【摘要】：人參屬(Panax L.)為五加科(Araliaceae)多年生草本植物。分子系統(tǒng)研究結(jié)果表明,人參(Panax ginseng C.A.Mey.)和西洋參(Panax quinquefolius L.)是人參屬中親緣關(guān)系較近的兩個物種。目前對近緣物種的遺傳多樣性研究已廣泛地應(yīng)用于群體遺傳學、分子育種和保護遺傳學中。本文基于單拷貝核基因序列,研究了人參和西洋參的遺傳差異。研究內(nèi)容及結(jié)果如下:(1)人參單拷貝核基因數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建。本研究通過從NCBI數(shù)據(jù)庫中檢索的人參屬EST序列,與擬南芥單拷貝核基因數(shù)據(jù)庫比對,篩選與擬南芥單拷貝核基因數(shù)據(jù)庫相似性較高的序列構(gòu)成擬人參單拷貝序列。運用自行設(shè)計的引物對人參單拷貝核序列進行PCR群體擴增。在此基礎(chǔ)上,利用第二代測序平臺對PCR群體擴增產(chǎn)物測序,序列分析后已成功獲得58個人參單拷貝核基因序列構(gòu)建成人參單拷貝核基因數(shù)據(jù)庫。其中,所開發(fā)的引物可用于人參屬其他物種的單拷貝核基因片段的擴增。(2)人參和西洋參遺傳多樣性分析。運用SNP分子標記對20個人參樣本和10個西洋參樣本16個單拷貝核基因序列進行群體遺傳學分析。通過序列比對分別在人參和西洋參中開發(fā)160個和171個有效的SNP,以SNP數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)統(tǒng)計出人參核基因中單倍型數(shù)量變化從1到12;西洋參核基因的單倍型數(shù)量變化從1到9,且人參和西洋參沒有共享的單倍型。根據(jù)人參和西洋參的多態(tài)性位點結(jié)果分析人參的核苷酸多樣性(πT)變化從0.000到0.023;西洋參中核苷酸多樣性變異為0.005到0.035。人參總核苷酸多樣性0.007,而西洋參總核苷酸多態(tài)性0.017。結(jié)果表明人參屬的兩個物種表現(xiàn)出較高的核苷酸多樣性水平,且西洋參的遺傳多樣性高于人參的遺傳多樣性。近緣物種遺傳多樣性研究有利于為人參和西洋參的種質(zhì)資源保護和分子育種奠定理論基礎(chǔ),開發(fā)的人參單拷貝核基因為后續(xù)的人參系統(tǒng)發(fā)育以及人參的馴化研究提供有效的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
【學位授予單位】：東北師范大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：S567.51;S567.53

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 張丁予;章婷曦;王國祥;;第二代測序技術(shù)的發(fā)展及應(yīng)用[J];環(huán)境科學與技術(shù);2016年09期

2 周龍華;蔣立希;;SNP分子標記及其在甘藍型油菜中應(yīng)用的研究進展[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報;2016年10期

3 杜淑輝;王兆山;保爾江·阿布都哈米提;邢世巖;張建國;;應(yīng)用單拷貝核基因標記研究我國歐洲山楊自然居群的遺傳多樣性[J];林業(yè)科學研究;2016年01期

4 鄧菁;張?zhí)鹛?王迪;金海珠;王洪濤;;利用外轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)對中國人參和西洋參進行分子鑒定[J];食品與生物技術(shù)學報;2015年04期

5 楊燁;劉娟;;第二代測序序列比對方法綜述[J];武漢大學學報(理學版);2012年05期

6 郭秀麗;高淑蓮;;人參化學成分和藥理研究進展[J];中醫(yī)臨床研究;2012年14期

7 岳桂東;高強;羅龍海;王軍一;許姣卉;尹燁;;高通量測序技術(shù)在動植物研究領(lǐng)域中的應(yīng)用[J];中國科學:生命科學;2012年02期

8 劉志文;韓旭;李莉;李憲臻;陳溫福;;葉綠體和線粒體DNA在植物系統(tǒng)發(fā)育中的應(yīng)用研究進展[J];河南農(nóng)業(yè)科學;2008年07期

9 馮夏蓮;何承忠;張志毅;安新民;王冬梅;;植物遺傳多樣性研究方法概述[J];西南林學院學報;2006年01期

10 馬蘭;黃原;;單拷貝核基因在昆蟲分子系統(tǒng)學中的應(yīng)用[J];昆蟲知識;2006年01期

相關(guān)碩士學位論文 前1條

1 史鳳雪;人參屬系統(tǒng)發(fā)育與多倍化研究[D];東北師范大學;2016年

本文編號：2776231