哈維弧菌T6SS中rbsB、vgrG、hcp基因的表達(dá)及功能分析
【學(xué)位授予單位】:上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S941.4
【圖文】:
4)供能組分:ClpV。ClpV 通過 ATP 酶的水解作用供能,能使分泌蛋白過程,從而在膜融合、蛋白修復(fù)和降解等過程中發(fā)揮重要作用[76]。5)膜聯(lián)蛋白 IcmF:IcmF 是具 ATP 酶活性的結(jié)構(gòu)蛋白,具有三個(gè)跨膜螺參與 Hcp 管道的形成與跨膜轉(zhuǎn)運(yùn),且細(xì)菌 IcmF 缺失株在培養(yǎng)過程中無法檢測(cè)到 Hcp 蛋白[77]。 作用機(jī)制先基底復(fù)合物與 Hcp 管同時(shí)形成,基底復(fù)合物可能由 gp25,VgrG 和其蛋白質(zhì)構(gòu)成,共同跨越內(nèi)外膜與肽聚糖;第二步是外鞘的聚合,VipA/VipB繞 Hcp 管拼裝,裝配好的組件形成一個(gè)“注射器”的結(jié)構(gòu);讖(fù)合物上,導(dǎo)致 VgrG / Hcp 管穿透效應(yīng)細(xì)胞膜向鄰近靶細(xì)胞膜分泌,其他分泌蛋用 Hcp 管作為管道分泌至靶細(xì)胞或胞外環(huán)境;最后,收縮鞘分離且被 Ce 分解,游離的 VipA/B 二聚體再參與新的 T6SS 裝配過程。當(dāng)不錨定相應(yīng),Hcp 和 VgrG 可作為分泌蛋白釋放到胞外。
分泌蛋白參與弧菌毒力調(diào)控并影響毒力強(qiáng)弱;除參與菌間競(jìng)爭(zhēng)外,T6SS 可幫助細(xì)菌適應(yīng)環(huán)境,那是否同時(shí)參與菌間互利共生也是未知的。實(shí)驗(yàn)室前期對(duì)哈維弧菌354進(jìn)行基因組測(cè)序后發(fā)現(xiàn)該菌存在兩套T6SS,分別位于兩條染色體上(如圖1-2),兩套 T6SS 究竟如何行使功能仍有待探究。因此本研究對(duì)位于第二條染色體上編碼T6SS 的兩個(gè)重要結(jié)構(gòu)蛋白 Hcp、VgrG,與分泌蛋白 RbsB 的基因進(jìn)行克隆,研究哈維弧菌在不同培養(yǎng)條件,如溫度、鹽度、pH 等環(huán)境因子脅迫下 3 種基因表達(dá)量的變化,同時(shí)構(gòu)建 T6SS 相關(guān)基因缺失株,探究哈維弧菌 T6SS 功能及作用機(jī)制,為哈維弧菌的防控與治療提供理論基礎(chǔ)。圖 1-2 哈維弧菌 354 T6SS ?
Tab. 2-4 Homology analysis of amino acids of RbsB from V. harveyi 354 strain and othbacterial species菌種 Species同源性%Homology注冊(cè)號(hào)Accession N.o哈維弧菌(V. harveyi ATCC 33843) 100 % AIV07307.1歐文弧菌(V. owensii CAIM 1854) 100 % KIF46393.1氏弧菌(V. campbellii ATCC BAA-1116) 98 % AGU97393.1輪蟲弧菌(V. rotiferianus HM-10) 98 % OHY94262.1藻弧菌(V. alginolyticus ATCC 17749) 97 % GAD69766.1血弧菌(V. parahaemolyticus ATCC 17802) 97 % KKI09273.1需鈉弧菌(V. natriegens ATCC 14048) 97 % EPM40141.1貽貝弧菌(V. mytili CAIM 528) 96 % KIN10841.1創(chuàng)傷弧菌(V. vulnificus ATCC 33147) 92 % KGK71697.1遠(yuǎn)青弧菌(V. azureus NBRC 104587) 92 % GAD74752.1
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2802824
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