸序列一致性最高;Mpburs-α和Mpburs-β基因均有沒有跨膜區(qū),但都具有信號肽和磷酸化位點(diǎn);分子系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,煙蚜與豌豆蚜和麥雙尾蚜親緣關(guān)系較近。4.煙蚜Bursicon基因不同齡期表達(dá)分析利用熒光定量PCR技術(shù)分析煙蚜在不同發(fā)育時期(1齡若蟲至剛羽化的成蟲)的Mpburs-α和Mpburs-β基因的表達(dá)模式。結(jié)果顯示,Mpburs-α和Mpburs-β基因在煙蚜不同發(fā)育階段表達(dá)量不同。其中1齡若蚜表達(dá)量最高,4齡若蚜最低。有翅型1日齡成蚜與無翅型相比,Mpburs-α和Mpburs-β基因在有翅型成蚜中表達(dá)量均顯著高于無翅型成蚜。5.煙蚜Bursicon基因功能分析分別用dsburs-α、dsburs-β和Pbs飼喂煙蚜2齡若蟲,觀察記錄表型變化和死亡率,72 h后收集部分蟲體檢測靶標(biāo)基因在煙蚜體內(nèi)表達(dá)情況。結(jié)果顯示,與飼喂Pbs相比,飼喂dsburs-α和dsburs-β后,Burs-α基因和Burs-β基因在煙蚜體內(nèi)的表達(dá)水平分別下降了67.54%和50.46%,說明Burs-α基因和Burs-β基因的表達(dá)明顯被抑制。死亡率統(tǒng)計及表型觀察發(fā)現(xiàn):當(dāng)飼喂dsMpburs的最終濃度為15 ng/μl,72h時實驗組與對照組的死亡率沒有明顯差異,但表皮的顏色異常,由紅褐色變?yōu)榈G色或透明狀,表皮黑化程度明顯降低。說明飼喂dsMpburs基因后煙蚜表皮鞣化和黑化作用受到抑制。本文通過煙蚜轉(zhuǎn)錄組測序、設(shè)計特異性引物、RT-PCR技術(shù)、RACE技術(shù)成功獲得了煙蚜鞣化激素-α和鞣化激素-β基因全長序列,并利用熒光定量PCR以及RNAi技術(shù),研究了它們在煙蚜不同發(fā)育時期的表達(dá)量變化情況以及在煙蚜生長發(fā)育過程中所起的作用,以期為進(jìn)一步研究煙蚜鞣化激素基因的功能打下基礎(chǔ),為研究以鞣化激素為靶標(biāo)的新型防治技術(shù)提供借鑒。
【學(xué)位授予單位】:貴州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S433.3
【圖文】:

轉(zhuǎn)導(dǎo),煙草天蛾,腹部,神經(jīng)節(jié)


圖 1.1 鞣化激素激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)假想通路 (Ishaaya et al., 2012)Fig 1.1hypothesized Bursicon signaling pathways鞣化激素功能的實現(xiàn)包括合成和釋放兩個過程。Reynolds et al.(1983)使法將昆蟲體中樞神經(jīng)系統(tǒng)各區(qū)段的勻漿液注射到結(jié)扎了的紅頭麗蠅體內(nèi),果表明,神經(jīng)系統(tǒng)的所有部位均發(fā)現(xiàn)鞣化激素。Taghert(1982a, 1982b)細(xì)胞生物技術(shù)測定煙草天蛾腹部各節(jié)神經(jīng)細(xì)胞中的鞣化激素含量發(fā)現(xiàn),每神經(jīng)節(jié)側(cè)面均有 4 個體積較大的能夠合成和釋放鞣化激素的神經(jīng)細(xì)胞,這被命名為“細(xì)胞 24-27”。在進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)僅“細(xì)胞 27”能合成鞣化激素?zé)煵萏於瓴煌纳L發(fā)育階段表達(dá)量有較大的差異。Luan 等(2006)在蠅的研究中也得到了相似的結(jié)論。昆蟲幼蟲期,鞣化激素只能在腹部神經(jīng) 個“細(xì)胞 27”中發(fā)現(xiàn),而到了蛹期的時候,腹部神經(jīng)節(jié)中能表達(dá)鞣化激素增至 14 個。研究表明,幾乎所有昆蟲的鞣化激素從中樞神經(jīng)系統(tǒng)到血淋放都會經(jīng)歷一個短暫激增的過程。鞣化激素在昆蟲神經(jīng)節(jié)中合成后,由神調(diào)控翅伸展成熟 表皮黑化和成熟對昆蟲免疫系統(tǒng)的影響

長度分布,長度分布,轉(zhuǎn)錄組,組裝質(zhì)量


貴州大學(xué) 2018 屆碩士研究生學(xué)位論文表 2.3 煙蚜轉(zhuǎn)錄組測序序列組裝質(zhì)量Table 2.3 Assembly quality of Myzus persicae transcriptome范(bp)equencelength總數(shù)Totalnumber≥500bp≥1 000bpN50 長度(bp)N50length最大長度(bp)Maximamlength最小長度(bp)Minimumlength總長度(bp)Total length平均度Mlen錄本ranscript145 200 46 464 23 317 1 477 118 446 201 107 804 096 74nigene 128 065 33 844 14 164 855 118 446 201 77 745 381 60

分類圖,分類圖,數(shù)據(jù)庫,煙蚜


圖 2.2 NR 數(shù)據(jù)庫同源物種分類圖Fig. 2.2 Species distribution of homology search of unigenes against the Nr database表 2.4 煙蚜基因注釋結(jié)果統(tǒng)計Table 2.4 Annotation of unigenes of Myzus persicae數(shù)據(jù)庫Database注釋的 unigenes 數(shù)目Number of annotatedunigenes注釋的 unigenes 百分比Percentage of annotatedunigenesCDD 32 823 25.63KOG 27 755 21.67NR 48 403 37.8NT 48 359 37.76PFAM 28 714 22.42Swissprot 39 320 30.7TrEMBL 48 953 38.23GO 40 556 31.67KEGG 19 995 15.61在至少一個數(shù)據(jù)庫中注釋成功

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2803671

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