小麥RING型E3泛素連接酶基因TaSDIR1克隆與功能分析
【學(xué)位授予單位】:山西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S512.1
【圖文】:
白酶體途徑酶體途徑作為機(jī)體調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)蛋白水平與功能的一個(gè)化的蛋白并將其降解[45]。在泛素蛋白酶體途徑中,細(xì)多余的蛋白質(zhì)進(jìn)行降解,并且同時(shí)會(huì)消耗一部分能量化酶 E1、泛素結(jié)合酶 E2、泛素連接酶 E3、蛋白酶泛素蛋白酶體途徑降解蛋白質(zhì)包括泛素與蛋白底物的的降解兩個(gè)階段[47]。首先泛素活化酶 E1 通過消耗 A物,也就是泛素的活化;活化的泛素與 E2 結(jié)合后與物;接著 E3 會(huì)特異性識(shí)別并結(jié)合一些被修飾過的蛋合物與目標(biāo)蛋白相連接,與此同時(shí)釋放 E2,形成特定白酶體對(duì)底物的降解階段,使泛素化的蛋白質(zhì)被 26S或氨基酸[48](圖 1.1)。
第一章 引言1.4 本研究的目的意義及技術(shù)路線小麥?zhǔn)俏覈?guó)的主要糧食,在保障糧食安全中占有至關(guān)重要的作用,小麥的生長(zhǎng)發(fā)育、代謝過程及最終產(chǎn)量的形成與周圍環(huán)境有著密不可分的關(guān)系。迄今為止,RING 型 E3 泛素連接酶在擬南芥[76]、玉米[77,78]和水稻[79,80]中已有比較深入的研究,而小麥基因組龐大[81,82],對(duì)其研究較為困難,與之相關(guān)報(bào)道較少。本研究通過克隆小麥的 E3 泛素連接酶基因 TaSDIR1,分析基因結(jié)構(gòu)和序列多態(tài)性,通過染色體及遺傳定位分析、關(guān)聯(lián)分析、小麥抽穗期組織特異性表達(dá)分析、不同非生物脅迫條件下基因的表達(dá)模式分析,以及體外泛素化分析等方法研究該基因的功能,開發(fā)分子標(biāo)記,發(fā)掘優(yōu)異單倍型,為小麥株型及產(chǎn)量改良提供理論依據(jù)和技術(shù),同時(shí)也為抗逆育種提供基因資源。具體技術(shù)路線如圖 1.2 所示:
第三章 結(jié)果與分析第三章 結(jié)果與分析3.1 TaSDIR1 功能研究3.1.1 TaSDIR1 序列比對(duì)分析參照擬南芥同源基因 AtSDIR1 (At3g55530)的氨基酸序列,在 URGI 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行比對(duì)分析,在小麥 A 和 D 基因組中分別獲得一個(gè)與其同源性較高的基因序列,分別命名為 TaSDIR1-A 和 TaSDIR1-D。TaSDIR1-A 編碼 280 個(gè)氨基酸序列,TaSDIR1-D 編碼 282 個(gè)氨基酸序列,通過 DNAMAN 軟件比對(duì)這兩個(gè)同源基因的氨基酸序列,TaSDIR1-A 和 TaSDIR1-D 編碼的氨基酸序列一致性高達(dá) 97.14%。與擬南芥、水稻、玉米和煙草等其他物種相比,都具有兩個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域和一個(gè)相對(duì)保守的 RING 結(jié)構(gòu)域(圖 3.1A)。
【參考文獻(xiàn)】
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