大豆開花調(diào)控基因GmFT1a的克隆和功能研究
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S565.1
【圖文】:
圖 3.6 大豆和其它物種中已知功能的 FT 氨基酸序列比對(duì)蛋白名稱中:綠色陰影表示開花促進(jìn)基因編碼的蛋白質(zhì);紅色陰影代表開花抑制基因編碼的蛋白質(zhì);藍(lán)色框代表External Loop;紅色方框代表 VYN triad;紅色三角形表示 GmFT1a 中可能的差異位點(diǎn)。Figure 3.6: Sequence comparison of known FTs in soybean and other speciesThe protein name with a green or red shadow means it is a flowering-promoting FT or a flowering-inhibiting Frespectively; The blue and red box represent a 14-amino-acid external loop and a 3-amino-acid triad respectively; The retriangles represent the amino acid residues 131, 134 and 135 in GmFT1a which are different from thflowering-promoting FTs in soybean or other species.3.3.2 GmFT1a 的亞細(xì)胞定位3.3.2.1 融合表達(dá)載體 p16318-GmFT1a 的構(gòu)建根據(jù)含有 XbaI, SacI 酶切位點(diǎn)的引物,擴(kuò)增得到含有該酶切位點(diǎn),且不含終止密碼子的GmFT1a 產(chǎn)物,連接 PLB 載體后,通過菌液 PCR 篩選陽性轉(zhuǎn)化子測(cè)序。提取原始質(zhì)粒 p16318 和PLB-GmFT1a,并將二者分別進(jìn)行 XbaI、SacI 雙酶切(圖 3.7 A, B),電泳檢測(cè)后回收 p16318 載
獲得了根部過量表達(dá) GmFT1a 的復(fù)合體植株(圖4.12),將子葉節(jié)下的主根剪下后,將其與對(duì)照組植株共同在短日條件下培養(yǎng)進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖 4.12 復(fù)合體植株的獲得A:子葉節(jié)注射;B:子葉節(jié)處出現(xiàn)瘤狀突起; C:子葉節(jié)處長(zhǎng)出發(fā)狀根后將主根剪去。Figure 4.12 Agrobacterium rhizogenes-mediated hairy root transformationA: The unfolded cotyledons were injected with K599 strain containing 35S::GmFT1a by stabbing at their cotyledonarynode several times with a syringe needle. B: The nodular texture emerging at the stabbing position. C: Removing themain roots after the hairy-roots emergence.4.3.4.2 根部過量表達(dá) GmFT1a 對(duì)植株開花和成熟的影響在植株培養(yǎng)的過程中,我們發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)組中部分材料的開花有所延遲,對(duì)所有植株進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),相比對(duì)照組,當(dāng) GmFT1a 在根部過量表達(dá)時(shí),植株有延遲開花的趨勢(shì)(圖 4.14 A, B)。隨機(jī)選取部分植株取其根部,提取根部 RNA 后反轉(zhuǎn)錄,進(jìn)行 GmFT1a 表達(dá)量的測(cè)定,發(fā)現(xiàn)一部分植株根部 GmFT1a 的表達(dá)量高于對(duì)照,而有一部分植株根部的表達(dá)量并沒有明顯的升高(圖4.13)。
86圖 5.1 樣品之間的 pearson 相關(guān)系數(shù)Figure 5.1 Pearson correlation between samples5.2.3 各轉(zhuǎn)化株系中的差異基因數(shù)目比較為了分析兩個(gè)轉(zhuǎn)化株系表達(dá)譜的變化,對(duì)兩個(gè)轉(zhuǎn)化事件的差異基因的表達(dá)水平(log10(FPKM+1)值),做層次聚類(hierarchical clustering)分析。通過圖 5.2 A 發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)基因植株與野生型植株基因表達(dá)差異較大,而兩個(gè)轉(zhuǎn)化事件相比于野生型,差異基因上調(diào)和下調(diào)的趨勢(shì)相同(圖 5.2A)。轉(zhuǎn)化事件#10 (T10)相比于野生型有 3120 個(gè)差異基因,其中上調(diào)基因 1426 個(gè),下調(diào)基因 1694 個(gè)(圖 5.2 B);而轉(zhuǎn)化事件#9(T46)相比于野生型僅有 670 個(gè)差異基因,其中上調(diào)基因 224 個(gè),下調(diào)基因 446 個(gè)(圖 5.2 C)。韋恩圖顯示,轉(zhuǎn)化事件# 9 的 670 個(gè)差異基因中 90.4%(606 個(gè))的差異基因都包含于 T10 的差異基因中(圖 5.2 D)。
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本文編號(hào):2763790
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