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甘肅高山細(xì)毛羊和湖羊HIF-2α基因序列變異特征研究

發(fā)布時(shí)間:2020-08-02 18:37
【摘要】:低氧誘導(dǎo)因子(HIFs)是一種氧依賴(lài)的轉(zhuǎn)錄激活因子,由一個(gè)調(diào)節(jié)表達(dá)的亞基(HIF-α)和一個(gè)持續(xù)表達(dá)的亞基(HIF-β)所構(gòu)成,在細(xì)胞缺氧調(diào)節(jié)過(guò)程中具有重要作用。HIF-2α為HIFs基因家族成員之一,主要與高原土著居民和動(dòng)物適應(yīng)高原低氧環(huán)境密切相關(guān)。為探討HIF-2α基因核苷酸多態(tài)性,以甘肅高山細(xì)毛羊和湖羊?yàn)檠芯繉?duì)象,采用PCR-SSCP技術(shù)和DNA測(cè)序技術(shù)檢測(cè)HIF-2α基因3個(gè)不同區(qū)域(外顯子8,外顯子9,外顯子11)在2個(gè)綿羊群體中的單核苷酸多態(tài)性等分子遺傳特征。主要研究結(jié)果為:(1)甘肅高山細(xì)毛羊和湖羊HIF-2α基因的3個(gè)檢測(cè)區(qū)域共發(fā)現(xiàn)27個(gè)變異位點(diǎn),其中2個(gè)位點(diǎn)為堿基插入,占突變位點(diǎn)的7.4%;20個(gè)位點(diǎn)發(fā)生堿基轉(zhuǎn)換,占突變位點(diǎn)的74.1%;5個(gè)位點(diǎn)發(fā)生堿基顛換,占突變位點(diǎn)的18.5%。兩個(gè)綿羊品種HIF-2α基因的3個(gè)檢測(cè)區(qū)域的多態(tài)性信息含量值均在0.5以上,屬高度多態(tài)。(2)甘肅高山細(xì)毛羊和湖羊HIF-2α基因3個(gè)檢測(cè)區(qū)域的PCR-SSCP檢測(cè)結(jié)果:外顯子8區(qū)域共檢測(cè)出4種等位基因,形成9種基因型;兩個(gè)綿羊群體的優(yōu)勢(shì)等位基因分別為B(60.59%)和A(39.57%),優(yōu)勢(shì)基因型分別為BB(48.00%)和AB(23.56%)。外顯子9區(qū)域共檢測(cè)出5種等位基因,形成8種基因型;兩個(gè)綿羊群體的優(yōu)勢(shì)等位基因均為B,基因頻率分別為61.50%和50.00%,優(yōu)勢(shì)基因型分別為BD(43.00%)和BB(27.79%)。外顯子11區(qū)域共檢測(cè)出4種等位基因,形成10種基因型;兩個(gè)綿羊群體的優(yōu)勢(shì)等位基因分別為A(43.50%)和B(32.15%),優(yōu)勢(shì)基因型均為AB,基因型頻率分別為34.50%和16.47%。(3)HIF-2α基因3個(gè)擴(kuò)增區(qū)域在兩個(gè)綿羊品種中具有豐富的多態(tài)性,且等位基因頻率和基因型在品種間差異顯著,具有生物學(xué)意義。推測(cè)在高原低氧適應(yīng)過(guò)程中,HIF-2α基因可能受到了不同選擇,在長(zhǎng)期的高原低氧環(huán)境中,有利于適應(yīng)高海拔低氧的基因型個(gè)體在高海拔綿羊品種中受到正向選擇,頻率上升;不利于適應(yīng)高海拔低氧的基因型個(gè)體在高海拔綿羊品種中受到負(fù)向選擇,導(dǎo)致等位基因頻率下降。(4)綿羊HIF-2α基因編碼區(qū)外顯子8和9核苷酸序列與山羊同源性最高,與其親緣關(guān)系遠(yuǎn)近一致。綜上所述,綿羊HIF-2α基因在3個(gè)檢測(cè)區(qū)域均高度多態(tài),選育潛力較大,通過(guò)分析該基因在兩個(gè)綿羊群體中的多態(tài)性,可為綿羊適應(yīng)高原低氧環(huán)境候選基因的研究提供基礎(chǔ)資料。
【學(xué)位授予單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:S826

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2778901

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